Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 MTCO3P9-201ENST00000506989 781 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
BPTFQ12830 AC093259.1-201ENST00000509755 300 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
BPTFQ12830 RNU6-803P-201ENST00000516034 102 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
BPTFQ12830 RNU6-917P-201ENST00000516294 104 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
BPTFQ12830 AC106038.2-201ENST00000520706 568 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
BPTFQ12830 SNHG14-219ENST00000553134 470 ntTSL 2 BASIC-0.5□□□□□ -2.49
BPTFQ12830 AC239868.4-201ENST00000608318 671 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
BPTFQ12830 AL359697.1-201ENST00000624879 587 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
BPTFQ12830 MTND4P5-201ENST00000435821 1374 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
BPTFQ12830 MIR103A2-201ENST00000362154 78 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
BPTFQ12830 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
BPTFQ12830 RNU6-921P-201ENST00000384361 107 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
BPTFQ12830 MDM2-208ENST00000393410 732 ntTSL 1 (best) BASIC-0.51□□□□□ -2.49
BPTFQ12830 MDM2-210ENST00000393413 657 ntTSL 1 (best) BASIC-0.51□□□□□ -2.49
BPTFQ12830 MDM2-221ENST00000517852 393 ntTSL 1 (best) BASIC-0.51□□□□□ -2.49
BPTFQ12830 MDM2-233ENST00000545204 398 ntTSL 5 BASIC-0.51□□□□□ -2.49
BPTFQ12830 AC011195.1-201ENST00000578177 177 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
BPTFQ12830 AC099811.4-201ENST00000592536 496 ntTSL 2 BASIC-0.51□□□□□ -2.49
BPTFQ12830 EVI2B-201ENST00000330927 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.51□□□□□ -2.49
BPTFQ12830 AL132875.2-201ENST00000436418 325 ntTSL 5 BASIC-0.51□□□□□ -2.49
BPTFQ12830 RNU7-165P-201ENST00000458864 60 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
BPTFQ12830 snoU13.27-201ENST00000459278 104 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
BPTFQ12830 SNORA27.4-201ENST00000516650 95 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
BPTFQ12830 ZNF519P3-201ENST00000557158 1032 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
BPTFQ12830 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
BPTFQ12830 AC069114.1-201ENST00000580927 287 ntTSL 2 BASIC-0.51□□□□□ -2.49
BPTFQ12830 AC024940.5-201ENST00000622889 474 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
BPTFQ12830 AP000676.3-201ENST00000623299 569 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
BPTFQ12830 RNU6-778P-201ENST00000363269 103 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
BPTFQ12830 CBX3P9-201ENST00000402326 552 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
BPTFQ12830 SSR1P2-201ENST00000415208 787 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
BPTFQ12830 LINC02032-201ENST00000490465 391 ntTSL 2 BASIC-0.51□□□□□ -2.49
BPTFQ12830 AC010261.1-201ENST00000514411 457 ntTSL 5 BASIC-0.51□□□□□ -2.49
BPTFQ12830 RNA5SP481-201ENST00000516814 122 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
BPTFQ12830 AC134698.4-201ENST00000523451 826 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
BPTFQ12830 AL354864.1-201ENST00000373226 539 ntTSL 2 BASIC-0.52□□□□□ -2.49
BPTFQ12830 SNORA75.6-201ENST00000391318 127 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
BPTFQ12830 RNU6-202P-201ENST00000515998 96 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
BPTFQ12830 AC107952.2-201ENST00000606048 486 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
BPTFQ12830 AC135803.1-201ENST00000608748 565 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
BPTFQ12830 AC117490.2-201ENST00000610042 594 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
BPTFQ12830 SNORD105-201ENST00000386910 85 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
BPTFQ12830 RNU6-1176P-201ENST00000390955 107 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
BPTFQ12830 MTND2P5-201ENST00000432656 1006 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
BPTFQ12830 MTATP6P16-201ENST00000434543 526 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
BPTFQ12830 AC116563.1-201ENST00000505454 396 ntTSL 3 BASIC-0.52□□□□□ -2.49
BPTFQ12830 LINC02061-201ENST00000514225 335 ntTSL 3 BASIC-0.52□□□□□ -2.49
BPTFQ12830 AC005176.2-201ENST00000596933 147 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
BPTFQ12830 PRELID3BP2-201ENST00000605362 201 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
BPTFQ12830 AL603839.4-201ENST00000624658 1005 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
BPTFQ12830 SNORD114-14-201ENST00000362723 75 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
