Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Length 700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 AL353705.1-201ENST00000433468 480 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPREP23469 AL645939.1-201ENST00000453429 797 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPREP23469 RNU6-521P-201ENST00000516663 105 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPREP23469 AC136475.4-201ENST00000534271 280 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPREP23469 AC141557.1-201ENST00000540982 400 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPREP23469 AC006064.5-201ENST00000541782 248 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPREP23469 MIR432-201ENST00000606207 94 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPREP23469 SYNE2-203ENST00000357395 21555 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPREP23469 MANEA-201ENST00000358812 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPREP23469 UTS2B-201ENST00000340524 2395 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPREP23469 VEPH1-203ENST00000392833 3979 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPREP23469 GABRG2-217ENST00000639384 5360 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPREP23469 ZBBX-201ENST00000307529 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPREP23469 Y_RNA.78-201ENST00000362970 110 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPREP23469 SNORA1.3-201ENST00000384676 136 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPREP23469 AC008134.1-201ENST00000420943 193 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPREP23469 RPS29P7-201ENST00000439662 171 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPREP23469 AL118523.1-201ENST00000444436 480 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPREP23469 snoU13.22-201ENST00000459428 104 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPREP23469 RNA5SP143-201ENST00000516936 115 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPREP23469 HSPE1P18-201ENST00000517602 280 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPREP23469 IGKV3-31-201ENST00000523109 329 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPREP23469 AC068339.1-201ENST00000526965 141 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPREP23469 AC069240.1-201ENST00000548774 375 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPREP23469 AC009803.1-201ENST00000551531 416 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPREP23469 GNRHR2P1-201ENST00000555315 631 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPREP23469 MIR3129-201ENST00000581095 76 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPREP23469 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPREP23469 MIR3202-2-201ENST00000635980 79 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPREP23469 ORC4-201ENST00000264169 6598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPREP23469 LINC01630-206ENST00000635103 4292 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPREP23469 UTP20-201ENST00000261637 9025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPREP23469 BMPR2-201ENST00000374574 9683 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPREP23469 DNAH8-205ENST00000449981 12940 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPREP23469 STON1-GTF2A1L-202ENST00000394754 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPREP23469 PTMAP2-201ENST00000397627 327 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPREP23469 AL139095.1-201ENST00000404326 391 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPREP23469 AL161651.1-201ENST00000440882 223 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPREP23469 SNORD11-201ENST00000459124 84 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPREP23469 AC080013.2-201ENST00000460866 323 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPREP23469 RNU6-1073P-201ENST00000517182 106 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPREP23469 IFITM8P-201ENST00000522529 394 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPREP23469 HSPE1P5-201ENST00000561489 272 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPREP23469 ADGRL2-201ENST00000319517 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPREP23469 PUS7L-201ENST00000344862 13593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPREP23469 PUS7L-207ENST00000551923 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPREP23469 UGT2A3-201ENST00000251566 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPREP23469 ANKRD20A9P-201ENST00000457997 2978 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPREP23469 MTUS1-228ENST00000544260 3650 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPREP23469 WDR49-201ENST00000308378 2594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPREP23469 ACSM3-201ENST00000289416 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPREP23469 Y_RNA.66-201ENST00000362862 102 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPREP23469 Y_RNA.111-201ENST00000363248 100 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPREP23469 RNY4P6-201ENST00000363667 96 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPREP23469 RNU4-13P-201ENST00000364019 141 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPREP23469 Y_RNA.244-201ENST00000364484 109 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPREP23469 LINC02337-201ENST00000401043 374 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPREP23469 RNA5SP511-201ENST00000410487 115 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPREP23469 snoU13.14-201ENST00000459372 104 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPREP23469 AC107626.1-201ENST00000471084 183 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPREP23469 RNU6-904P-201ENST00000516206 101 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPREP23469 RNU7-149P-201ENST00000516739 59 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPREP23469 AL163973.3-201ENST00000547093 430 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPREP23469 MIR2681-201ENST00000581814 105 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPREP23469 RPS15AP11-201ENST00000594193 385 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPREP23469 MIR6075-201ENST00000620782 95 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPREP23469 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPREP23469 AC002064.3-201ENST00000623448 346 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPREP23469 MIR3199-2-201ENST00000636243 86 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPREP23469 CNTN5-207ENST00000527185 4303 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPREP23469 TMEM30A-202ENST00000370050 3775 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPREP23469 OR5H14-202ENST00000641380 7323 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPREP23469 AC004944.1-201ENST00000517807 3059 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPREP23469 ADAM29-201ENST00000359240 3325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPREP23469 MIR302B-201ENST00000362188 73 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPREP23469 Y_RNA.198-201ENST00000364013 98 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPREP23469 Y_RNA.203-201ENST00000364106 102 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPREP23469 SNORA51.4-201ENST00000364993 124 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPREP23469 SNORA1-201ENST00000384107 130 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPREP23469 Y_RNA.486-201ENST00000384398 107 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPREP23469 MIR124-3-201ENST00000384866 87 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPREP23469 AC004875.1-201ENST00000432702 378 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPREP23469 HMGN2P9-201ENST00000476875 229 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPREP23469 AC009320.1-201ENST00000549070 349 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPREP23469 AC026462.2-201ENST00000565771 286 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPREP23469 AL355512.1-202ENST00000607952 209 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPREP23469 CACNB4-233ENST00000636773 4143 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPREP23469 ARID2-205ENST00000444670 7316 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPREP23469 CNTN5-212ENST00000619298 5734 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPREP23469 AP5M1-201ENST00000261558 11737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPREP23469 IL33-203ENST00000456383 2501 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPREP23469 PPP1R9A-202ENST00000340694 9689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPREP23469 OR8D1-203ENST00000641897 8285 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPREP23469 DMXL2-202ENST00000449909 7465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPREP23469 MYNN-202ENST00000356716 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPREP23469 MIR181A1HG-203ENST00000436880 2308 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPREP23469 Y_RNA.17-201ENST00000362433 111 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPREP23469 Y_RNA.93-201ENST00000363066 109 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPREP23469 MIR181A2-201ENST00000384863 110 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPREP23469 RPS3P1-201ENST00000456781 192 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
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