Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

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Length 1,123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 SNORD21-201ENST00000383953 95 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
USP43Q70EL4 RNU6-790P-201ENST00000384479 105 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
USP43Q70EL4 Y_RNA.581-201ENST00000391017 97 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
USP43Q70EL4 AL591034.2-201ENST00000402839 359 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
USP43Q70EL4 AL513475.1-201ENST00000406602 315 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
USP43Q70EL4 RNU6ATAC15P-201ENST00000408279 121 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
USP43Q70EL4 RNU2-20P-201ENST00000410425 191 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
USP43Q70EL4 RNU6-735P-201ENST00000410612 107 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
USP43Q70EL4 RNU6-1025P-201ENST00000410629 104 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
USP43Q70EL4 SNORD56-201ENST00000413522 71 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
USP43Q70EL4 TMEM167AP1-201ENST00000423409 219 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
USP43Q70EL4 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
USP43Q70EL4 AC097662.1-205ENST00000433324 241 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
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USP43Q70EL4 AC025750.2-201ENST00000442609 450 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
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USP43Q70EL4 HIGD1AP2-201ENST00000446367 280 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
USP43Q70EL4 AL445465.2-201ENST00000455530 461 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
USP43Q70EL4 AC107032.1-201ENST00000485945 480 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
USP43Q70EL4 AC137770.1-201ENST00000504620 530 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
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USP43Q70EL4 RNU6-1278P-201ENST00000516130 107 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
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USP43Q70EL4 AC002545.1-201ENST00000592511 181 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
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USP43Q70EL4 AC068631.1-219ENST00000625826 668 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
USP43Q70EL4 AL137790.1-201ENST00000634283 177 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
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USP43Q70EL4 LINC02555-201ENST00000563933 1951 ntBASIC2.58□□□□□ -2
USP43Q70EL4 RRAS2-211ENST00000537760 2034 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
USP43Q70EL4 Z75746.1-201ENST00000440243 2080 ntBASIC2.58□□□□□ -2
USP43Q70EL4 AC138915.1-201ENST00000565427 1685 ntBASIC2.58□□□□□ -2
USP43Q70EL4 Y_RNA.27-201ENST00000362540 103 ntBASIC2.58□□□□□ -2
USP43Q70EL4 SNORD14B-201ENST00000364533 90 ntBASIC2.58□□□□□ -2
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USP43Q70EL4 TTTY8B-202ENST00000455570 518 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
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USP43Q70EL4 RNU6-1-201ENST00000383898 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
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USP43Q70EL4 MIR493-201ENST00000385254 89 ntBASIC2.57□□□□□ -2
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USP43Q70EL4 AC092423.1-201ENST00000430165 186 ntBASIC2.57□□□□□ -2
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USP43Q70EL4 SCARNA24.2-201ENST00000516968 130 ntBASIC2.57□□□□□ -2
USP43Q70EL4 MIR3144-201ENST00000579460 79 ntBASIC2.57□□□□□ -2
USP43Q70EL4 MIR4672-201ENST00000583126 81 ntBASIC2.57□□□□□ -2
USP43Q70EL4 RNU6-6P-201ENST00000606623 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
USP43Q70EL4 AP002826.1-201ENST00000608835 315 ntBASIC2.57□□□□□ -2
USP43Q70EL4 CENPF-206ENST00000614578 528 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
USP43Q70EL4 U6.106-201ENST00000636360 105 ntBASIC2.57□□□□□ -2
USP43Q70EL4 U6.92-201ENST00000636464 89 ntBASIC2.57□□□□□ -2
USP43Q70EL4 DLD-214ENST00000639772 421 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
USP43Q70EL4 MAPK10-266ENST00000641066 6555 ntBASIC2.57□□□□□ -2
USP43Q70EL4 EFCAB3-202ENST00000450662 1694 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
USP43Q70EL4 ZNF299P-201ENST00000406845 1804 ntBASIC2.56□□□□□ -2
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