Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 snoU13.26-201ENST00000459452 105 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SF3B2Q13435 Y_RNA.683-201ENST00000516508 93 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SF3B2Q13435 MIR4643-201ENST00000577473 78 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SF3B2Q13435 MIR4423-201ENST00000580922 80 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SF3B2Q13435 AC005176.2-201ENST00000596933 147 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SF3B2Q13435 AL365434.2-201ENST00000607979 234 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SF3B2Q13435 ZNRD1-AS1_3.8-201ENST00000611686 104 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SF3B2Q13435 SLITRK5-201ENST00000325089 21103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
SF3B2Q13435 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SF3B2Q13435 ZNF92-204ENST00000450302 2957 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
SF3B2Q13435 ANKAR-201ENST00000313581 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
SF3B2Q13435 KCNT2-202ENST00000367433 5883 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
SF3B2Q13435 MBNL1-220ENST00000493459 4205 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
SF3B2Q13435 ERBIN-201ENST00000284037 8647 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
SF3B2Q13435 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SF3B2Q13435 RNA5SP252-201ENST00000391131 119 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SF3B2Q13435 U3.39-201ENST00000408569 239 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SF3B2Q13435 AC091133.1-201ENST00000435491 483 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SF3B2Q13435 MTND2P29-201ENST00000438595 412 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SF3B2Q13435 UQCRBP2-201ENST00000447827 297 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SF3B2Q13435 AL392046.1-203ENST00000450106 651 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SF3B2Q13435 NDUFB4P10-201ENST00000452541 359 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SF3B2Q13435 AL138752.1-201ENST00000452964 351 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SF3B2Q13435 AC105389.2-201ENST00000506475 435 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SF3B2Q13435 RNU5F-2P-201ENST00000516066 82 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SF3B2Q13435 MIR3923-201ENST00000579521 83 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SF3B2Q13435 AL357075.2-201ENST00000614906 189 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SF3B2Q13435 ST7-OT4_2.1-201ENST00000619089 172 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SF3B2Q13435 AC127459.3-201ENST00000624328 466 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SF3B2Q13435 MTND5P35-201ENST00000557537 1720 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SF3B2Q13435 AC009975.1-201ENST00000634588 2698 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.73
SF3B2Q13435 TUG1-202ENST00000521091 2110 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
SF3B2Q13435 EVI2A-201ENST00000247270 1860 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
SF3B2Q13435 Y_RNA.83-201ENST00000363005 113 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SF3B2Q13435 SNORD114-19-201ENST00000363072 75 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SF3B2Q13435 Y_RNA.230-201ENST00000364348 109 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SF3B2Q13435 Y_RNA.331-201ENST00000365267 102 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SF3B2Q13435 MIR320B2-201ENST00000408479 138 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SF3B2Q13435 MIR2682-201ENST00000580305 110 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SF3B2Q13435 MZT1P2-201ENST00000604387 248 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SF3B2Q13435 RNU6-91P-201ENST00000607774 107 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SF3B2Q13435 AC092628.2-201ENST00000622492 339 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SF3B2Q13435 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
SF3B2Q13435 OXR1-205ENST00000442977 2956 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
SF3B2Q13435 USP9Y-201ENST00000338981 10036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
SF3B2Q13435 FASTKD1-205ENST00000453929 2791 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SF3B2Q13435 ZNF266-203ENST00000588933 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
SF3B2Q13435 MUC7-202ENST00000413702 2540 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SF3B2Q13435 STEAP4-201ENST00000301959 2321 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
SF3B2Q13435 AL139156.1-201ENST00000412785 841 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SF3B2Q13435 RPL23AP36-201ENST00000413895 458 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SF3B2Q13435 CYCSP48-201ENST00000417124 323 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SF3B2Q13435 LINC01198-202ENST00000458282 558 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SF3B2Q13435 RNU6-625P-201ENST00000459412 107 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SF3B2Q13435 RN7SKP209-201ENST00000516888 304 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SF3B2Q13435 AC024270.4-201ENST00000570202 421 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SF3B2Q13435 AC008749.1-201ENST00000597650 306 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SF3B2Q13435 AL034555.1-201ENST00000604816 211 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SF3B2Q13435 AC004792.1-201ENST00000614523 137 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SF3B2Q13435 AC111000.4-202ENST00000505646 2648 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SF3B2Q13435 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
SF3B2Q13435 SYTL2-230ENST00000634661 6672 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SF3B2Q13435 ZNF804B-202ENST00000611114 3968 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SF3B2Q13435 ZNF680-202ENST00000447137 2159 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SF3B2Q13435 KIAA1524-206ENST00000491772 3877 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
SF3B2Q13435 RNU6-529P-201ENST00000363383 104 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SF3B2Q13435 Y_RNA.199-201ENST00000364014 102 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SF3B2Q13435 Y_RNA.270-201ENST00000364693 104 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SF3B2Q13435 ZBTB26-202ENST00000373656 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
SF3B2Q13435 RNU6-1062P-201ENST00000383908 107 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SF3B2Q13435 RNU6-793P-201ENST00000384233 104 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SF3B2Q13435 RNU6-750P-201ENST00000390946 107 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SF3B2Q13435 Y_RNA.793-201ENST00000411222 111 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SF3B2Q13435 AC096649.2-201ENST00000416186 393 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SF3B2Q13435 AL353705.1-201ENST00000433468 480 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SF3B2Q13435 HMGN2P20-201ENST00000437531 273 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SF3B2Q13435 POLR2KP2-201ENST00000438155 177 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SF3B2Q13435 AL592309.2-201ENST00000444647 607 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
SF3B2Q13435 LNX1-AS1-203ENST00000511989 488 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
SF3B2Q13435 CYCSP23-201ENST00000519781 313 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SF3B2Q13435 AC141273.1-201ENST00000565300 479 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
SF3B2Q13435 AP001178.1-201ENST00000584679 268 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
SF3B2Q13435 PLS1-201ENST00000337777 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
SF3B2Q13435 RMDN2-205ENST00000407257 2280 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
SF3B2Q13435 C6orf10-204ENST00000447241 2148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
SF3B2Q13435 DCUN1D1-201ENST00000292782 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
SF3B2Q13435 BX322639.1-202ENST00000423987 2213 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SF3B2Q13435 OR2L2-203ENST00000642011 4225 ntAPPRIS P1 BASIC4.24□□□□□ -1.73
SF3B2Q13435 CEP57L1-223ENST00000523787 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
SF3B2Q13435 HNRNPC-203ENST00000430246 4501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
SF3B2Q13435 OR9G4-204ENST00000641668 2608 ntAPPRIS P1 BASIC4.24□□□□□ -1.73
SF3B2Q13435 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SF3B2Q13435 AL512633.1-201ENST00000399931 655 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SF3B2Q13435 CBX3P9-201ENST00000402326 552 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SF3B2Q13435 AC105272.1-201ENST00000438604 198 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SF3B2Q13435 RPL23AP3-201ENST00000453844 468 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SF3B2Q13435 AL031183.1-201ENST00000457667 207 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SF3B2Q13435 AC007215.1-201ENST00000464893 276 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SF3B2Q13435 AC083973.1-205ENST00000518994 601 ntTSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
SF3B2Q13435 KLKP1-201ENST00000595979 403 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
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