Protein–RNA interactions for Protein: Q96A33

CCDC47, Coiled-coil domain-containing protein 47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC47Q96A33 RNU6-545P-201ENST00000362681 104 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CCDC47Q96A33 RNU1-42P-201ENST00000364033 160 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CCDC47Q96A33 Y_RNA.381-201ENST00000365666 102 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CCDC47Q96A33 DEFB125-201ENST00000382410 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
CCDC47Q96A33 SNORD26-201ENST00000384147 75 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CCDC47Q96A33 MIR320A-201ENST00000385302 82 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CCDC47Q96A33 AC002456.1-203ENST00000412669 449 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
CCDC47Q96A33 RPL30P13-201ENST00000418873 348 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CCDC47Q96A33 ARL5AP1-201ENST00000418991 388 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CCDC47Q96A33 AC090960.1-201ENST00000421072 306 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CCDC47Q96A33 C8orf59P1-201ENST00000429930 303 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CCDC47Q96A33 AC245047.4-201ENST00000433189 144 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CCDC47Q96A33 AL122017.1-201ENST00000435858 784 ntTSL 2 BASIC1.65□□□□□ -2.15
CCDC47Q96A33 AC133865.1-201ENST00000438619 339 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
CCDC47Q96A33 PLCB1-IT1-201ENST00000441231 373 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
CCDC47Q96A33 JTBP1-201ENST00000441314 247 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CCDC47Q96A33 RNU6-1037P-201ENST00000459571 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CCDC47Q96A33 AC091435.1-201ENST00000505442 584 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CCDC47Q96A33 AC110009.1-201ENST00000512965 451 ntTSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
CCDC47Q96A33 SNORA14.1-201ENST00000516113 141 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CCDC47Q96A33 RNU6-902P-201ENST00000517212 91 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CCDC47Q96A33 AC073648.5-201ENST00000603502 305 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CCDC47Q96A33 AC121247.2-201ENST00000604776 136 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CCDC47Q96A33 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
CCDC47Q96A33 AC100821.1-201ENST00000523153 2479 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CCDC47Q96A33 SEMG2-201ENST00000372769 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
CCDC47Q96A33 RNU6-360P-201ENST00000390944 104 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CCDC47Q96A33 RNU6-1158P-201ENST00000391167 107 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CCDC47Q96A33 MTCO1P21-201ENST00000416634 589 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CCDC47Q96A33 AC025428.1-201ENST00000444137 403 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
CCDC47Q96A33 AC099513.1-201ENST00000490423 301 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CCDC47Q96A33 AC079140.3-201ENST00000511111 550 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CCDC47Q96A33 RNU6-1041P-201ENST00000516254 102 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CCDC47Q96A33 RNU6-323P-201ENST00000521915 107 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CCDC47Q96A33 LINC01493-203ENST00000534756 509 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
CCDC47Q96A33 AC026765.1-201ENST00000547876 435 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
CCDC47Q96A33 SUB1P3-201ENST00000564581 315 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CCDC47Q96A33 AL357054.2-201ENST00000607644 423 ntTSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
CCDC47Q96A33 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC1.64□□□□□ -2.15
CCDC47Q96A33 AC011604.2-202ENST00000540229 2451 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC1.64□□□□□ -2.15
CCDC47Q96A33 ICE2P2-201ENST00000483823 2787 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CCDC47Q96A33 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CCDC47Q96A33 RNU6-1103P-201ENST00000384150 107 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CCDC47Q96A33 MIR1323-201ENST00000408090 73 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CCDC47Q96A33 MIR1289-2-201ENST00000408360 111 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CCDC47Q96A33 MTCO2P19-201ENST00000427513 598 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CCDC47Q96A33 AL354695.1-201ENST00000427935 228 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CCDC47Q96A33 SNRPGP13-201ENST00000442212 177 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CCDC47Q96A33 MTCO2P18-201ENST00000457151 658 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CCDC47Q96A33 RNU6-548P-201ENST00000517083 115 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CCDC47Q96A33 DEFB131C-201ENST00000528817 165 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CCDC47Q96A33 AL442163.1-201ENST00000557251 515 ntTSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
