Protein–RNA interactions for Protein: O75390

CS, Citrate synthase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSO75390 PRELID3BP1-201ENST00000457142 540 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CSO75390 RNU7-187P-201ENST00000458985 68 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CSO75390 RNU6-1053P-201ENST00000515930 101 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CSO75390 RNU6-864P-201ENST00000516256 108 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CSO75390 LINC02155-201ENST00000519215 407 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
CSO75390 AP003123.1-201ENST00000526041 333 ntTSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.11
CSO75390 AC022469.2-201ENST00000554759 396 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
CSO75390 CYP4A27P-201ENST00000567218 190 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CSO75390 MIR4498-201ENST00000577599 66 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CSO75390 SNORA59B-202ENST00000578183 701 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CSO75390 RBBP8-210ENST00000581687 617 ntTSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.11
CSO75390 AL109918.3-201ENST00000603072 338 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CSO75390 AC092794.1-201ENST00000612734 582 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CSO75390 LINC01515-217ENST00000620859 694 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
CSO75390 AL136221.1-201ENST00000621449 509 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CSO75390 AC009033.1-201ENST00000624279 431 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CSO75390 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CSO75390 AC100810.6-201ENST00000638068 285 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CSO75390 RNU6-562P-201ENST00000362731 107 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CSO75390 SNORD116-11-201ENST00000383882 92 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CSO75390 RNU6-784P-201ENST00000384330 106 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CSO75390 SNORD14D-201ENST00000384390 87 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CSO75390 RNU6-831P-201ENST00000384548 107 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CSO75390 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC1.89□□□□□ -2.11
CSO75390 RNA5SP465-201ENST00000391195 109 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CSO75390 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CSO75390 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CSO75390 SNRPG-202ENST00000413456 398 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
CSO75390 AL158823.1-201ENST00000418441 478 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CSO75390 AC012306.1-201ENST00000423267 114 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CSO75390 AC133865.1-201ENST00000438619 339 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
CSO75390 AC073325.1-201ENST00000443714 542 ntTSL 4 BASIC1.89□□□□□ -2.11
CSO75390 SNRPG-205ENST00000449935 428 ntTSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
CSO75390 RPL23AP3-201ENST00000453844 468 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CSO75390 AC132942.1-201ENST00000486753 483 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CSO75390 PTP4A1P4-201ENST00000512479 322 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CSO75390 RNU6-965P-201ENST00000516721 96 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CSO75390 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CSO75390 ZNF436-AS1-205ENST00000518600 376 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
CSO75390 AC091944.1-201ENST00000521984 449 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
CSO75390 AC114550.2-201ENST00000524008 397 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
CSO75390 LINC02095-202ENST00000543512 323 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
CSO75390 AL049869.2-201ENST00000556634 365 ntTSL 2 BASIC1.89□□□□□ -2.11
CSO75390 MIR3942-201ENST00000585264 109 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CSO75390 AC245748.3-201ENST00000588710 241 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
CSO75390 AC243960.4-201ENST00000600532 288 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CSO75390 AL359314.1-201ENST00000616913 261 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CSO75390 HOXA11-AS1_4.1-201ENST00000620901 233 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CSO75390 KNL1-204ENST00000527044 5404 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
CSO75390 SI-201ENST00000264382 6011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
CSO75390 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
CSO75390 RNU5B-2P-201ENST00000363036 113 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CSO75390 U3.9-201ENST00000363823 204 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CSO75390 RNU6-1286P-201ENST00000383871 107 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CSO75390 SNORA12-201ENST00000391162 147 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CSO75390 AL590632.1-201ENST00000424289 371 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CSO75390 MTND2P29-201ENST00000438595 412 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CSO75390 RPL23AP6-201ENST00000446637 472 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CSO75390 AC021146.2-201ENST00000504736 556 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CSO75390 MRPS17P9-201ENST00000511924 393 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CSO75390 MTND4LP26-201ENST00000518144 282 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CSO75390 AF235103.2-201ENST00000525753 346 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CSO75390 AP003033.1-201ENST00000527244 415 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CSO75390 GNAI2P1-201ENST00000541815 315 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CSO75390 EIF4A1P12-201ENST00000551910 141 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CSO75390 AC025030.2-201ENST00000552558 567 ntTSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
CSO75390 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CSO75390 FGF7P1-201ENST00000582820 288 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CSO75390 MIR3935-201ENST00000583472 104 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CSO75390 AC018638.8-201ENST00000588755 281 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CSO75390 AC008749.1-201ENST00000597650 306 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CSO75390 AC009994.1-201ENST00000606889 253 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CSO75390 AC091932.3-201ENST00000624223 323 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CSO75390 CYLC1-201ENST00000329312 2106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
CSO75390 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
CSO75390 AL161668.1-201ENST00000320322 358 ntTSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
CSO75390 RNU6-26P-201ENST00000383985 107 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CSO75390 SNORA29-201ENST00000384183 140 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CSO75390 RNU6-378P-201ENST00000384324 107 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CSO75390 RNU6-933P-201ENST00000384424 107 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CSO75390 AC009480.1-201ENST00000402410 412 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
CSO75390 MIR1262-201ENST00000408276 93 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CSO75390 RNU6ATAC25P-201ENST00000408798 117 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CSO75390 FO680682.1-201ENST00000421261 345 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
CSO75390 SIRPG-AS1-201ENST00000437384 410 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
CSO75390 AC011092.2-201ENST00000533659 586 ntTSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
CSO75390 PWRN1-203ENST00000564898 389 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
CSO75390 AL096840.1-201ENST00000603287 93 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CSO75390 U6atac.1-201ENST00000616025 117 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CSO75390 KTN1-214ENST00000554507 2057 ntTSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
CSO75390 AC009487.4-201ENST00000624969 3585 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CSO75390 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
CSO75390 Y_RNA.123-201ENST00000363338 102 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CSO75390 Y_RNA.151-201ENST00000363566 112 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CSO75390 RNU6-743P-201ENST00000364151 106 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CSO75390 MIR521-1-201ENST00000384902 87 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CSO75390 MIR676-201ENST00000390702 67 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CSO75390 SNORA17.3-201ENST00000391159 129 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CSO75390 RPS26P42-201ENST00000413485 326 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CSO75390 DAP3P1-201ENST00000441522 278 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.7 ms