Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 SNORA29-201ENST00000384183 140 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
GDE1Q9NZC3 RNU6-1093P-201ENST00000391194 107 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
GDE1Q9NZC3 SNORD23.1-201ENST00000408212 104 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
GDE1Q9NZC3 RNA5SP494-201ENST00000410653 129 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
GDE1Q9NZC3 Z82205.1-201ENST00000428456 297 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
GDE1Q9NZC3 IPO7P1-201ENST00000442031 636 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
GDE1Q9NZC3 AC007677.1-201ENST00000445757 515 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
GDE1Q9NZC3 AC025918.1-201ENST00000452467 383 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
GDE1Q9NZC3 PRELID3BP1-201ENST00000457142 540 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
GDE1Q9NZC3 ACA59.1-201ENST00000515966 143 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
GDE1Q9NZC3 MIR449C-201ENST00000516047 92 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
GDE1Q9NZC3 RNU4-49P-201ENST00000516080 140 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
GDE1Q9NZC3 RNU6-358P-201ENST00000516564 75 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
GDE1Q9NZC3 LINC02095-202ENST00000543512 323 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
GDE1Q9NZC3 AC233702.2-202ENST00000562547 291 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
GDE1Q9NZC3 AC087463.2-201ENST00000565943 472 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
GDE1Q9NZC3 AC009754.1-201ENST00000566282 540 ntTSL 4 BASIC2.2□□□□□ -2.06
GDE1Q9NZC3 AC124303.1-201ENST00000605703 360 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
GDE1Q9NZC3 LINC02112-205ENST00000606744 236 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
GDE1Q9NZC3 AC012640.5-201ENST00000623897 319 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
GDE1Q9NZC3 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
GDE1Q9NZC3 C6orf10-201ENST00000375007 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
GDE1Q9NZC3 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
GDE1Q9NZC3 AC242426.3-202ENST00000607149 2397 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
GDE1Q9NZC3 AL161668.1-201ENST00000320322 358 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
GDE1Q9NZC3 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
GDE1Q9NZC3 RNU6-1286P-201ENST00000383871 107 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
GDE1Q9NZC3 RNU6-378P-201ENST00000384324 107 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
GDE1Q9NZC3 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
GDE1Q9NZC3 RNA5SP201-201ENST00000410316 124 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
GDE1Q9NZC3 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
GDE1Q9NZC3 LINC01710-201ENST00000446002 390 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
GDE1Q9NZC3 AL034345.2-203ENST00000453417 383 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
GDE1Q9NZC3 AC107032.1-201ENST00000485945 480 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
GDE1Q9NZC3 KRTAP13-6P-201ENST00000508999 371 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
GDE1Q9NZC3 AC021785.1-201ENST00000520780 453 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
GDE1Q9NZC3 AP005639.2-201ENST00000527592 928 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
GDE1Q9NZC3 AC026765.1-201ENST00000547876 435 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
GDE1Q9NZC3 AL121821.1-201ENST00000557067 530 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
GDE1Q9NZC3 AP006219.1-201ENST00000580258 472 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
GDE1Q9NZC3 AC011712.1-201ENST00000588959 234 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
GDE1Q9NZC3 AC233981.2-201ENST00000611524 1614 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
GDE1Q9NZC3 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
GDE1Q9NZC3 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
GDE1Q9NZC3 OR5M1-202ENST00000641076 4302 ntAPPRIS P1 BASIC2.18□□□□□ -2.06
GDE1Q9NZC3 MUC15-202ENST00000436318 3118 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
GDE1Q9NZC3 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
GDE1Q9NZC3 RNU6-784P-201ENST00000384330 106 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
GDE1Q9NZC3 MIR517A-201ENST00000385001 87 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
GDE1Q9NZC3 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
GDE1Q9NZC3 RNU6ATAC38P-201ENST00000408119 126 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
