Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SNX13Q9Y5W8 GCNT4-201ENST00000322348 5554 ntAPPRIS P1 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SNX13Q9Y5W8 RNU6-280P-201ENST00000364145 104 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SNX13Q9Y5W8 SNORA62.3-201ENST00000365110 153 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SNX13Q9Y5W8 SNORA9.2-201ENST00000365361 133 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SNX13Q9Y5W8 RNU6-281P-201ENST00000384212 103 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SNX13Q9Y5W8 RNU6-611P-201ENST00000384276 104 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SNX13Q9Y5W8 MIR592-201ENST00000384959 97 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SNX13Q9Y5W8 MIR200C-201ENST00000384980 68 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SNX13Q9Y5W8 MIR1302-11-201ENST00000408051 138 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SNX13Q9Y5W8 MIR1302-9-201ENST00000408365 138 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SNX13Q9Y5W8 MIR320B2-201ENST00000408479 138 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SNX13Q9Y5W8 MIR1302-10-201ENST00000408734 138 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SNX13Q9Y5W8 LINC01344-201ENST00000420760 261 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SNX13Q9Y5W8 AC005534.2-201ENST00000431047 433 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SNX13Q9Y5W8 AL365295.1-201ENST00000454942 514 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SNX13Q9Y5W8 AC116563.1-201ENST00000505454 396 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SNX13Q9Y5W8 AC010457.1-201ENST00000510469 458 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SNX13Q9Y5W8 RNU6-911P-201ENST00000516523 104 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SNX13Q9Y5W8 RNU4-77P-201ENST00000516692 156 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.711-201ENST00000516993 102 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SNX13Q9Y5W8 RNU6-667P-201ENST00000517186 102 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SNX13Q9Y5W8 MIR2355-201ENST00000517199 87 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SNX13Q9Y5W8 RN7SKP295-201ENST00000517264 153 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SNX13Q9Y5W8 NDUFA5P6-201ENST00000542110 379 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SNX13Q9Y5W8 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SNX13Q9Y5W8 AC022469.2-201ENST00000554759 396 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SNX13Q9Y5W8 AC024270.4-201ENST00000570202 421 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SNX13Q9Y5W8 MIR5680-201ENST00000577577 84 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SNX13Q9Y5W8 MIR3605-201ENST00000583214 100 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SNX13Q9Y5W8 MIR1302-2-201ENST00000607096 138 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SNX13Q9Y5W8 MIR4272-201ENST00000635924 64 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SNX13Q9Y5W8 Clostridiales-1.2-201ENST00000636724 160 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SNX13Q9Y5W8 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SNX13Q9Y5W8 OR51A7-202ENST00000641490 2186 ntAPPRIS P1 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SNX13Q9Y5W8 PRKACB-207ENST00000394838 4294 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SNX13Q9Y5W8 BCL2L11-207ENST00000405953 425 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
SNX13Q9Y5W8 MCFD2P1-201ENST00000417812 300 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SNX13Q9Y5W8 AC114482.1-201ENST00000418010 247 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SNX13Q9Y5W8 EHHADH-202ENST00000440662 656 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SNX13Q9Y5W8 MTND4P19-201ENST00000446659 478 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SNX13Q9Y5W8 AC009237.7-201ENST00000447357 229 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SNX13Q9Y5W8 RNU7-169P-201ENST00000459456 61 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SNX13Q9Y5W8 APOA2-205ENST00000468465 421 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SNX13Q9Y5W8 RPS23P5-201ENST00000495419 428 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SNX13Q9Y5W8 AC093523.1-201ENST00000503268 499 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SNX13Q9Y5W8 ATP5EP1-201ENST00000510257 156 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SNX13Q9Y5W8 SNORA25.14-201ENST00000516481 132 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SNX13Q9Y5W8 AC034114.1-201ENST00000520293 285 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SNX13Q9Y5W8 C18orf54-203ENST00000578138 776 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SNX13Q9Y5W8 MIR5695-201ENST00000579717 85 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SNX13Q9Y5W8 AC024610.1-201ENST00000582685 323 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SNX13Q9Y5W8 MIR5006-201ENST00000583027 110 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SNX13Q9Y5W8 MIR3171-201ENST00000584270 74 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SNX13Q9Y5W8 MIR4719-201ENST00000585233 84 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SNX13Q9Y5W8 AC125232.2-201ENST00000592457 143 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SNX13Q9Y5W8 AC006157.1-201ENST00000611750 366 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SNX13Q9Y5W8 AC007485.1-201ENST00000616755 206 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SNX13Q9Y5W8 MAGI2-AS3-224ENST00000619135 205 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SNX13Q9Y5W8 MIR7975-201ENST00000619350 68 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SNX13Q9Y5W8 AC034229.5-201ENST00000624258 185 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SNX13Q9Y5W8 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SNX13Q9Y5W8 ZBED5-202ENST00000432999 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
SNX13Q9Y5W8 OR5V1-217ENST00000641768 2763 ntAPPRIS P1 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SNX13Q9Y5W8 CCSAP-202ENST00000366686 4399 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SNX13Q9Y5W8 ANP32E-209ENST00000616917 2989 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.28-201ENST00000362554 111 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.132-201ENST00000363421 102 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SNX13Q9Y5W8 RNU1-148P-201ENST00000384472 162 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.605-201ENST00000410577 105 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SNX13Q9Y5W8 HMGN2P35-201ENST00000412164 270 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SNX13Q9Y5W8 AC003982.1-202ENST00000469928 248 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SNX13Q9Y5W8 RNU5F-4P-201ENST00000516581 114 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SNX13Q9Y5W8 AP001458.1-201ENST00000532626 92 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SNX13Q9Y5W8 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SNX13Q9Y5W8 AL356055.1-201ENST00000602528 446 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SNX13Q9Y5W8 AC005296.1-201ENST00000616145 209 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SNX13Q9Y5W8 AL606534.2-204ENST00000635008 178 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SNX13Q9Y5W8 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
SNX13Q9Y5W8 ARHGAP11A-207ENST00000565905 3318 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SNX13Q9Y5W8 RNU1-62P-201ENST00000362599 164 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.39-201ENST00000362620 98 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SNX13Q9Y5W8 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SNX13Q9Y5W8 RNU5F-3P-201ENST00000363767 117 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SNX13Q9Y5W8 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SNX13Q9Y5W8 LINC01545-201ENST00000377879 521 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
SNX13Q9Y5W8 AC096644.2-201ENST00000429278 159 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SNX13Q9Y5W8 AC091133.1-201ENST00000435491 483 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
SNX13Q9Y5W8 AC006028.1-201ENST00000438379 402 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SNX13Q9Y5W8 AL163540.1-201ENST00000485382 386 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SNX13Q9Y5W8 RN7SL504P-201ENST00000494496 287 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SNX13Q9Y5W8 AC074250.1-201ENST00000511117 192 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SNX13Q9Y5W8 AC008885.1-201ENST00000514930 301 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SNX13Q9Y5W8 RNU6-344P-201ENST00000516635 111 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SNX13Q9Y5W8 SNORA67.7-201ENST00000516664 135 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SNX13Q9Y5W8 RRM2B-207ENST00000519962 201 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
SNX13Q9Y5W8 CYCSP26-201ENST00000534107 320 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SNX13Q9Y5W8 AC093023.1-201ENST00000547375 507 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SNX13Q9Y5W8 MIR3158-1-201ENST00000583596 81 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
SNX13Q9Y5W8 SNORD58B-201ENST00000607313 66 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
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