Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 CYP4A27P-201ENST00000567218 190 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
XRCC4Q13426 MIR4742-201ENST00000581069 85 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
XRCC4Q13426 NDUFV2-AS1-202ENST00000583081 399 ntTSL 5 BASIC0.79□□□□□ -2.28
XRCC4Q13426 AC008751.2-201ENST00000597885 980 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
XRCC4Q13426 AP000240.1-201ENST00000609910 452 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
XRCC4Q13426 AC108706.1-201ENST00000611053 297 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
XRCC4Q13426 AL136221.1-201ENST00000621449 509 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
XRCC4Q13426 AL359697.1-201ENST00000624879 587 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
XRCC4Q13426 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC0.79□□□□□ -2.28
XRCC4Q13426 MT-ATP6-201ENST00000361899 681 ntAPPRIS P1 BASIC0.78□□□□□ -2.28
XRCC4Q13426 Y_RNA.367-201ENST00000365544 101 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
XRCC4Q13426 MIR300-201ENST00000401138 83 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
XRCC4Q13426 RNU6ATAC27P-201ENST00000408289 119 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
XRCC4Q13426 AL117339.3-201ENST00000418733 162 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
XRCC4Q13426 USP9YP12-201ENST00000450481 570 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
XRCC4Q13426 SNRPFP3-201ENST00000457792 225 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
XRCC4Q13426 PLCH1-AS2-201ENST00000472913 408 ntTSL 2 BASIC0.78□□□□□ -2.28
XRCC4Q13426 MTCO3P7-201ENST00000510008 774 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
XRCC4Q13426 RNA5SP384-201ENST00000516615 116 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
XRCC4Q13426 AC009930.1-201ENST00000522330 191 ntTSL 5 BASIC0.78□□□□□ -2.28
XRCC4Q13426 AC011604.1-201ENST00000545978 196 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
XRCC4Q13426 AC009558.1-201ENST00000561174 581 ntTSL 4 BASIC0.78□□□□□ -2.28
XRCC4Q13426 TMF1P1-201ENST00000576058 373 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
XRCC4Q13426 MIR6866-201ENST00000638146 69 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
XRCC4Q13426 AC018630.2-201ENST00000534866 2403 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
XRCC4Q13426 RNU6-552P-201ENST00000362869 119 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
XRCC4Q13426 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
XRCC4Q13426 RPS29P13-201ENST00000402041 169 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
XRCC4Q13426 RNU6-195P-201ENST00000411352 109 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
XRCC4Q13426 C5orf58-201ENST00000421269 406 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC0.77□□□□□ -2.29
XRCC4Q13426 RPL23AP95-201ENST00000426806 265 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
XRCC4Q13426 AC004941.2-201ENST00000427009 228 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
XRCC4Q13426 C1DP4-201ENST00000455429 424 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
XRCC4Q13426 AC136628.3-201ENST00000521868 290 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
XRCC4Q13426 AC100763.1-201ENST00000532735 522 ntTSL 3 BASIC0.77□□□□□ -2.29
XRCC4Q13426 MTND1P8-201ENST00000571424 950 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
XRCC4Q13426 MTATP6P3-201ENST00000581686 676 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
XRCC4Q13426 Z98751.3-201ENST00000604447 521 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
XRCC4Q13426 AC064807.4-201ENST00000607201 407 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
XRCC4Q13426 AL355512.1-202ENST00000607952 209 ntTSL 5 BASIC0.77□□□□□ -2.29
XRCC4Q13426 AC005520.5-201ENST00000613926 164 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
XRCC4Q13426 AL133173.2-201ENST00000614270 90 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
XRCC4Q13426 MIR6788-201ENST00000618842 66 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
XRCC4Q13426 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC0.77□□□□□ -2.29
XRCC4Q13426 SNORA43.4-201ENST00000629559 138 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
XRCC4Q13426 C9orf84-205ENST00000394779 5060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC0.77□□□□□ -2.29
XRCC4Q13426 SLC25A46-204ENST00000504098 2345 ntTSL 5 BASIC0.77□□□□□ -2.29
XRCC4Q13426 TEX15-201ENST00000256246 10110 ntTSL 1 (best) BASIC0.76□□□□□ -2.29
XRCC4Q13426 SEMG1-201ENST00000372781 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.76□□□□□ -2.29
XRCC4Q13426 Y_RNA.504-201ENST00000384481 104 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
