Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.439-201ENST00000384119 94 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SH3BP4Q9P0V3 MIR10B-201ENST00000385011 110 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SH3BP4Q9P0V3 SNORD78.2-201ENST00000391076 69 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SH3BP4Q9P0V3 SNAP23-203ENST00000397138 477 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
SH3BP4Q9P0V3 MRPL35P1-201ENST00000404272 572 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP390-201ENST00000410191 113 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SH3BP4Q9P0V3 AC009310.1-201ENST00000414414 451 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SH3BP4Q9P0V3 AL513477.1-202ENST00000417061 214 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SH3BP4Q9P0V3 AL161651.1-201ENST00000440882 223 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SH3BP4Q9P0V3 Z98949.2-201ENST00000440996 144 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SH3BP4Q9P0V3 Z96811.1-201ENST00000445880 108 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SH3BP4Q9P0V3 RPL39P38-201ENST00000467018 153 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SH3BP4Q9P0V3 RN7SL499P-201ENST00000481141 276 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SH3BP4Q9P0V3 AKIRIN2P1-201ENST00000505898 352 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-56P-201ENST00000516986 93 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SH3BP4Q9P0V3 AC026241.1-201ENST00000517873 2142 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SH3BP4Q9P0V3 AC023824.2-201ENST00000566185 400 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SH3BP4Q9P0V3 MIR4659A-201ENST00000580269 81 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SH3BP4Q9P0V3 AC011471.1-201ENST00000585766 187 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SH3BP4Q9P0V3 AC011476.5-201ENST00000615594 130 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SH3BP4Q9P0V3 MIR6075-201ENST00000620782 95 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SH3BP4Q9P0V3 FTX-214ENST00000638437 12267 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SH3BP4Q9P0V3 AC004944.1-201ENST00000517807 3059 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SH3BP4Q9P0V3 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
SH3BP4Q9P0V3 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
SH3BP4Q9P0V3 AC000403.1-201ENST00000613696 3585 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SH3BP4Q9P0V3 AC111000.4-202ENST00000505646 2648 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SH3BP4Q9P0V3 PLS1-201ENST00000337777 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
SH3BP4Q9P0V3 APCS-201ENST00000255040 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
SH3BP4Q9P0V3 MIR335-201ENST00000362173 94 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.143-201ENST00000363520 106 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SH3BP4Q9P0V3 SNORD115-8-201ENST00000363856 82 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SH3BP4Q9P0V3 SNORD115-38-201ENST00000365037 82 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-1083P-201ENST00000384022 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.477-201ENST00000384352 108 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SH3BP4Q9P0V3 RNVU1-14-201ENST00000384770 164 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.581-201ENST00000391017 97 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-1140P-201ENST00000410517 106 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SH3BP4Q9P0V3 AC078809.1-201ENST00000427601 140 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SH3BP4Q9P0V3 RPS15AP7-201ENST00000439294 405 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SH3BP4Q9P0V3 GPM6BP3-201ENST00000442797 145 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SH3BP4Q9P0V3 AL441985.1-201ENST00000457727 251 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SH3BP4Q9P0V3 CPHL1P-203ENST00000471823 523 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SH3BP4Q9P0V3 RPL26P26-201ENST00000480251 434 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SH3BP4Q9P0V3 AC016632.1-201ENST00000503994 196 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SH3BP4Q9P0V3 AC116563.1-201ENST00000505454 396 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SH3BP4Q9P0V3 MRPS36P2-201ENST00000512569 299 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.673-201ENST00000516306 88 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.713-201ENST00000517013 96 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-58P-201ENST00000517143 103 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SH3BP4Q9P0V3 AC093023.1-201ENST00000547375 507 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SH3BP4Q9P0V3 UBL5P4-201ENST00000562584 236 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SH3BP4Q9P0V3 BX546450.2-201ENST00000602419 435 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SH3BP4Q9P0V3 AL683887.1-201ENST00000603401 287 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SH3BP4Q9P0V3 AC010900.2-201ENST00000604508 210 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SH3BP4Q9P0V3 AC011373.1-201ENST00000607270 237 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SH3BP4Q9P0V3 AC084757.4-201ENST00000616350 526 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SH3BP4Q9P0V3 MIR376A1-201ENST00000616574 68 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SH3BP4Q9P0V3 AC141273.2-201ENST00000618989 130 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SH3BP4Q9P0V3 U6.104-201ENST00000637979 90 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SH3BP4Q9P0V3 AC010329.5-201ENST00000623497 2174 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
SH3BP4Q9P0V3 AL445259.1-201ENST00000587106 2984 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
SH3BP4Q9P0V3 AC009487.2-201ENST00000420969 6821 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SH3BP4Q9P0V3 ZBBX-201ENST00000307529 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SH3BP4Q9P0V3 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SH3BP4Q9P0V3 AC073325.2-201ENST00000339545 159 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.20-201ENST00000362479 113 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SH3BP4Q9P0V3 SNORA71.3-201ENST00000362582 128 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-137P-201ENST00000363680 108 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.237-201ENST00000364439 102 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.319-201ENST00000365138 92 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-142P-201ENST00000384019 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-281P-201ENST00000384212 103 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-102P-201ENST00000384485 104 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.539-201ENST00000384635 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.541-201ENST00000384640 113 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.552-201ENST00000384665 112 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-159P-201ENST00000391080 106 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SH3BP4Q9P0V3 RNU2-20P-201ENST00000410425 191 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SH3BP4Q9P0V3 LINC02331-201ENST00000418927 602 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SH3BP4Q9P0V3 AC244670.1-201ENST00000436879 112 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SH3BP4Q9P0V3 RPL39P29-201ENST00000447779 157 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SH3BP4Q9P0V3 snoU13.6-201ENST00000458785 104 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SH3BP4Q9P0V3 AP004217.1-201ENST00000480579 346 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SH3BP4Q9P0V3 RPS23P5-201ENST00000495419 428 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SH3BP4Q9P0V3 RNU5F-8P-201ENST00000515941 111 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SH3BP4Q9P0V3 NKAIN2-205ENST00000546092 148 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SH3BP4Q9P0V3 AC009120.5-201ENST00000561669 475 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SH3BP4Q9P0V3 MIR3616-201ENST00000584070 92 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SH3BP4Q9P0V3 AL137843.1-201ENST00000605078 385 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SH3BP4Q9P0V3 DLD-214ENST00000639772 421 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SH3BP4Q9P0V3 AC242426.3-202ENST00000607149 2397 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SH3BP4Q9P0V3 IL33-202ENST00000417746 2327 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SH3BP4Q9P0V3 PARPBP-203ENST00000392911 1916 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SH3BP4Q9P0V3 TFEC-202ENST00000320239 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
SH3BP4Q9P0V3 AC092268.1-201ENST00000342691 405 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.16-201ENST00000362421 102 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SH3BP4Q9P0V3 SNORA63.1-201ENST00000362493 131 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-937P-201ENST00000384325 106 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SH3BP4Q9P0V3 U3.26-201ENST00000391236 204 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
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