Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 MIR5690-201ENST00000583739 73 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
GRIK2Q13002 AL450472.1-202ENST00000637286 180 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
GRIK2Q13002 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
GRIK2Q13002 RNU1-72P-201ENST00000362976 153 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
GRIK2Q13002 Y_RNA.80-201ENST00000362996 102 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
GRIK2Q13002 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
GRIK2Q13002 Y_RNA.148-201ENST00000363557 117 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
GRIK2Q13002 RNY3P11-201ENST00000364153 102 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
GRIK2Q13002 RNU6-142P-201ENST00000384019 107 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
GRIK2Q13002 RNU6-574P-201ENST00000384265 107 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
GRIK2Q13002 Y_RNA.485-201ENST00000384395 102 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
GRIK2Q13002 AC007064.1-201ENST00000412238 351 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
GRIK2Q13002 AC093151.3-203ENST00000422305 514 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
GRIK2Q13002 DPH3P2-201ENST00000422618 250 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
GRIK2Q13002 MRPS18CP6-201ENST00000423587 223 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
GRIK2Q13002 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
GRIK2Q13002 AC093083.1-201ENST00000438633 347 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
GRIK2Q13002 AC104389.3-201ENST00000445629 235 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
GRIK2Q13002 AC117394.2-201ENST00000487827 323 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
GRIK2Q13002 AC109927.1-202ENST00000511951 282 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
GRIK2Q13002 LINC01256-201ENST00000513270 508 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
GRIK2Q13002 SCARNA16.2-201ENST00000516520 172 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
GRIK2Q13002 AC109446.1-201ENST00000566172 220 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
GRIK2Q13002 AC105245.1-201ENST00000581934 244 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
GRIK2Q13002 AL078605.1-201ENST00000603529 500 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
GRIK2Q13002 SNORD98-201ENST00000636377 67 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
GRIK2Q13002 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
GRIK2Q13002 CEP57L1-223ENST00000523787 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
GRIK2Q13002 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
GRIK2Q13002 QSER1-204ENST00000527788 5052 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
GRIK2Q13002 GLMN-201ENST00000370360 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
GRIK2Q13002 Y_RNA.146-201ENST00000363549 102 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
GRIK2Q13002 RNU6-596P-201ENST00000365395 98 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
GRIK2Q13002 SNORA29-201ENST00000384183 140 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
GRIK2Q13002 Y_RNA.533-201ENST00000384596 114 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
GRIK2Q13002 MIR606-201ENST00000384851 96 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
GRIK2Q13002 MIR559-201ENST00000385188 96 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
GRIK2Q13002 AL591034.2-201ENST00000402839 359 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
GRIK2Q13002 MIR1289-2-201ENST00000408360 111 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
GRIK2Q13002 AC236972.2-201ENST00000434979 310 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
GRIK2Q13002 AC080013.2-201ENST00000460866 323 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
GRIK2Q13002 AL163540.1-201ENST00000485382 386 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
GRIK2Q13002 AC022447.4-201ENST00000504053 364 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
GRIK2Q13002 RNU6-327P-201ENST00000516270 127 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
GRIK2Q13002 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
GRIK2Q13002 AC092070.3-201ENST00000596041 337 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
GRIK2Q13002 AC090517.3-201ENST00000625170 141 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
GRIK2Q13002 AC134503.1-201ENST00000633048 54 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
GRIK2Q13002 AC233981.2-201ENST00000611524 1614 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
GRIK2Q13002 ZNF72P-201ENST00000425869 1908 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
GRIK2Q13002 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
GRIK2Q13002 AC092268.1-201ENST00000342691 405 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
GRIK2Q13002 RNU6-1115P-201ENST00000362490 106 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
GRIK2Q13002 SNORA41-201ENST00000384675 132 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
GRIK2Q13002 AL590004.1-201ENST00000405321 300 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
GRIK2Q13002 LINC00428-201ENST00000415620 227 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
GRIK2Q13002 EIF1AXP1-201ENST00000419267 435 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
GRIK2Q13002 MTCO2P27-201ENST00000420740 428 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
GRIK2Q13002 GHRL-208ENST00000439975 326 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
GRIK2Q13002 AL137792.2-201ENST00000443484 235 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
GRIK2Q13002 IFNA11P-201ENST00000446352 526 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
GRIK2Q13002 AL354949.1-201ENST00000446438 170 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
GRIK2Q13002 Y_RNA.653-201ENST00000459091 95 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
GRIK2Q13002 Y_RNA.631-201ENST00000459607 101 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
GRIK2Q13002 AC063944.1-201ENST00000496943 295 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
GRIK2Q13002 LINC02118-202ENST00000510583 419 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
GRIK2Q13002 RNA5SP281-201ENST00000516504 135 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
GRIK2Q13002 AC021269.2-201ENST00000532318 330 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
GRIK2Q13002 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
GRIK2Q13002 LINC02386-203ENST00000552182 501 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
GRIK2Q13002 MIR5571-201ENST00000577998 113 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
GRIK2Q13002 AL713866.2-201ENST00000603579 219 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
GRIK2Q13002 AC016925.2-201ENST00000605108 242 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
GRIK2Q13002 ZNRD1-AS1_2.5-201ENST00000614729 76 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
GRIK2Q13002 HMGB1P24-202ENST00000615653 685 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
GRIK2Q13002 MIR5739-201ENST00000619803 80 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
GRIK2Q13002 AC007336.1-201ENST00000576365 3828 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
GRIK2Q13002 MTND5P9-201ENST00000503854 1755 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
GRIK2Q13002 XRCC4-202ENST00000338635 1579 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.02
GRIK2Q13002 AP000560.1-201ENST00000624150 1937 ntBASIC2.4□□□□□ -2.02
GRIK2Q13002 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
GRIK2Q13002 RNU4-15P-201ENST00000362613 141 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
GRIK2Q13002 RNU6-1286P-201ENST00000383871 107 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
GRIK2Q13002 RNU6-968P-201ENST00000384076 107 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
GRIK2Q13002 MIR764-201ENST00000390811 85 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
GRIK2Q13002 MAMDC2-AS1-203ENST00000420573 339 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
GRIK2Q13002 EIF4EP2-201ENST00000422816 654 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
GRIK2Q13002 AL353997.1-201ENST00000432936 108 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
GRIK2Q13002 LINC01549-201ENST00000440664 714 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
GRIK2Q13002 CHEK2P4-201ENST00000450340 246 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
GRIK2Q13002 AC079354.2-201ENST00000453523 154 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
GRIK2Q13002 ELOCP24-201ENST00000456370 334 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
GRIK2Q13002 AC004917.1-201ENST00000490856 575 ntTSL 4 BASIC2.4□□□□□ -2.03
GRIK2Q13002 RPL23AP75-201ENST00000491601 451 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
GRIK2Q13002 AC021146.2-201ENST00000504736 556 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
GRIK2Q13002 LNX1-AS1-203ENST00000511989 488 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
GRIK2Q13002 SNORA31.11-201ENST00000516528 139 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
GRIK2Q13002 AC021231.3-201ENST00000558497 370 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
GRIK2Q13002 DEFB122-202ENST00000569013 197 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
GRIK2Q13002 AC002558.3-201ENST00000574021 401 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.5 ms