Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 AC022306.2-201ENST00000617563 647 ntBASIC2□□□□□ -2.09
KNOP1Q1ED39 SNORD98-201ENST00000636377 67 ntBASIC2□□□□□ -2.09
KNOP1Q1ED39 MAP4K3-205ENST00000437545 3924 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
KNOP1Q1ED39 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC1.99□□□□□ -2.09
KNOP1Q1ED39 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.166-201ENST00000363730 102 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
KNOP1Q1ED39 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
KNOP1Q1ED39 LINC01077-201ENST00000452288 413 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
KNOP1Q1ED39 PCMTD1P1-201ENST00000455560 355 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
KNOP1Q1ED39 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
KNOP1Q1ED39 SNORA31.16-201ENST00000516773 139 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
KNOP1Q1ED39 SNORA48.11-201ENST00000517015 89 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
KNOP1Q1ED39 RNU6-586P-201ENST00000517265 104 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
KNOP1Q1ED39 LINC02155-201ENST00000519215 407 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
KNOP1Q1ED39 AC118273.2-201ENST00000532092 465 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
KNOP1Q1ED39 AC005909.1-201ENST00000577835 755 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
KNOP1Q1ED39 MIR3945-201ENST00000581853 98 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
KNOP1Q1ED39 MIR4448-201ENST00000584360 86 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
KNOP1Q1ED39 AC020910.1-201ENST00000599404 413 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
KNOP1Q1ED39 AL670379.2-201ENST00000604983 252 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
KNOP1Q1ED39 MIR3976-201ENST00000606807 139 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
KNOP1Q1ED39 UBE2E2-206ENST00000613545 282 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
KNOP1Q1ED39 AC008121.3-201ENST00000618726 433 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
KNOP1Q1ED39 AC010722.1-201ENST00000622595 582 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
KNOP1Q1ED39 AL359851.1-201ENST00000569460 4997 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
KNOP1Q1ED39 AC009541.1-201ENST00000438279 2662 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
KNOP1Q1ED39 RNU6-142P-201ENST00000384019 107 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.504-201ENST00000384481 104 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
KNOP1Q1ED39 RNU6-1274P-201ENST00000384557 107 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
KNOP1Q1ED39 MIR521-1-201ENST00000384902 87 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
KNOP1Q1ED39 MIR517A-201ENST00000385001 87 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
KNOP1Q1ED39 MIR29B2-201ENST00000385055 81 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
KNOP1Q1ED39 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
KNOP1Q1ED39 AL139396.1-201ENST00000421137 167 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
KNOP1Q1ED39 SIRPG-AS1-201ENST00000437384 410 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
KNOP1Q1ED39 AL591501.1-201ENST00000439992 495 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
KNOP1Q1ED39 DAP3P1-201ENST00000441522 278 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
KNOP1Q1ED39 RN7SL429P-201ENST00000479090 223 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
KNOP1Q1ED39 RN7SL489P-201ENST00000486185 223 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
KNOP1Q1ED39 RPS27P21-201ENST00000486977 252 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
KNOP1Q1ED39 RN7SL327P-201ENST00000488659 223 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
KNOP1Q1ED39 CKS1BP2-201ENST00000497342 240 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
KNOP1Q1ED39 MTND5P5-201ENST00000503764 376 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.682-201ENST00000516457 100 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
KNOP1Q1ED39 RNU7-30P-201ENST00000516835 62 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
KNOP1Q1ED39 LINC02095-202ENST00000543512 323 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
KNOP1Q1ED39 AC012435.2-201ENST00000562869 361 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
KNOP1Q1ED39 MIR4419B-201ENST00000577260 68 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
KNOP1Q1ED39 MIR4790-201ENST00000577799 79 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
KNOP1Q1ED39 AL078605.1-201ENST00000603529 500 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
KNOP1Q1ED39 AL355297.2-201ENST00000604792 129 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
KNOP1Q1ED39 RN7SL853P-201ENST00000617250 223 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
KNOP1Q1ED39 AC090517.3-201ENST00000625170 141 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
KNOP1Q1ED39 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
KNOP1Q1ED39 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
KNOP1Q1ED39 RNU4-15P-201ENST00000362613 141 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.123-201ENST00000363338 102 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
KNOP1Q1ED39 RNU6-784P-201ENST00000384330 106 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
KNOP1Q1ED39 RNU6-790P-201ENST00000384479 105 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
KNOP1Q1ED39 AL591034.2-201ENST00000402839 359 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
KNOP1Q1ED39 MIR548K-201ENST00000408406 116 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
KNOP1Q1ED39 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
KNOP1Q1ED39 LINC01853-201ENST00000417715 444 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
KNOP1Q1ED39 PDCL2P1-201ENST00000419302 352 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
KNOP1Q1ED39 LANCL1-AS1-203ENST00000433296 864 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
KNOP1Q1ED39 GPM6BP3-201ENST00000442797 145 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
KNOP1Q1ED39 AL354949.1-201ENST00000446438 170 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
KNOP1Q1ED39 AC055764.1-201ENST00000454526 473 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
KNOP1Q1ED39 AC055731.1-201ENST00000474387 401 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
KNOP1Q1ED39 AC104564.1-201ENST00000493028 407 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
KNOP1Q1ED39 HMGN1P12-201ENST00000499125 195 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
KNOP1Q1ED39 AC100801.1-202ENST00000518266 371 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
KNOP1Q1ED39 AC021785.1-201ENST00000520780 453 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
KNOP1Q1ED39 AC087664.2-201ENST00000522898 551 ntTSL 4 BASIC1.97□□□□□ -2.09
KNOP1Q1ED39 AC016256.1-201ENST00000547971 354 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
KNOP1Q1ED39 AC021231.3-201ENST00000558497 370 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
KNOP1Q1ED39 ANP32BP3-201ENST00000559213 706 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
KNOP1Q1ED39 AC007347.1-201ENST00000563879 281 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
KNOP1Q1ED39 AC092070.3-201ENST00000596041 337 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
KNOP1Q1ED39 AC124303.1-201ENST00000605703 360 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
KNOP1Q1ED39 AC019193.3-201ENST00000609144 554 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
KNOP1Q1ED39 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
KNOP1Q1ED39 KPNA2P1-201ENST00000458289 1591 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
KNOP1Q1ED39 CENPCP1-201ENST00000533085 2578 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
KNOP1Q1ED39 AGR3-201ENST00000310398 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.88-201ENST00000363029 99 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.303-201ENST00000364998 94 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.339-201ENST00000365325 102 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
KNOP1Q1ED39 SNORA36A-201ENST00000384221 132 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
KNOP1Q1ED39 RNU6-306P-201ENST00000384617 107 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
KNOP1Q1ED39 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
KNOP1Q1ED39 SNRPG-202ENST00000413456 398 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
KNOP1Q1ED39 SNRPG-205ENST00000449935 428 ntTSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
KNOP1Q1ED39 AC010420.1-201ENST00000515077 509 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
KNOP1Q1ED39 AC069133.1-201ENST00000522857 566 ntTSL 4 BASIC1.96□□□□□ -2.1
KNOP1Q1ED39 AC011092.2-201ENST00000533659 586 ntTSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
KNOP1Q1ED39 LINC02442-201ENST00000537732 343 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
KNOP1Q1ED39 AC008083.3-202ENST00000552063 277 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
KNOP1Q1ED39 FGF7P1-201ENST00000582820 288 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
KNOP1Q1ED39 MIR4298-201ENST00000584380 73 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
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