XRCC4Q13426 AL354692.1-201ENST00000423044 315 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
XRCC4Q13426 HSFY7P-201ENST00000432672 318 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
XRCC4Q13426 HSFY8P-201ENST00000437934 318 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
XRCC4Q13426 AL121957.1-201ENST00000441532 338 ntTSL 2 BASIC0.76□□□□□ -2.29
XRCC4Q13426 AC104663.1-201ENST00000508555 557 ntTSL 2 BASIC0.76□□□□□ -2.29
XRCC4Q13426 PSMC1P5-201ENST00000512850 177 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
XRCC4Q13426 RNU6-1146P-201ENST00000516282 102 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
XRCC4Q13426 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
XRCC4Q13426 ELOCP32-201ENST00000548625 324 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
XRCC4Q13426 AC090517.1-201ENST00000569307 266 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
XRCC4Q13426 MIR151B-201ENST00000584249 96 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
XRCC4Q13426 MIR548AB-201ENST00000584917 84 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
XRCC4Q13426 AL391834.2-201ENST00000609982 546 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
XRCC4Q13426 TUSC7.1-201ENST00000610969 165 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
XRCC4Q13426 SOX2OT_exon1.1-201ENST00000614902 232 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
XRCC4Q13426 AC010722.1-201ENST00000622595 582 ntTSL 5 BASIC0.76□□□□□ -2.29
XRCC4Q13426 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
XRCC4Q13426 AC106754.1-201ENST00000562632 1513 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
XRCC4Q13426 FABP12-201ENST00000360464 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.75□□□□□ -2.29
XRCC4Q13426 RNU6-1287P-201ENST00000362914 107 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
XRCC4Q13426 Y_RNA.116-201ENST00000363292 103 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
XRCC4Q13426 RNY1P12-201ENST00000364251 105 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
XRCC4Q13426 RNU6-827P-201ENST00000365553 106 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
XRCC4Q13426 RNU6-74P-201ENST00000384235 107 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
XRCC4Q13426 RNU6-1060P-201ENST00000384664 107 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
XRCC4Q13426 MIR608-201ENST00000384820 100 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
XRCC4Q13426 MIR548J-201ENST00000408833 112 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
XRCC4Q13426 RNU2-8P-201ENST00000410727 190 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
XRCC4Q13426 AC006461.1-201ENST00000412637 326 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
XRCC4Q13426 AC106883.1-201ENST00000418805 562 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
XRCC4Q13426 AC063976.4-201ENST00000421971 163 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
XRCC4Q13426 RAB28P5-201ENST00000427490 651 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
XRCC4Q13426 AL031274.1-201ENST00000450334 232 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
XRCC4Q13426 LINC00894-208ENST00000455777 284 ntTSL 2 BASIC0.75□□□□□ -2.29
XRCC4Q13426 HMGN1P12-201ENST00000499125 195 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
XRCC4Q13426 PDCD5P2-201ENST00000507570 312 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
XRCC4Q13426 LYRM7-202ENST00000507584 317 ntTSL 2 BASIC0.75□□□□□ -2.29
XRCC4Q13426 NAF1-205ENST00000509434 385 ntTSL 3 BASIC0.75□□□□□ -2.29
XRCC4Q13426 RNA5SP220-201ENST00000516298 104 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
XRCC4Q13426 SNORA25.17-201ENST00000517184 124 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
XRCC4Q13426 AC093012.1-201ENST00000552999 446 ntTSL 3 BASIC0.75□□□□□ -2.29
XRCC4Q13426 AL137100.2-201ENST00000555786 315 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
XRCC4Q13426 CYP3A137P-201ENST00000562436 69 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
XRCC4Q13426 AC025917.1-202ENST00000566344 635 ntTSL 5 BASIC0.75□□□□□ -2.29
XRCC4Q13426 AC008088.1-201ENST00000580993 280 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
XRCC4Q13426 MIR4775-201ENST00000581168 75 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
XRCC4Q13426 AC064872.1-201ENST00000604823 1072 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
XRCC4Q13426 AC002044.1-201ENST00000606707 158 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
XRCC4Q13426 AC009994.1-201ENST00000606889 253 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
XRCC4Q13426 AC097717.1-249ENST00000608040 401 ntTSL 5 BASIC0.75□□□□□ -2.29
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