Protein–RNA interactions for Protein: Q99966

CITED1, Cbp/p300-interacting transactivator 1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED1Q99966 U2.16-201ENST00000613119 191 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CITED1Q99966 U2.12-201ENST00000613778 191 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CITED1Q99966 U2.20-201ENST00000613956 192 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CITED1Q99966 U2.9-201ENST00000615427 191 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CITED1Q99966 U2.11-201ENST00000616345 191 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CITED1Q99966 U2.2-201ENST00000616535 191 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CITED1Q99966 U2.3-201ENST00000617785 191 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CITED1Q99966 U2.19-201ENST00000618602 191 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CITED1Q99966 RNU2-1-201ENST00000618664 191 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CITED1Q99966 U2.6-201ENST00000619225 191 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
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CITED1Q99966 U2.10-201ENST00000620268 191 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CITED1Q99966 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
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CITED1Q99966 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
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CITED1Q99966 RNU6-1317P-201ENST00000364582 104 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CITED1Q99966 Y_RNA.373-201ENST00000365600 103 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CITED1Q99966 RNU6-160P-201ENST00000384591 107 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CITED1Q99966 TRAV40-201ENST00000390467 317 ntAPPRIS P1 BASIC1.62□□□□□ -2.15
CITED1Q99966 MIR450B-201ENST00000401182 78 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
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CITED1Q99966 CYCSP49-201ENST00000420810 319 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CITED1Q99966 AC012306.1-201ENST00000423267 114 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CITED1Q99966 AL500522.1-201ENST00000423667 318 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
CITED1Q99966 AC092567.1-201ENST00000452397 251 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
CITED1Q99966 AMD1P1-201ENST00000457220 922 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CITED1Q99966 AC021146.2-201ENST00000504736 556 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CITED1Q99966 ZNF436-AS1-205ENST00000518600 376 ntTSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
CITED1Q99966 AP003171.1-201ENST00000532770 266 ntTSL 2 BASIC1.62□□□□□ -2.15
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CITED1Q99966 AC126323.6-201ENST00000561701 451 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
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CITED1Q99966 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
CITED1Q99966 MIR514A2-201ENST00000385131 88 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
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CITED1Q99966 RNA5SP213-201ENST00000391031 106 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CITED1Q99966 Y_RNA.595-201ENST00000410403 105 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
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CITED1Q99966 LINC02555-201ENST00000563933 1951 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CITED1Q99966 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.15
CITED1Q99966 MT-ND1-201ENST00000361390 956 ntAPPRIS P1 BASIC1.59□□□□□ -2.15
CITED1Q99966 Y_RNA.41-201ENST00000362646 102 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CITED1Q99966 RNU6-623P-201ENST00000363143 105 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CITED1Q99966 RNU6-338P-201ENST00000383888 105 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CITED1Q99966 MIR521-1-201ENST00000384902 87 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CITED1Q99966 MIR30A-201ENST00000385092 71 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CITED1Q99966 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.59□□□□□ -2.15
CITED1Q99966 SNRPG-202ENST00000413456 398 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
CITED1Q99966 AC133865.1-201ENST00000438619 339 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
CITED1Q99966 AC073342.1-202ENST00000446192 457 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
CITED1Q99966 SNRPG-205ENST00000449935 428 ntTSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.15
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