Protein–RNA interactions for Protein: Q16363

LAMA4, Laminin subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,823 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA4Q16363 HSPE1P9-201ENST00000440046 311 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
LAMA4Q16363 MTCO1P44-201ENST00000441935 243 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
LAMA4Q16363 PRPS1P1-201ENST00000445305 876 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
LAMA4Q16363 AC074124.1-201ENST00000502368 375 ntTSL 3 BASIC0.45□□□□□ -2.34
LAMA4Q16363 AC008852.1-201ENST00000510198 451 ntTSL 2 BASIC0.45□□□□□ -2.34
LAMA4Q16363 AC004054.1-201ENST00000515111 270 ntTSL 3 BASIC0.45□□□□□ -2.34
LAMA4Q16363 SUMO2P16-201ENST00000519475 264 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
LAMA4Q16363 AC022695.3-201ENST00000523385 478 ntTSL 3 BASIC0.45□□□□□ -2.34
LAMA4Q16363 LINC02235-201ENST00000534675 466 ntTSL 5 BASIC0.45□□□□□ -2.34
LAMA4Q16363 AC019288.1-201ENST00000557918 224 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
LAMA4Q16363 AC021231.3-201ENST00000558497 370 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
LAMA4Q16363 HMGN1P30-201ENST00000589286 268 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
LAMA4Q16363 AC023932.2-201ENST00000603176 175 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
LAMA4Q16363 AC242498.1-201ENST00000604134 111 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
LAMA4Q16363 MIR3976-201ENST00000606807 139 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
LAMA4Q16363 AP000240.1-201ENST00000609910 452 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
LAMA4Q16363 PCGEM1.1-201ENST00000613431 131 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
LAMA4Q16363 RMST_4.1-201ENST00000616886 107 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
LAMA4Q16363 AC243994.1-201ENST00000618627 109 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
LAMA4Q16363 FAS-AS1.2-201ENST00000620386 170 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
LAMA4Q16363 RNU6-23P-201ENST00000363283 107 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
LAMA4Q16363 RNY1P12-201ENST00000364251 105 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
LAMA4Q16363 RNU6-108P-201ENST00000365558 107 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
LAMA4Q16363 CRISP3-203ENST00000371159 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.45□□□□□ -2.34
LAMA4Q16363 RNU6-157P-201ENST00000383957 107 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
LAMA4Q16363 RNU6-39P-201ENST00000384344 107 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
LAMA4Q16363 MIR520A-201ENST00000384862 85 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
LAMA4Q16363 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
LAMA4Q16363 RNU2-8P-201ENST00000410727 190 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
LAMA4Q16363 AL137856.1-202ENST00000418238 422 ntTSL 3 BASIC0.45□□□□□ -2.34
LAMA4Q16363 EIF1P1-201ENST00000421436 341 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
LAMA4Q16363 AL121957.1-201ENST00000441532 338 ntTSL 2 BASIC0.45□□□□□ -2.34
LAMA4Q16363 AC091212.1-201ENST00000474798 395 ntTSL 5 BASIC0.45□□□□□ -2.34
LAMA4Q16363 RPS27P22-201ENST00000478056 241 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
LAMA4Q16363 AC022447.4-201ENST00000504053 364 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
LAMA4Q16363 AC112206.4-201ENST00000515142 405 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
LAMA4Q16363 SNORA3.4-201ENST00000515969 96 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
LAMA4Q16363 RNU6-1146P-201ENST00000516282 102 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
LAMA4Q16363 AC022616.6-201ENST00000520479 119 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
LAMA4Q16363 AC136628.3-201ENST00000521868 290 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
LAMA4Q16363 AC115990.1-201ENST00000526957 301 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
LAMA4Q16363 MTATP6P15-201ENST00000527233 835 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
LAMA4Q16363 CARD18-202ENST00000530950 652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.45□□□□□ -2.34
LAMA4Q16363 AP002453.2-201ENST00000533503 320 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
LAMA4Q16363 AC023050.3-201ENST00000541142 333 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
LAMA4Q16363 AL442163.3-201ENST00000554110 156 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
LAMA4Q16363 PWRN1-203ENST00000564898 389 ntTSL 5 BASIC0.45□□□□□ -2.34
LAMA4Q16363 TMF1P1-201ENST00000576058 373 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
LAMA4Q16363 AC025887.1-201ENST00000578349 264 ntTSL 3 BASIC0.45□□□□□ -2.34
