Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 AC008568.2-201ENST00000623862 2313 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CCDC142Q17RM4 DEFB108F-201ENST00000344638 222 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CCDC142Q17RM4 RNU6-1301P-201ENST00000362724 104 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.82-201ENST00000363000 102 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.92-201ENST00000363043 102 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.235-201ENST00000364412 102 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.261-201ENST00000364631 102 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CCDC142Q17RM4 SNORA51.4-201ENST00000364993 124 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.306-201ENST00000365015 102 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.308-201ENST00000365043 101 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.312-201ENST00000365089 102 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.322-201ENST00000365151 102 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.353-201ENST00000365440 108 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.441-201ENST00000384123 112 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CCDC142Q17RM4 RNU6-658P-201ENST00000384606 106 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.586-201ENST00000391146 98 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.590-201ENST00000410140 107 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CCDC142Q17RM4 RNU2-61P-201ENST00000411069 191 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CCDC142Q17RM4 AL138962.1-201ENST00000417987 411 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CCDC142Q17RM4 AL358453.1-201ENST00000422522 250 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CCDC142Q17RM4 PPP1R11P2-201ENST00000423543 382 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CCDC142Q17RM4 AC022018.1-201ENST00000430685 241 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CCDC142Q17RM4 AL162725.1-201ENST00000435405 301 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CCDC142Q17RM4 AC107083.1-201ENST00000439643 279 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.650-201ENST00000459002 102 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.638-201ENST00000459374 113 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CCDC142Q17RM4 AP004217.1-201ENST00000480579 346 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CCDC142Q17RM4 AC110767.1-201ENST00000508374 239 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CCDC142Q17RM4 RN7SKP132-201ENST00000516001 208 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CCDC142Q17RM4 RN7SKP282-201ENST00000516824 299 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CCDC142Q17RM4 RNU2-31P-201ENST00000516954 155 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.777-201ENST00000516982 102 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CCDC142Q17RM4 CASP1P1-201ENST00000526345 212 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CCDC142Q17RM4 DEFB131B-201ENST00000530210 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
CCDC142Q17RM4 AC079600.2-201ENST00000550076 130 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CCDC142Q17RM4 AC103996.1-201ENST00000555468 102 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.771-201ENST00000598668 102 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CCDC142Q17RM4 MIR6130-201ENST00000619419 109 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.789-201ENST00000622480 102 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CCDC142Q17RM4 AC091895.1-201ENST00000624494 256 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CCDC142Q17RM4 GABRG2-221ENST00000639683 3600 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CCDC142Q17RM4 CYSLTR1-201ENST00000373304 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
CCDC142Q17RM4 FAM35BP-202ENST00000497389 3337 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CCDC142Q17RM4 SIRT1-202ENST00000403579 3333 ntTSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
CCDC142Q17RM4 AC000403.1-201ENST00000613696 3585 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CCDC142Q17RM4 RNU6-384P-201ENST00000364900 104 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CCDC142Q17RM4 RNU6-326P-201ENST00000365480 107 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CCDC142Q17RM4 RNU6-926P-201ENST00000384075 107 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CCDC142Q17RM4 SNORD56-201ENST00000413522 71 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CCDC142Q17RM4 AL096701.2-201ENST00000416920 238 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CCDC142Q17RM4 AL035461.1-201ENST00000421490 332 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CCDC142Q17RM4 MTCO1P5-201ENST00000433573 344 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CCDC142Q17RM4 CR769767.1-201ENST00000436337 346 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CCDC142Q17RM4 RPL26P6-201ENST00000440913 438 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CCDC142Q17RM4 RPS29P12-201ENST00000460178 152 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CCDC142Q17RM4 RPS29P27-201ENST00000463711 170 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CCDC142Q17RM4 AC097462.2-201ENST00000504623 481 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CCDC142Q17RM4 RNA5SP76-201ENST00000516277 87 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CCDC142Q17RM4 SNORA70.16-201ENST00000516390 95 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
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CCDC142Q17RM4 AC091144.1-201ENST00000519573 138 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CCDC142Q17RM4 AC023442.3-201ENST00000532199 495 ntTSL 2 BASIC3.11□□□□□ -1.91
CCDC142Q17RM4 AC025271.3-201ENST00000563031 255 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
CCDC142Q17RM4 AC104581.2-201ENST00000572227 430 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CCDC142Q17RM4 AC011933.3-201ENST00000578226 372 ntTSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
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CCDC142Q17RM4 Z99571.1-201ENST00000636677 394 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CCDC142Q17RM4 AC135776.4-201ENST00000624300 1904 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CCDC142Q17RM4 IL33-203ENST00000456383 2501 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
CCDC142Q17RM4 CYLC2-202ENST00000487798 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
CCDC142Q17RM4 HIF1A-201ENST00000323441 3555 ntTSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
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CCDC142Q17RM4 RNU6-153P-201ENST00000364422 104 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.272-201ENST00000364696 102 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CCDC142Q17RM4 DYNLT3P1-201ENST00000378574 347 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CCDC142Q17RM4 SNORD63-201ENST00000384262 68 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CCDC142Q17RM4 SNORD78.2-201ENST00000391076 69 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CCDC142Q17RM4 AL590004.2-201ENST00000404787 371 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CCDC142Q17RM4 RNU2-43P-201ENST00000410306 190 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CCDC142Q17RM4 LINC01402-201ENST00000422226 279 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
CCDC142Q17RM4 AL592045.1-201ENST00000429867 352 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CCDC142Q17RM4 AL135923.2-201ENST00000435444 501 ntTSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
CCDC142Q17RM4 Z82188.1-201ENST00000436709 154 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CCDC142Q17RM4 NDUFB4P6-201ENST00000436819 366 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CCDC142Q17RM4 RN7SKP210-201ENST00000459176 261 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CCDC142Q17RM4 TOMM22P6-201ENST00000465035 409 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CCDC142Q17RM4 AC114982.1-201ENST00000469402 321 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CCDC142Q17RM4 ANXA2P1-201ENST00000505539 926 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CCDC142Q17RM4 LNX1-AS1-203ENST00000511989 488 ntTSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
CCDC142Q17RM4 AC091826.1-201ENST00000514065 313 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CCDC142Q17RM4 AC010420.1-201ENST00000515077 509 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
CCDC142Q17RM4 RNU5F-8P-201ENST00000515941 111 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CCDC142Q17RM4 MIR892C-201ENST00000516410 77 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CCDC142Q17RM4 AC022809.1-201ENST00000579247 428 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
CCDC142Q17RM4 DLD-214ENST00000639772 421 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
CCDC142Q17RM4 KIAA1107-202ENST00000636278 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
CCDC142Q17RM4 KBTBD3-207ENST00000534815 3396 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.343-201ENST00000365354 112 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.580-201ENST00000391004 95 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
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