Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 AL603908.1-201ENST00000406098 201 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SEMA4CQ9C0C4 RN7SKP220-201ENST00000410611 288 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SEMA4CQ9C0C4 RNU2-14P-201ENST00000411053 191 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SEMA4CQ9C0C4 AP000275.1-201ENST00000411943 390 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SEMA4CQ9C0C4 AC244505.4-201ENST00000434905 287 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SEMA4CQ9C0C4 SSXP5-201ENST00000443473 287 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SEMA4CQ9C0C4 RPS26P21-201ENST00000475397 348 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SEMA4CQ9C0C4 AF186996.7-201ENST00000492781 209 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SEMA4CQ9C0C4 LINC02233-201ENST00000513718 358 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SEMA4CQ9C0C4 RNU6-703P-201ENST00000516946 107 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SEMA4CQ9C0C4 AP004607.1-201ENST00000524456 203 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SEMA4CQ9C0C4 AC091564.4-201ENST00000533934 2194 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SEMA4CQ9C0C4 ZNFX1-AS1_2.1-201ENST00000610973 93 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SEMA4CQ9C0C4 AC027309.3-201ENST00000623419 351 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SEMA4CQ9C0C4 SCARNA4-202ENST00000625402 129 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SEMA4CQ9C0C4 CCDC178-213ENST00000583930 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
SEMA4CQ9C0C4 AC093831.2-201ENST00000624393 3427 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SEMA4CQ9C0C4 RGS22-214ENST00000523287 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SEMA4CQ9C0C4 AC008505.1-204ENST00000637363 2714 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SEMA4CQ9C0C4 GABRG2-229ENST00000641017 3628 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SEMA4CQ9C0C4 RNA5SP361-201ENST00000362686 118 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SEMA4CQ9C0C4 RNU6-1301P-201ENST00000362724 104 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SEMA4CQ9C0C4 RNU6-778P-201ENST00000363269 103 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SEMA4CQ9C0C4 RNU1-73P-201ENST00000383971 164 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SEMA4CQ9C0C4 RNU6-217P-201ENST00000384164 104 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SEMA4CQ9C0C4 SNORA36A-201ENST00000384221 132 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SEMA4CQ9C0C4 RNU6-843P-201ENST00000384454 104 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SEMA4CQ9C0C4 SNORD115-46-201ENST00000390982 71 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SEMA4CQ9C0C4 MIR887-201ENST00000401258 79 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SEMA4CQ9C0C4 RNU2-64P-201ENST00000411315 191 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SEMA4CQ9C0C4 AL590135.1-201ENST00000422215 156 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SEMA4CQ9C0C4 HMGN2P30-201ENST00000423237 256 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SEMA4CQ9C0C4 AC096920.1-201ENST00000423991 241 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SEMA4CQ9C0C4 MS4A4E-203ENST00000425663 350 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
SEMA4CQ9C0C4 RPS12P18-201ENST00000442381 270 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SEMA4CQ9C0C4 AP000870.1-201ENST00000472927 406 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SEMA4CQ9C0C4 AC092747.1-201ENST00000538920 351 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SEMA4CQ9C0C4 MDM2-232ENST00000544561 213 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SEMA4CQ9C0C4 AC090510.1-201ENST00000567456 425 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SEMA4CQ9C0C4 AC090617.3-201ENST00000573670 475 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SEMA4CQ9C0C4 AC130289.1-201ENST00000577321 73 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SEMA4CQ9C0C4 AC008739.1-201ENST00000598137 575 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SEMA4CQ9C0C4 PSMD5-AS1-215ENST00000640622 205 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SEMA4CQ9C0C4 TOPORSLP1-203ENST00000493279 2871 ntTSL 4 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SEMA4CQ9C0C4 HAUS6P2-201ENST00000433254 2404 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SEMA4CQ9C0C4 CUL3-204ENST00000409777 3147 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
