Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 RPS23P5-201ENST00000495419 428 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PTP4A2Q12974 RNA5SP281-201ENST00000516504 135 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PTP4A2Q12974 AP003174.2-201ENST00000544663 294 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
PTP4A2Q12974 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
PTP4A2Q12974 DISC1FP1-204ENST00000563681 466 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
PTP4A2Q12974 AL031274.2-201ENST00000599419 203 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PTP4A2Q12974 SNRPGP20-201ENST00000604477 205 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PTP4A2Q12974 AL355512.1-202ENST00000607952 209 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
PTP4A2Q12974 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PTP4A2Q12974 MIR449A-201ENST00000362113 91 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PTP4A2Q12974 MIRLET7G-201ENST00000362280 84 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PTP4A2Q12974 Y_RNA.48-201ENST00000362710 103 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PTP4A2Q12974 RNU6-595P-201ENST00000363944 107 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PTP4A2Q12974 Y_RNA.356-201ENST00000365475 113 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PTP4A2Q12974 RNU6-438P-201ENST00000365561 103 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PTP4A2Q12974 RNU6-1026P-201ENST00000384465 108 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PTP4A2Q12974 RNU2-48P-201ENST00000410694 191 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PTP4A2Q12974 RNU2-41P-201ENST00000410991 178 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PTP4A2Q12974 AC027124.2-201ENST00000428249 105 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PTP4A2Q12974 SMG7-AS1-202ENST00000432837 466 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
PTP4A2Q12974 TRBV25OR9-2-201ENST00000438417 374 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PTP4A2Q12974 PRELID3BP1-201ENST00000457142 540 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PTP4A2Q12974 RNU6-559P-201ENST00000516151 98 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PTP4A2Q12974 RNA5SP54-201ENST00000516951 92 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PTP4A2Q12974 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PTP4A2Q12974 CBX3P8-201ENST00000532412 525 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PTP4A2Q12974 AP001363.1-201ENST00000544108 264 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
PTP4A2Q12974 AC022469.2-201ENST00000554759 396 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
PTP4A2Q12974 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PTP4A2Q12974 AC022035.1-201ENST00000579923 302 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
PTP4A2Q12974 AL158827.2-201ENST00000602494 330 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PTP4A2Q12974 AC009831.4-201ENST00000620744 325 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PTP4A2Q12974 AL691447.3-201ENST00000635020 330 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PTP4A2Q12974 IGHVIII-44-202ENST00000636235 289 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PTP4A2Q12974 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PTP4A2Q12974 Y_RNA.387-201ENST00000383918 102 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PTP4A2Q12974 RNU6-1297P-201ENST00000384415 104 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PTP4A2Q12974 MIR221-201ENST00000385135 110 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PTP4A2Q12974 RNU6-700P-201ENST00000391043 107 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PTP4A2Q12974 LINC01344-201ENST00000420760 261 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
PTP4A2Q12974 Z82188.1-201ENST00000436709 154 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PTP4A2Q12974 AL035666.1-201ENST00000446195 348 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PTP4A2Q12974 LINC01755-201ENST00000455010 453 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
PTP4A2Q12974 ANXA2P1-201ENST00000505539 926 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PTP4A2Q12974 AC093303.1-201ENST00000514549 295 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PTP4A2Q12974 RNU6-507P-201ENST00000516045 100 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PTP4A2Q12974 RNA5SP137-201ENST00000516833 135 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PTP4A2Q12974 PRELID2P1-201ENST00000552837 301 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PTP4A2Q12974 MIR5002-201ENST00000584713 97 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PTP4A2Q12974 AC010928.2-201ENST00000588017 287 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PTP4A2Q12974 RNU6ATAC35P-201ENST00000609276 444 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PTP4A2Q12974 AC133104.2-201ENST00000615272 193 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PTP4A2Q12974 AC005562.2-201ENST00000618264 111 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PTP4A2Q12974 AL669831.3-213ENST00000636676 183 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PTP4A2Q12974 MIR1302-1-201ENST00000637932 143 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PTP4A2Q12974 E2F5-208ENST00000521429 1551 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
PTP4A2Q12974 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
PTP4A2Q12974 Y_RNA.263-201ENST00000364659 114 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PTP4A2Q12974 SNORA18.2-201ENST00000383865 132 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PTP4A2Q12974 SNORA40.19-201ENST00000390846 128 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PTP4A2Q12974 RNU4-14P-201ENST00000410858 122 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PTP4A2Q12974 RNA5SP508-201ENST00000411327 119 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PTP4A2Q12974 MS4A4E-203ENST00000425663 350 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
PTP4A2Q12974 LINC02532-205ENST00000430094 628 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
PTP4A2Q12974 HMGN2P18-201ENST00000450680 270 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PTP4A2Q12974 RNU7-14P-201ENST00000459331 62 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PTP4A2Q12974 AC007215.1-201ENST00000464893 276 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PTP4A2Q12974 RN7SL429P-201ENST00000479090 223 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PTP4A2Q12974 RN7SL489P-201ENST00000486185 223 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PTP4A2Q12974 RN7SL327P-201ENST00000488659 223 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PTP4A2Q12974 AC093259.1-201ENST00000509755 300 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PTP4A2Q12974 AC096711.2-201ENST00000510592 454 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
PTP4A2Q12974 RNU6-991P-201ENST00000516168 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PTP4A2Q12974 RNU6-1098P-201ENST00000516772 96 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PTP4A2Q12974 Y_RNA.706-201ENST00000516933 99 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PTP4A2Q12974 AC025871.1-202ENST00000518819 432 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
PTP4A2Q12974 ANP32BP3-201ENST00000559213 706 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PTP4A2Q12974 PTP4A1-204ENST00000578299 135 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
PTP4A2Q12974 ZNF667-AS1-209ENST00000601875 495 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
PTP4A2Q12974 AC016727.2-201ENST00000603988 621 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PTP4A2Q12974 AC100812.1-201ENST00000607622 580 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PTP4A2Q12974 TCL6_2.1-201ENST00000615162 119 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PTP4A2Q12974 Y_RNA.804-201ENST00000615262 101 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PTP4A2Q12974 AC245884.12-201ENST00000615364 59 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PTP4A2Q12974 RN7SL853P-201ENST00000617250 223 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PTP4A2Q12974 AL359757.2-201ENST00000624309 274 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PTP4A2Q12974 AL359697.1-201ENST00000624879 587 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PTP4A2Q12974 AC009487.4-201ENST00000624969 3585 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PTP4A2Q12974 ZNF404-202ENST00000587539 1851 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
PTP4A2Q12974 AGTPBP1-205ENST00000376083 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
PTP4A2Q12974 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.04
PTP4A2Q12974 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PTP4A2Q12974 Y_RNA.474-201ENST00000384341 102 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PTP4A2Q12974 SNORA12.2-201ENST00000391040 156 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PTP4A2Q12974 SNORA48.3-201ENST00000391081 134 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PTP4A2Q12974 RPL30P10-201ENST00000488148 337 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PTP4A2Q12974 LINC02233-201ENST00000513718 358 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
PTP4A2Q12974 RNU2-44P-201ENST00000516795 194 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PTP4A2Q12974 RNU6-264P-201ENST00000517134 104 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PTP4A2Q12974 AC134698.4-201ENST00000523451 826 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
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