Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 PHTF2-202ENST00000275575 4541 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
DUSP4Q13115 KCNT2-202ENST00000367433 5883 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
DUSP4Q13115 LRMP-221ENST00000636465 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.84
DUSP4Q13115 OFD1P6Y-202ENST00000451061 2724 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
DUSP4Q13115 KCNH7-204ENST00000618399 3713 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
DUSP4Q13115 RAPGEF6-210ENST00000512052 3535 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
DUSP4Q13115 Z83843.1-201ENST00000604070 3685 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
DUSP4Q13115 RNU6-1272P-201ENST00000362776 107 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
DUSP4Q13115 RNU1-18P-201ENST00000363062 164 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
DUSP4Q13115 RNU6-818P-201ENST00000364837 108 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
DUSP4Q13115 RNU6-793P-201ENST00000384233 104 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
DUSP4Q13115 RNU6-131P-201ENST00000391144 107 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
DUSP4Q13115 RPS26P42-201ENST00000413485 326 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
DUSP4Q13115 BPY2DP-201ENST00000422208 265 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
DUSP4Q13115 RPS29P31-201ENST00000446147 164 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
DUSP4Q13115 AC115115.1-201ENST00000449927 248 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
DUSP4Q13115 AC034223.1-201ENST00000511054 599 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
DUSP4Q13115 AC006199.1-201ENST00000548728 219 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
DUSP4Q13115 POC1B-211ENST00000549504 581 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
DUSP4Q13115 AL162713.1-201ENST00000604480 262 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
DUSP4Q13115 SMAD5-AS1_2.1-201ENST00000617906 131 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
DUSP4Q13115 hsa-mir-4776-1.1-201ENST00000636364 80 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
DUSP4Q13115 XRCC4-203ENST00000396027 1530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
DUSP4Q13115 AL356274.2-201ENST00000624379 3752 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
DUSP4Q13115 SYNE2-202ENST00000344113 21777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
DUSP4Q13115 IL33-203ENST00000456383 2501 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
DUSP4Q13115 BIRC3-201ENST00000263464 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
DUSP4Q13115 OR9K2-202ENST00000641329 3120 ntAPPRIS P1 BASIC3.57□□□□□ -1.84
DUSP4Q13115 RAD17-202ENST00000305138 3164 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
DUSP4Q13115 RNA5SP295-201ENST00000362655 121 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
DUSP4Q13115 GPRC6A-202ENST00000368549 2622 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
DUSP4Q13115 AC097662.1-205ENST00000433324 241 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
DUSP4Q13115 RNU5F-8P-201ENST00000515941 111 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
DUSP4Q13115 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
DUSP4Q13115 CRISPLD1-205ENST00000523524 2100 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
DUSP4Q13115 SLC16A7-201ENST00000261187 11777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
DUSP4Q13115 MYSM1-203ENST00000472487 7785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
DUSP4Q13115 MME-211ENST00000492661 2854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
DUSP4Q13115 HERC5-203ENST00000508159 2243 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
DUSP4Q13115 AC099654.7-201ENST00000635788 2127 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
DUSP4Q13115 N4BP2L2-205ENST00000446957 2071 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
DUSP4Q13115 IBTK-209ENST00000510291 4109 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
DUSP4Q13115 KIAA1524-206ENST00000491772 3877 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
DUSP4Q13115 ADGRG2-206ENST00000360279 4702 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
DUSP4Q13115 IL1RL1-204ENST00000409584 2693 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
DUSP4Q13115 LIG4-205ENST00000614526 3884 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
DUSP4Q13115 Y_RNA.412-201ENST00000384001 104 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
DUSP4Q13115 RNU6-1117P-201ENST00000384525 104 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
DUSP4Q13115 AL133475.1-201ENST00000404414 305 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
DUSP4Q13115 RNA5SP38-201ENST00000410750 119 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