SEMA4CQ9C0C4 SNORD113-8-201ENST00000363497 74 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SEMA4CQ9C0C4 RNU4-9P-201ENST00000364951 139 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SEMA4CQ9C0C4 SNORA51.4-201ENST00000364993 124 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SEMA4CQ9C0C4 CD24P4-201ENST00000382840 243 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SEMA4CQ9C0C4 SNORA70B-201ENST00000384210 135 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SEMA4CQ9C0C4 Y_RNA.504-201ENST00000384481 104 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SEMA4CQ9C0C4 FTH1P15-201ENST00000406984 280 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SEMA4CQ9C0C4 MTCYBP2-201ENST00000407745 171 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SEMA4CQ9C0C4 AC087477.1-201ENST00000465747 340 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SEMA4CQ9C0C4 RNU6-1338P-201ENST00000516328 91 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SEMA4CQ9C0C4 RNU6-56P-201ENST00000516986 93 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SEMA4CQ9C0C4 UBL5P4-201ENST00000562584 236 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SEMA4CQ9C0C4 AC024153.1-201ENST00000603103 365 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SEMA4CQ9C0C4 AC005696.2-201ENST00000610120 626 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SEMA4CQ9C0C4 PRPSAP2-229ENST00000628609 192 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SEMA4CQ9C0C4 U2.21-201ENST00000637295 81 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SEMA4CQ9C0C4 AC090740.1-201ENST00000623193 2262 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SEMA4CQ9C0C4 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SEMA4CQ9C0C4 AC135776.4-201ENST00000624300 1904 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SEMA4CQ9C0C4 ZMYM2-203ENST00000382874 10139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
SEMA4CQ9C0C4 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SEMA4CQ9C0C4 NOX4-202ENST00000343727 3347 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SEMA4CQ9C0C4 Y_RNA.150-201ENST00000363562 102 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SEMA4CQ9C0C4 RNU6-799P-201ENST00000363567 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SEMA4CQ9C0C4 Y_RNA.269-201ENST00000364685 89 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SEMA4CQ9C0C4 Y_RNA.274-201ENST00000364714 101 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SEMA4CQ9C0C4 RNU6-200P-201ENST00000364743 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SEMA4CQ9C0C4 RNU1-100P-201ENST00000365255 165 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SEMA4CQ9C0C4 RNU6-1027P-201ENST00000383998 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SEMA4CQ9C0C4 RNU6-318P-201ENST00000384283 103 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SEMA4CQ9C0C4 RNY3P4-201ENST00000384428 101 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SEMA4CQ9C0C4 MIR544A-201ENST00000384855 91 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SEMA4CQ9C0C4 MIR504-201ENST00000385065 83 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SEMA4CQ9C0C4 MIR549A-201ENST00000385268 96 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SEMA4CQ9C0C4 RNU4-30P-201ENST00000410245 143 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SEMA4CQ9C0C4 RNA5SP38-201ENST00000410750 119 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SEMA4CQ9C0C4 PIGPP3-201ENST00000425307 415 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SEMA4CQ9C0C4 AL731684.2-201ENST00000426839 333 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SEMA4CQ9C0C4 AC091133.1-201ENST00000435491 483 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SEMA4CQ9C0C4 RPL23AP58-201ENST00000440453 469 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SEMA4CQ9C0C4 PRELID3BP1-201ENST00000457142 540 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SEMA4CQ9C0C4 snoU13.6-201ENST00000458785 104 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SEMA4CQ9C0C4 AC092666.1-201ENST00000492054 573 ntTSL 4 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SEMA4CQ9C0C4 RPL30P5-201ENST00000494923 336 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SEMA4CQ9C0C4 AC116563.1-201ENST00000505454 396 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SEMA4CQ9C0C4 AC091144.1-201ENST00000519573 138 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SEMA4CQ9C0C4 GNG2-205ENST00000554736 569 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SEMA4CQ9C0C4 AC026470.2-201ENST00000561492 181 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SEMA4CQ9C0C4 AC024270.4-201ENST00000570202 421 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SEMA4CQ9C0C4 MSMB-202ENST00000582163 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
SEMA4CQ9C0C4 CENPF-206ENST00000614578 528 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SEMA4CQ9C0C4 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
SEMA4CQ9C0C4 PRKG1-205ENST00000401604 5922 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SEMA4CQ9C0C4 PP2D1-202ENST00000389050 2151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
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