Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 AC008536.2-201ENST00000607284 349 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
C9orf135Q5VTT2 AC087683.2-201ENST00000611384 326 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
C9orf135Q5VTT2 MESTIT1_1.1-201ENST00000618871 140 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
C9orf135Q5VTT2 AL136221.1-201ENST00000621449 509 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
C9orf135Q5VTT2 AC023510.2-201ENST00000622162 746 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
C9orf135Q5VTT2 Metazoa_SRP.32-201ENST00000622685 286 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
C9orf135Q5VTT2 AC095038.3-201ENST00000634439 195 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
C9orf135Q5VTT2 MTND5P10-201ENST00000603719 1809 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
C9orf135Q5VTT2 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
C9orf135Q5VTT2 MIR150-201ENST00000385048 84 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.595-201ENST00000410403 105 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
C9orf135Q5VTT2 MTCO1P21-201ENST00000416634 589 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
C9orf135Q5VTT2 ARL5AP1-201ENST00000418991 388 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
C9orf135Q5VTT2 AC011243.1-201ENST00000420184 415 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
C9orf135Q5VTT2 MTCO2P11-201ENST00000431069 680 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
C9orf135Q5VTT2 AL358934.1-201ENST00000432346 324 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
C9orf135Q5VTT2 USP9YP28-201ENST00000435142 589 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
C9orf135Q5VTT2 PLCB1-IT1-201ENST00000441231 373 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
C9orf135Q5VTT2 AC132479.1-201ENST00000449160 144 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
C9orf135Q5VTT2 AF127577.5-201ENST00000449746 446 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
C9orf135Q5VTT2 AC009474.2-201ENST00000451383 136 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
C9orf135Q5VTT2 AL356010.1-201ENST00000456364 102 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
C9orf135Q5VTT2 HMGN2P9-201ENST00000476875 229 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
C9orf135Q5VTT2 AC079140.3-201ENST00000511111 550 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
C9orf135Q5VTT2 AC106744.2-201ENST00000513955 898 ntTSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
C9orf135Q5VTT2 AC091996.1-201ENST00000522274 600 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
C9orf135Q5VTT2 MTATP6P3-201ENST00000581686 676 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
C9orf135Q5VTT2 Z94722.1-201ENST00000604328 474 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
C9orf135Q5VTT2 AL357054.2-201ENST00000607644 423 ntTSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
C9orf135Q5VTT2 RNU6ATAC35P-201ENST00000609276 444 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
C9orf135Q5VTT2 AC010722.1-201ENST00000622595 582 ntTSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
C9orf135Q5VTT2 AP3S1-209ENST00000640413 489 ntTSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
C9orf135Q5VTT2 PDCL2-201ENST00000295645 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.23□□□□□ -2.21
C9orf135Q5VTT2 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
C9orf135Q5VTT2 RNU6-1019P-201ENST00000364424 107 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
C9orf135Q5VTT2 SNORA18.2-201ENST00000383865 132 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
C9orf135Q5VTT2 RNU6-877P-201ENST00000383868 107 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
C9orf135Q5VTT2 SNORD26-201ENST00000384147 75 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
C9orf135Q5VTT2 AC009411.1-202ENST00000412424 548 ntTSL 4 BASIC1.23□□□□□ -2.21
C9orf135Q5VTT2 AP1B1P2-201ENST00000416196 106 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
C9orf135Q5VTT2 MTATP6P18-201ENST00000417994 673 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
C9orf135Q5VTT2 RPS27P16-201ENST00000425758 201 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
C9orf135Q5VTT2 FTH1P12-201ENST00000432137 551 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
C9orf135Q5VTT2 MTND4P32-201ENST00000437189 1237 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
C9orf135Q5VTT2 AC108078.1-201ENST00000508073 725 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
C9orf135Q5VTT2 RNU6-1041P-201ENST00000516254 102 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
C9orf135Q5VTT2 HIF1AP1-201ENST00000553642 175 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
C9orf135Q5VTT2 AC007347.1-201ENST00000563879 281 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
C9orf135Q5VTT2 AC068790.2-201ENST00000602601 557 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