CCDC47Q96A33 AP001496.1-201ENST00000579113 471 ntTSL 4 BASIC1.63□□□□□ -2.15
CCDC47Q96A33 AC025811.1-201ENST00000604312 472 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CCDC47Q96A33 CTHRC1P1-201ENST00000605383 469 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CCDC47Q96A33 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC1.63□□□□□ -2.15
CCDC47Q96A33 RNU6-227P-201ENST00000362865 103 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CCDC47Q96A33 RNU6-1019P-201ENST00000364424 107 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CCDC47Q96A33 Y_RNA.255-201ENST00000364581 97 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CCDC47Q96A33 RNU6-418P-201ENST00000384035 107 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CCDC47Q96A33 SNORA75-201ENST00000384158 137 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CCDC47Q96A33 MIR548B-201ENST00000385247 97 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CCDC47Q96A33 SNORA67.5-201ENST00000391036 107 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CCDC47Q96A33 CYCSP49-201ENST00000420810 319 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CCDC47Q96A33 AL353193.1-201ENST00000421444 268 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CCDC47Q96A33 SDAD1P3-201ENST00000427380 333 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CCDC47Q96A33 FTH1P12-201ENST00000432137 551 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CCDC47Q96A33 AL121890.1-201ENST00000435457 205 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CCDC47Q96A33 AL606534.3-201ENST00000437499 373 ntTSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
CCDC47Q96A33 MCHR2-AS1-203ENST00000451220 429 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
CCDC47Q96A33 RNU6-956P-201ENST00000458868 103 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CCDC47Q96A33 RPS26P55-201ENST00000471178 356 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CCDC47Q96A33 HMGN2P9-201ENST00000476875 229 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CCDC47Q96A33 FO393415.2-201ENST00000480085 343 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CCDC47Q96A33 RNU6-856P-201ENST00000516959 98 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CCDC47Q96A33 IGLVVI-22-1-201ENST00000521183 211 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CCDC47Q96A33 AC084364.2-201ENST00000546924 395 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CCDC47Q96A33 MIR4424-201ENST00000585257 86 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CCDC47Q96A33 MIR3976-201ENST00000606807 139 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CCDC47Q96A33 RNU6ATAC35P-201ENST00000609276 444 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CCDC47Q96A33 AC007684.1-201ENST00000609671 477 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CCDC47Q96A33 ABCA5-201ENST00000392676 8220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
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CCDC47Q96A33 RNU6-562P-201ENST00000362731 107 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CCDC47Q96A33 RNU6-60P-201ENST00000364792 103 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CCDC47Q96A33 MIR1261-201ENST00000408659 82 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CCDC47Q96A33 MTND3P9-201ENST00000429526 346 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CCDC47Q96A33 AC010095.1-201ENST00000443543 144 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CCDC47Q96A33 TPTE2P5-203ENST00000458118 728 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CCDC47Q96A33 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CCDC47Q96A33 RPS29P27-201ENST00000463711 170 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CCDC47Q96A33 LEKR1-205ENST00000477399 621 ntTSL 2 BASIC1.61□□□□□ -2.15
CCDC47Q96A33 AC074124.1-201ENST00000502368 375 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
CCDC47Q96A33 GTF2H2C-212ENST00000512736 832 ntTSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
CCDC47Q96A33 AC025465.4-201ENST00000513422 638 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CCDC47Q96A33 RNU6-189P-201ENST00000516120 101 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CCDC47Q96A33 AC099520.1-206ENST00000523434 486 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
CCDC47Q96A33 AP005597.4-201ENST00000526762 229 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CCDC47Q96A33 AC016256.1-201ENST00000547971 354 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CCDC47Q96A33 AL160236.1-201ENST00000556317 195 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
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