DUSP4Q13115 MAGEA8-AS1-201ENST00000427671 476 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
DUSP4Q13115 AL357552.1-201ENST00000445254 415 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
DUSP4Q13115 AC010099.1-201ENST00000455434 375 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
DUSP4Q13115 AC117394.2-201ENST00000487827 323 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
DUSP4Q13115 AC009320.1-201ENST00000549070 349 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
DUSP4Q13115 MIR5680-201ENST00000577577 84 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
DUSP4Q13115 HMGN2P15-201ENST00000585707 270 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
DUSP4Q13115 TEX41-243ENST00000614173 190 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
DUSP4Q13115 5S_rRNA.12-201ENST00000617631 107 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
DUSP4Q13115 MIR8057-201ENST00000620957 69 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
DUSP4Q13115 ZEB2_AS1_1.1-201ENST00000621504 128 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
DUSP4Q13115 AC244205.2-202ENST00000635781 342 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
DUSP4Q13115 SNORD98-201ENST00000636377 67 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
DUSP4Q13115 CNOT6L-201ENST00000504123 8843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
DUSP4Q13115 PMS1-215ENST00000447232 2576 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
DUSP4Q13115 SHOC2-201ENST00000265277 3691 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
DUSP4Q13115 AL136164.4-201ENST00000625013 2135 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
DUSP4Q13115 BCLAF1-213ENST00000530767 4186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
DUSP4Q13115 RNU6-1290P-201ENST00000362957 109 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
DUSP4Q13115 Y_RNA.497-201ENST00000384447 98 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
DUSP4Q13115 MIR591-201ENST00000385290 95 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
DUSP4Q13115 SNORA48.2-201ENST00000390926 124 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
DUSP4Q13115 Y_RNA.580-201ENST00000391004 95 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
DUSP4Q13115 EI24P2-201ENST00000397776 1076 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
DUSP4Q13115 MIR208B-201ENST00000401172 77 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
DUSP4Q13115 RNU2-51P-201ENST00000410708 197 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
DUSP4Q13115 AC090952.1-201ENST00000424242 446 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
DUSP4Q13115 SEPT7P4-201ENST00000437076 306 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
DUSP4Q13115 AL714022.1-201ENST00000439897 151 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
DUSP4Q13115 Z75741.1-201ENST00000446793 314 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
DUSP4Q13115 AL365295.1-201ENST00000454942 514 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
DUSP4Q13115 AC007215.1-201ENST00000464893 276 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
DUSP4Q13115 AC004917.1-201ENST00000490856 575 ntTSL 4 BASIC3.55□□□□□ -1.84
DUSP4Q13115 AC103879.1-201ENST00000503093 255 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
DUSP4Q13115 RNA5SP272-201ENST00000516095 111 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
DUSP4Q13115 SCARNA13-201ENST00000516672 275 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
DUSP4Q13115 AP000867.2-201ENST00000532468 320 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
DUSP4Q13115 AC005000.2-201ENST00000605468 310 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
DUSP4Q13115 AC022149.2-201ENST00000621061 203 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
DUSP4Q13115 AC006111.3-201ENST00000622137 383 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
DUSP4Q13115 MTND1P7-201ENST00000632801 297 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
DUSP4Q13115 hsa-mir-548d-1.1-201ENST00000636914 97 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
DUSP4Q13115 CEP170P1-201ENST00000502249 4587 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
DUSP4Q13115 KIAA1841-202ENST00000356719 2149 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
DUSP4Q13115 TUG1-202ENST00000521091 2110 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
DUSP4Q13115 WDFY3-AS2-202ENST00000451762 5814 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
DUSP4Q13115 ZNF439-201ENST00000304030 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
DUSP4Q13115 CCDC168-201ENST00000322527 21466 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
DUSP4Q13115 ADGRL4-201ENST00000370742 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
DUSP4Q13115 Y_RNA.238-201ENST00000364441 102 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
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