C9orf135Q5VTT2 BNIP3P10-201ENST00000605360 577 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
C9orf135Q5VTT2 CTHRC1P1-201ENST00000605383 469 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
C9orf135Q5VTT2 MIR3976-201ENST00000606807 139 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
C9orf135Q5VTT2 AC072046.2-201ENST00000618366 268 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
C9orf135Q5VTT2 HOXA11-AS1_4.1-201ENST00000620901 233 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
C9orf135Q5VTT2 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.23□□□□□ -2.21
C9orf135Q5VTT2 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
C9orf135Q5VTT2 ZNF404-202ENST00000587539 1851 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
C9orf135Q5VTT2 RNU6-545P-201ENST00000362681 104 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
C9orf135Q5VTT2 RNU6-1120P-201ENST00000362988 108 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.132-201ENST00000363421 102 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
C9orf135Q5VTT2 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
C9orf135Q5VTT2 RNU6-517P-201ENST00000384362 110 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
C9orf135Q5VTT2 RNU6-1093P-201ENST00000391194 107 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
C9orf135Q5VTT2 AL162725.2-201ENST00000430545 748 ntTSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
C9orf135Q5VTT2 AC005019.2-201ENST00000434321 359 ntTSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
C9orf135Q5VTT2 AL135790.2-201ENST00000437701 267 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
C9orf135Q5VTT2 AL031667.1-201ENST00000440222 725 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
C9orf135Q5VTT2 MTND1P27-201ENST00000451117 902 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
C9orf135Q5VTT2 AC091435.1-201ENST00000505442 584 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
C9orf135Q5VTT2 RPL39P5-202ENST00000512505 151 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
C9orf135Q5VTT2 RNA5SP481-201ENST00000516814 122 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
C9orf135Q5VTT2 RNU6-856P-201ENST00000516959 98 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
C9orf135Q5VTT2 AC022695.3-201ENST00000523385 478 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
C9orf135Q5VTT2 AP005597.4-201ENST00000526762 229 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
C9orf135Q5VTT2 DEFB131C-201ENST00000528817 165 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
C9orf135Q5VTT2 MDM2-232ENST00000544561 213 ntTSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
C9orf135Q5VTT2 AC084364.2-201ENST00000546924 395 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
C9orf135Q5VTT2 AC092378.2-202ENST00000569328 445 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
C9orf135Q5VTT2 RNASEH2B-AS1-206ENST00000601286 657 ntTSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
C9orf135Q5VTT2 MIR7974-201ENST00000615835 79 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
C9orf135Q5VTT2 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
C9orf135Q5VTT2 SEMG1-201ENST00000372781 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.22□□□□□ -2.21
C9orf135Q5VTT2 AC011604.2-202ENST00000540229 2451 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC1.22□□□□□ -2.21
C9orf135Q5VTT2 AC009541.1-201ENST00000438279 2662 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
C9orf135Q5VTT2 U8.1-201ENST00000362843 134 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.159-201ENST00000363674 87 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.255-201ENST00000364581 97 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
C9orf135Q5VTT2 SNORD73A-201ENST00000386062 65 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
C9orf135Q5VTT2 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
C9orf135Q5VTT2 ATP13A5-AS1-201ENST00000414634 476 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
C9orf135Q5VTT2 MTCYBP8-201ENST00000422855 651 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
C9orf135Q5VTT2 LINC02263-203ENST00000426240 515 ntTSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.22
C9orf135Q5VTT2 VN1R108P-201ENST00000431580 830 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
C9orf135Q5VTT2 AL603825.1-201ENST00000438481 80 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
C9orf135Q5VTT2 TRAPPC2P8-201ENST00000440676 396 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
C9orf135Q5VTT2 AC027119.1-201ENST00000440877 241 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
C9orf135Q5VTT2 MTCO2P3-201ENST00000442543 421 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
C9orf135Q5VTT2 TRAPPC2P3-201ENST00000443200 321 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
C9orf135Q5VTT2 OR2AQ1P-201ENST00000451972 200 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
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