Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 AL365440.2-201ENST00000419738 2597 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
PSDA5PKW4 ANO3-202ENST00000525139 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
PSDA5PKW4 ECT2-211ENST00000441497 2825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
PSDA5PKW4 LRRC49-224ENST00000560691 2531 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
PSDA5PKW4 SCEL-205ENST00000535157 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
PSDA5PKW4 XIRP2-207ENST00000628543 12182 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
PSDA5PKW4 Y_RNA.342-201ENST00000365352 113 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
PSDA5PKW4 RNA5SP120-201ENST00000410900 112 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
PSDA5PKW4 RNA5SP136-201ENST00000410906 107 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
PSDA5PKW4 AL139247.1-201ENST00000422768 325 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
PSDA5PKW4 AF228730.3-201ENST00000436691 102 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
PSDA5PKW4 THEMIS-204ENST00000537166 3830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
PSDA5PKW4 POC1B-211ENST00000549504 581 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
PSDA5PKW4 AC026992.1-202ENST00000558454 421 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
PSDA5PKW4 GALP-203ENST00000590002 150 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
PSDA5PKW4 AL451007.1-201ENST00000595491 289 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
PSDA5PKW4 MIR3202-2-201ENST00000635980 79 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
PSDA5PKW4 GABRG2-214ENST00000639111 11735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
PSDA5PKW4 LINC02232-201ENST00000509932 4079 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
PSDA5PKW4 STAG2-204ENST00000371157 5991 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
PSDA5PKW4 ORC4-202ENST00000392857 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
PSDA5PKW4 CNOT1-201ENST00000317147 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
PSDA5PKW4 ADGRL3-202ENST00000504896 4816 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
PSDA5PKW4 AL360270.1-201ENST00000440689 2359 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
PSDA5PKW4 KCNJ16-211ENST00000615244 4190 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.16□□□□□ -1.58
PSDA5PKW4 SLC17A4-201ENST00000377905 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
PSDA5PKW4 ZNF439-201ENST00000304030 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
PSDA5PKW4 AKAP11-201ENST00000025301 9920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
PSDA5PKW4 AC092821.1-201ENST00000640129 4180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
PSDA5PKW4 RNU6-1125P-201ENST00000363601 107 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
PSDA5PKW4 RNU6-884P-201ENST00000363889 107 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
PSDA5PKW4 MIR548B-201ENST00000385247 97 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
PSDA5PKW4 AL139095.1-201ENST00000404326 391 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
PSDA5PKW4 RNA5SP390-201ENST00000410191 113 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
PSDA5PKW4 AC093159.1-201ENST00000416845 424 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
PSDA5PKW4 AC092047.1-201ENST00000424997 240 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
PSDA5PKW4 AC022137.1-201ENST00000483735 151 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
PSDA5PKW4 RPL30P5-201ENST00000494923 336 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
PSDA5PKW4 RN7SKP18-201ENST00000516005 275 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
PSDA5PKW4 RNA5SP360-201ENST00000516555 118 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
PSDA5PKW4 MIR3136-201ENST00000583498 78 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
PSDA5PKW4 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
PSDA5PKW4 Y_RNA.818-201ENST00000618813 71 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
PSDA5PKW4 MIR2052-201ENST00000636055 55 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
PSDA5PKW4 ANKRD30A-202ENST00000374660 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
PSDA5PKW4 TLR10-206ENST00000508334 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
PSDA5PKW4 LINC02389-201ENST00000535058 3546 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
PSDA5PKW4 NDST4-201ENST00000264363 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
PSDA5PKW4 CNTN5-209ENST00000528682 3800 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
PSDA5PKW4 KCNJ13-201ENST00000233826 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
PSDA5PKW4 MLH3-212ENST00000556740 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
PSDA5PKW4 AC103988.1-201ENST00000566382 2177 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
PSDA5PKW4 ZNF382-203ENST00000435416 3865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
PSDA5PKW4 AC024940.1-203ENST00000398963 4423 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
PSDA5PKW4 PARP11-203ENST00000427057 4406 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
PSDA5PKW4 BBX-203ENST00000402543 3980 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
PSDA5PKW4 MAPK10-353ENST00000641803 8483 ntAPPRIS P2 BASIC5.15□□□□□ -1.58
PSDA5PKW4 CEP57L1-223ENST00000523787 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
PSDA5PKW4 RNU1-75P-201ENST00000347264 129 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PSDA5PKW4 Y_RNA.107-201ENST00000363190 121 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PSDA5PKW4 RNU6-1323P-201ENST00000384025 107 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PSDA5PKW4 RNU6-622P-201ENST00000384272 103 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PSDA5PKW4 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.59
PSDA5PKW4 SNORA3.3-201ENST00000408712 125 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PSDA5PKW4 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PSDA5PKW4 RNA5SP153-201ENST00000516498 76 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PSDA5PKW4 SCARNA14-201ENST00000516903 136 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PSDA5PKW4 RNU4-60P-201ENST00000517239 135 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PSDA5PKW4 AC069240.1-201ENST00000548774 375 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PSDA5PKW4 FAM71BP1-201ENST00000604431 523 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PSDA5PKW4 OR10D3-203ENST00000641546 3566 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.59
PSDA5PKW4 FLJ46284-201ENST00000504861 3421 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
PSDA5PKW4 WDFY3-201ENST00000295888 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
PSDA5PKW4 CENPE-202ENST00000380026 8241 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
PSDA5PKW4 RNF111-212ENST00000561186 4536 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
PSDA5PKW4 ATF7IP2-202ENST00000356427 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
PSDA5PKW4 PLCB4-206ENST00000414679 3947 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PSDA5PKW4 GAB1-203ENST00000505913 2477 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PSDA5PKW4 LZTFL1-216ENST00000539217 4113 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PSDA5PKW4 Y_RNA.17-201ENST00000362433 111 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PSDA5PKW4 MIR181B1-201ENST00000385240 110 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PSDA5PKW4 AL392086.1-201ENST00000457632 299 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PSDA5PKW4 AC008155.2-201ENST00000464337 397 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PSDA5PKW4 COX6CP6-201ENST00000490840 228 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PSDA5PKW4 PTP4A1-204ENST00000578299 135 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PSDA5PKW4 AC105245.1-201ENST00000581934 244 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PSDA5PKW4 AL034555.1-201ENST00000604816 211 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PSDA5PKW4 PCGEM1.1-201ENST00000613431 131 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PSDA5PKW4 VGLL4-219ENST00000638314 93 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PSDA5PKW4 FLG-AS1-205ENST00000445097 2857 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
PSDA5PKW4 DOCK7-219ENST00000635253 6423 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PSDA5PKW4 CLCA2-201ENST00000370565 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
PSDA5PKW4 RIMS2-201ENST00000262231 3854 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
PSDA5PKW4 DNAH8-205ENST00000449981 12940 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PSDA5PKW4 U3.8-201ENST00000363675 217 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PSDA5PKW4 RNA5SP50-201ENST00000363731 107 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PSDA5PKW4 SNORA38.1-201ENST00000364172 131 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PSDA5PKW4 RNA5-8SP4-201ENST00000365096 150 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PSDA5PKW4 AP002088.1-201ENST00000382740 395 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PSDA5PKW4 TOMM22P1-201ENST00000418578 312 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.7 ms