BPTFQ12830 Y_RNA.56-201ENST00000362798 112 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
BPTFQ12830 RNU6-650P-201ENST00000365658 111 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
BPTFQ12830 AL603865.2-201ENST00000401679 213 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
BPTFQ12830 HMGB1P28-201ENST00000507778 552 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
BPTFQ12830 RNU6-540P-201ENST00000384622 101 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
BPTFQ12830 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
BPTFQ12830 AL139396.1-201ENST00000421137 167 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
BPTFQ12830 AL953862.1-201ENST00000423016 168 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
BPTFQ12830 TMSB4XP1-201ENST00000424567 135 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
BPTFQ12830 AL157387.1-201ENST00000436077 335 ntTSL 2 BASIC-0.53□□□□□ -2.49
BPTFQ12830 AL358075.2-201ENST00000452785 339 ntTSL 2 BASIC-0.53□□□□□ -2.49
BPTFQ12830 ELOCP24-201ENST00000456370 334 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
BPTFQ12830 AC016597.2-201ENST00000613256 341 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
BPTFQ12830 AC007527.2-201ENST00000621825 546 ntTSL 5 BASIC-0.53□□□□□ -2.49
BPTFQ12830 MIR548H2-201ENST00000408874 88 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
BPTFQ12830 AL353621.1-201ENST00000418219 243 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
BPTFQ12830 OFD1P7Y-201ENST00000454643 1155 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
BPTFQ12830 CEP70-205ENST00000464035 1054 ntTSL 1 (best) BASIC-0.54□□□□□ -2.5
BPTFQ12830 AC010460.2-201ENST00000509054 677 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
BPTFQ12830 MIR3139-201ENST00000579145 76 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
BPTFQ12830 AC116165.2-201ENST00000616705 206 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
BPTFQ12830 MTND4P4-201ENST00000439033 1366 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
BPTFQ12830 RNA5SP504-201ENST00000410676 117 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
BPTFQ12830 AC064874.1-202ENST00000440101 287 ntTSL 3 BASIC-0.54□□□□□ -2.5
BPTFQ12830 AC022364.2-201ENST00000457963 554 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
BPTFQ12830 RNA5SP268-201ENST00000516828 124 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
BPTFQ12830 AC025678.1-201ENST00000567861 338 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
BPTFQ12830 AC005695.2-201ENST00000579641 259 ntTSL 3 BASIC-0.54□□□□□ -2.5
BPTFQ12830 KLRA1P-203ENST00000535939 2353 ntTSL 1 (best) BASIC-0.54□□□□□ -2.5
BPTFQ12830 SNORD114-19-201ENST00000363072 75 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
BPTFQ12830 RNU6-312P-201ENST00000364629 107 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
BPTFQ12830 Y_RNA.497-201ENST00000384447 98 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
BPTFQ12830 HMGN2P26-201ENST00000463169 339 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
BPTFQ12830 AC007215.1-201ENST00000464893 276 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
BPTFQ12830 AC122134.1-202ENST00000569111 1201 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
BPTFQ12830 MIR4770-201ENST00000579149 58 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
BPTFQ12830 MIR4306-201ENST00000583390 91 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
BPTFQ12830 MIR548B-201ENST00000385247 97 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
BPTFQ12830 MIR1185-1-201ENST00000408598 86 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
BPTFQ12830 LINC01032-201ENST00000451690 276 ntTSL 5 BASIC-0.55□□□□□ -2.5
BPTFQ12830 AC113347.4-201ENST00000506032 685 ntTSL 3 BASIC-0.55□□□□□ -2.5
BPTFQ12830 RNU6ATAC22P-201ENST00000516794 89 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
BPTFQ12830 FAM96A-206ENST00000559950 561 ntTSL 2 BASIC-0.55□□□□□ -2.5
BPTFQ12830 VN1R83P-201ENST00000595685 445 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
BPTFQ12830 SEPT14P17-201ENST00000617978 177 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
BPTFQ12830 DLEU2_6.3-201ENST00000340052 136 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
BPTFQ12830 Y_RNA.71-201ENST00000362892 104 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
BPTFQ12830 AL079342.2-201ENST00000403367 482 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
BPTFQ12830 RNU2-59P-201ENST00000410482 191 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
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