Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC8Q13216 AL590632.1-201ENST00000424289 371 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ERCC8Q13216 HMGN2P23-201ENST00000456759 269 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ERCC8Q13216 AL159163.1-201ENST00000507747 600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
ERCC8Q13216 LINC02095-202ENST00000543512 323 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
ERCC8Q13216 AC091544.4-201ENST00000555268 342 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ERCC8Q13216 AC245505.1-201ENST00000556398 224 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ERCC8Q13216 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ERCC8Q13216 AC100830.2-201ENST00000581636 240 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ERCC8Q13216 AC010928.2-201ENST00000588017 287 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ERCC8Q13216 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ERCC8Q13216 AC146944.4-201ENST00000602697 718 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ERCC8Q13216 MIR3976-201ENST00000606807 139 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ERCC8Q13216 AL357054.2-201ENST00000607644 423 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
ERCC8Q13216 MIR8081-201ENST00000611533 95 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ERCC8Q13216 AC099654.12-201ENST00000639868 649 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ERCC8Q13216 ANKRD36-208ENST00000639751 3090 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
ERCC8Q13216 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC1.26□□□□□ -2.21
ERCC8Q13216 Y_RNA.373-201ENST00000365600 103 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
ERCC8Q13216 RNU6-214P-201ENST00000384130 107 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
ERCC8Q13216 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
ERCC8Q13216 MIR521-1-201ENST00000384902 87 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
ERCC8Q13216 RNA5SP494-201ENST00000410653 129 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
ERCC8Q13216 AL500522.1-201ENST00000423667 318 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
ERCC8Q13216 HMGB1P18-201ENST00000438801 619 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
ERCC8Q13216 RPS23P5-201ENST00000495419 428 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
ERCC8Q13216 RNU6-506P-201ENST00000516553 94 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
ERCC8Q13216 SNORA44.1-201ENST00000517031 108 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
ERCC8Q13216 AC016256.1-201ENST00000547971 354 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
ERCC8Q13216 AC009269.4-201ENST00000557828 440 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
ERCC8Q13216 AL133215.3-201ENST00000609801 448 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
ERCC8Q13216 RMST_6.1-201ENST00000611980 203 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
ERCC8Q13216 DISC2.1-201ENST00000612827 205 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
ERCC8Q13216 ST7-OT4_2.1-201ENST00000619089 172 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
ERCC8Q13216 LINC01515-217ENST00000620859 694 ntTSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
ERCC8Q13216 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
ERCC8Q13216 AC068205.3-201ENST00000636385 468 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
ERCC8Q13216 CYLC2-204ENST00000612124 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.26□□□□□ -2.21
ERCC8Q13216 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ERCC8Q13216 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ERCC8Q13216 RNU6-968P-201ENST00000384076 107 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ERCC8Q13216 RNU6-296P-201ENST00000384608 107 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ERCC8Q13216 RNU6-997P-201ENST00000384725 107 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ERCC8Q13216 AL590002.1-201ENST00000406554 418 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ERCC8Q13216 AL360091.2-201ENST00000446847 650 ntTSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
ERCC8Q13216 TRBV12-1-201ENST00000479785 344 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ERCC8Q13216 RPS29P21-201ENST00000496272 170 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ERCC8Q13216 MTCO1P29-201ENST00000496868 288 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ERCC8Q13216 AC110799.1-201ENST00000509098 449 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
ERCC8Q13216 AC096745.1-201ENST00000509945 370 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ERCC8Q13216 RNU6-314P-201ENST00000516574 104 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ERCC8Q13216 AP001001.1-201ENST00000532422 826 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
ERCC8Q13216 AC011092.2-201ENST00000533659 586 ntTSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
ERCC8Q13216 AC026371.1-201ENST00000551867 419 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ERCC8Q13216 ZNF519P2-201ENST00000557032 169 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ERCC8Q13216 LINC01900-203ENST00000585185 393 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
ERCC8Q13216 HTN1-205ENST00000610341 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
ERCC8Q13216 MIR8076-201ENST00000611401 83 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ERCC8Q13216 TP73-AS1.1-201ENST00000611447 161 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ERCC8Q13216 AC093783.1-201ENST00000612976 329 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ERCC8Q13216 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ERCC8Q13216 MESTIT1_1.1-201ENST00000618871 140 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ERCC8Q13216 MPP6-209ENST00000625307 126 ntTSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
ERCC8Q13216 MIR1321-201ENST00000637766 79 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ERCC8Q13216 SKIL-202ENST00000413427 2702 ntTSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
ERCC8Q13216 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ERCC8Q13216 FGF7-202ENST00000560270 1688 ntTSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
ERCC8Q13216 MIR424-201ENST00000362227 98 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ERCC8Q13216 RNU6-562P-201ENST00000362731 107 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ERCC8Q13216 SNORD50.1-201ENST00000362987 71 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ERCC8Q13216 Y_RNA.151-201ENST00000363566 112 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ERCC8Q13216 Y_RNA.318-201ENST00000365131 97 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
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ERCC8Q13216 BTLA-202ENST00000383680 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
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ERCC8Q13216 RNU6-418P-201ENST00000384035 107 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ERCC8Q13216 RNU6-784P-201ENST00000384330 106 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ERCC8Q13216 Y_RNA.554-201ENST00000384672 102 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ERCC8Q13216 RNU6-95P-201ENST00000384697 107 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ERCC8Q13216 RNU4-26P-201ENST00000410270 107 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ERCC8Q13216 RN7SKP192-201ENST00000411291 327 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ERCC8Q13216 RPS26P42-201ENST00000413485 326 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ERCC8Q13216 SNRPEP10-201ENST00000420249 274 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ERCC8Q13216 AC005482.1-201ENST00000420758 575 ntTSL 4 BASIC1.24□□□□□ -2.21
ERCC8Q13216 NDUFA5P4-201ENST00000436704 385 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ERCC8Q13216 MTCO3P18-201ENST00000440206 761 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ERCC8Q13216 AL138799.4-201ENST00000443939 643 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
ERCC8Q13216 MTCO3P8-201ENST00000453691 755 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ERCC8Q13216 MTND1P11-201ENST00000456661 876 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ERCC8Q13216 AC005908.1-201ENST00000468701 347 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ERCC8Q13216 AC096736.2-201ENST00000507972 175 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
ERCC8Q13216 RNA5SP182-201ENST00000516064 82 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ERCC8Q13216 RNU6-970P-201ENST00000516312 107 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ERCC8Q13216 AC090592.1-203ENST00000533942 575 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
ERCC8Q13216 AC092490.2-202ENST00000544922 462 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
ERCC8Q13216 AC009754.1-201ENST00000566282 540 ntTSL 4 BASIC1.24□□□□□ -2.21
ERCC8Q13216 FGF7P1-201ENST00000582820 288 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ERCC8Q13216 AC009318.2-201ENST00000610917 651 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ERCC8Q13216 AC083806.3-201ENST00000614016 455 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ERCC8Q13216 AC015540.1-201ENST00000615828 501 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ERCC8Q13216 AC005562.2-201ENST00000618264 111 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
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