LAMA4Q16363 DAOA-AS1_2.1-201ENST00000614829 187 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
LAMA4Q16363 AL607023.1-201ENST00000620045 248 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
LAMA4Q16363 MIR8063-201ENST00000621930 81 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
LAMA4Q16363 AC006927.3-201ENST00000638789 384 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
LAMA4Q16363 PDCL2-201ENST00000295645 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.44□□□□□ -2.34
LAMA4Q16363 U3.8-201ENST00000363675 217 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
LAMA4Q16363 RNU4-68P-201ENST00000364314 141 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
LAMA4Q16363 SNORA25-201ENST00000384384 134 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
LAMA4Q16363 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC0.44□□□□□ -2.34
LAMA4Q16363 NPS-201ENST00000398023 270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.44□□□□□ -2.34
LAMA4Q16363 RPS29P13-201ENST00000402041 169 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
LAMA4Q16363 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
LAMA4Q16363 AC105271.1-202ENST00000411417 445 ntTSL 3 BASIC0.44□□□□□ -2.34
LAMA4Q16363 ARL5AP1-201ENST00000418991 388 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
LAMA4Q16363 AC009299.3-201ENST00000421122 1072 ntTSL 3 BASIC0.44□□□□□ -2.34
LAMA4Q16363 AC060773.1-201ENST00000421698 310 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
LAMA4Q16363 AL593851.1-201ENST00000426171 157 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
LAMA4Q16363 AL365184.2-201ENST00000431139 435 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
LAMA4Q16363 AC084290.1-201ENST00000434995 374 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
LAMA4Q16363 UPP2-IT1-201ENST00000439185 357 ntTSL 3 BASIC0.44□□□□□ -2.34
LAMA4Q16363 AC073910.1-201ENST00000445047 438 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
LAMA4Q16363 AC131571.1-202ENST00000454509 598 ntTSL 4 BASIC0.44□□□□□ -2.34
LAMA4Q16363 AC079382.1-201ENST00000493346 557 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
LAMA4Q16363 AC008539.1-201ENST00000507653 482 ntTSL 3 BASIC0.44□□□□□ -2.34
LAMA4Q16363 RNU6-1098P-201ENST00000516772 96 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
LAMA4Q16363 AC090124.1-201ENST00000525097 448 ntTSL 3 BASIC0.44□□□□□ -2.34
LAMA4Q16363 CCDC7-209ENST00000539197 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.44□□□□□ -2.34
LAMA4Q16363 AC093012.1-201ENST00000552999 446 ntTSL 3 BASIC0.44□□□□□ -2.34
LAMA4Q16363 AC002400.1-201ENST00000569310 726 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
LAMA4Q16363 MIR548AC-201ENST00000585049 88 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
LAMA4Q16363 Z99289.3-201ENST00000605586 594 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
LAMA4Q16363 AL391834.2-201ENST00000609982 546 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
LAMA4Q16363 C8orf59-207ENST00000611854 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.44□□□□□ -2.34
LAMA4Q16363 AC005520.5-201ENST00000613926 164 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
LAMA4Q16363 AC068205.3-201ENST00000636385 468 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
LAMA4Q16363 GLMN-201ENST00000370360 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.44□□□□□ -2.34
LAMA4Q16363 AL391516.1-201ENST00000554380 2449 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
LAMA4Q16363 SAMD9-203ENST00000620985 6754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.44□□□□□ -2.34
LAMA4Q16363 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
LAMA4Q16363 RNU4-28P-201ENST00000364739 141 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
LAMA4Q16363 RNA5SP467-201ENST00000391274 118 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
LAMA4Q16363 MTCYBP36-201ENST00000404146 440 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
LAMA4Q16363 AC006461.1-201ENST00000412637 326 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
LAMA4Q16363 RPL23AP95-201ENST00000426806 265 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
LAMA4Q16363 AL669831.1-202ENST00000428504 417 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
LAMA4Q16363 AL359081.1-201ENST00000432083 615 ntTSL 2 BASIC0.43□□□□□ -2.34
LAMA4Q16363 MTCYBP39-201ENST00000437562 491 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
LAMA4Q16363 AC027119.1-201ENST00000440877 241 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
LAMA4Q16363 SNRPGP7-201ENST00000469016 106 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
LAMA4Q16363 RNA5SP121-201ENST00000516537 101 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
LAMA4Q16363 MDM2-221ENST00000517852 393 ntTSL 1 (best) BASIC0.43□□□□□ -2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.1 ms