GDE1Q9NZC3 RNU6-1148P-201ENST00000410992 104 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
GDE1Q9NZC3 AL139396.1-201ENST00000421137 167 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
GDE1Q9NZC3 DAP3P1-201ENST00000441522 278 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
GDE1Q9NZC3 SPIN4-AS1-201ENST00000451979 426 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
GDE1Q9NZC3 AC069439.1-201ENST00000494739 167 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
GDE1Q9NZC3 AC018710.1-201ENST00000506509 158 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
GDE1Q9NZC3 PTP4A1P4-201ENST00000512479 322 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
GDE1Q9NZC3 RNU6-566P-201ENST00000516790 107 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
GDE1Q9NZC3 LINC02155-201ENST00000519215 407 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
GDE1Q9NZC3 AC090592.1-203ENST00000533942 575 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
GDE1Q9NZC3 MIR4529-201ENST00000578110 78 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
GDE1Q9NZC3 AP001496.1-201ENST00000579113 471 ntTSL 4 BASIC2.18□□□□□ -2.06
GDE1Q9NZC3 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
GDE1Q9NZC3 AC005520.5-201ENST00000613926 164 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
GDE1Q9NZC3 ST7-OT4_2.1-201ENST00000619089 172 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
GDE1Q9NZC3 AC009248.2-201ENST00000619826 254 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
GDE1Q9NZC3 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
GDE1Q9NZC3 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
GDE1Q9NZC3 Y_RNA.248-201ENST00000364501 109 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
GDE1Q9NZC3 HMGB1P18-201ENST00000438801 619 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
GDE1Q9NZC3 RNA5SP458-201ENST00000516188 119 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
GDE1Q9NZC3 RNA5SP454-201ENST00000517231 127 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
GDE1Q9NZC3 SNORA31.25-201ENST00000517242 134 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
GDE1Q9NZC3 TMCO5B-203ENST00000529623 509 ntTSL 4 BASIC2.17□□□□□ -2.06
GDE1Q9NZC3 MRPS36P4-201ENST00000534436 298 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
GDE1Q9NZC3 AC060780.3-201ENST00000589464 80 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
GDE1Q9NZC3 RPL17P51-201ENST00000605218 238 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
GDE1Q9NZC3 AL022345.1-201ENST00000607292 135 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
GDE1Q9NZC3 HOXA11-AS1_4.1-201ENST00000620901 233 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
GDE1Q9NZC3 MTND4P5-201ENST00000435821 1374 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
GDE1Q9NZC3 SAGE1-202ENST00000370709 2879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
GDE1Q9NZC3 RNU6-234P-201ENST00000365229 104 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
GDE1Q9NZC3 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
GDE1Q9NZC3 HMGN2P39-201ENST00000398005 273 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
GDE1Q9NZC3 RNU2-2P-201ENST00000410396 191 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
GDE1Q9NZC3 MAMDC2-AS1-203ENST00000420573 339 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
GDE1Q9NZC3 AC002386.1-201ENST00000436714 398 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
GDE1Q9NZC3 HMGN2P18-201ENST00000450680 270 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
GDE1Q9NZC3 PPP1R2P5-201ENST00000457256 603 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
GDE1Q9NZC3 snoU13.6-201ENST00000458785 104 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
GDE1Q9NZC3 MTCO2P30-201ENST00000503662 364 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
GDE1Q9NZC3 AC093259.1-201ENST00000509755 300 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
GDE1Q9NZC3 AC096711.1-201ENST00000510967 347 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
GDE1Q9NZC3 RNA5SP182-201ENST00000516064 82 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
GDE1Q9NZC3 RNU6-1088P-201ENST00000516850 104 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
GDE1Q9NZC3 RNU1-54P-201ENST00000517181 120 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
GDE1Q9NZC3 AP003171.1-201ENST00000532770 266 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
GDE1Q9NZC3 AC022469.2-201ENST00000554759 396 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
GDE1Q9NZC3 AC011494.1-201ENST00000596454 237 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
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