Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 AC090525.1-201ENST00000479116 478 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CNGA3Q16281 AC012055.2-201ENST00000504167 335 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CNGA3Q16281 RNU5F-2P-201ENST00000516066 82 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CNGA3Q16281 RNU6-475P-201ENST00000516073 104 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CNGA3Q16281 Y_RNA.720-201ENST00000517166 92 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CNGA3Q16281 AC016256.1-201ENST00000547971 354 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CNGA3Q16281 HSBP1P1-201ENST00000555205 166 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CNGA3Q16281 AC006600.1-201ENST00000572529 153 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CNGA3Q16281 MIR5188-201ENST00000583467 113 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CNGA3Q16281 7SK.7-201ENST00000603504 247 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CNGA3Q16281 AC100812.1-201ENST00000607622 580 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CNGA3Q16281 AC096772.1-201ENST00000609146 564 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CNGA3Q16281 uc_338.14-201ENST00000613162 166 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CNGA3Q16281 DPY19L2P1-203ENST00000458672 3347 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
CNGA3Q16281 ELF1-201ENST00000239882 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
CNGA3Q16281 OR2J3-203ENST00000641960 3342 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CNGA3Q16281 CHD1-201ENST00000284049 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
CNGA3Q16281 OR4K2-204ENST00000641885 8681 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CNGA3Q16281 ZMYM1-201ENST00000359858 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
CNGA3Q16281 Y_RNA.106-201ENST00000363189 100 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CNGA3Q16281 RNU6-450P-201ENST00000364654 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CNGA3Q16281 RNU6-17P-201ENST00000384245 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CNGA3Q16281 Y_RNA.459-201ENST00000384251 102 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CNGA3Q16281 RNU6-18P-201ENST00000384527 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CNGA3Q16281 MIR592-201ENST00000384959 97 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CNGA3Q16281 MIR634-201ENST00000385208 97 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CNGA3Q16281 SNORA69.1-201ENST00000390904 137 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CNGA3Q16281 AL512633.1-201ENST00000399931 655 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CNGA3Q16281 Y_RNA.592-201ENST00000410274 109 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CNGA3Q16281 CYCSP48-201ENST00000417124 323 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CNGA3Q16281 AL590135.1-201ENST00000422215 156 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CNGA3Q16281 AC019205.3-201ENST00000424573 156 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CNGA3Q16281 AC016700.2-201ENST00000446011 156 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CNGA3Q16281 U8.22-201ENST00000459141 133 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CNGA3Q16281 AC117394.2-201ENST00000487827 323 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CNGA3Q16281 RPL22P13-201ENST00000493291 347 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CNGA3Q16281 AC015911.1-201ENST00000495111 156 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CNGA3Q16281 AC020703.1-201ENST00000505051 521 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CNGA3Q16281 RNA5SP356-201ENST00000515972 94 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CNGA3Q16281 RNU6-764P-201ENST00000516396 105 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CNGA3Q16281 Y_RNA.706-201ENST00000516933 99 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CNGA3Q16281 AC083973.1-205ENST00000518994 601 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CNGA3Q16281 AC144568.1-201ENST00000520139 137 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CNGA3Q16281 AC021231.3-201ENST00000558497 370 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CNGA3Q16281 DLEU2_6.1-201ENST00000610536 112 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CNGA3Q16281 AL132822.1-201ENST00000617063 513 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CNGA3Q16281 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CNGA3Q16281 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CNGA3Q16281 SNORA5B-201ENST00000363786 132 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CNGA3Q16281 Y_RNA.358-201ENST00000365491 99 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CNGA3Q16281 SET-203ENST00000372688 801 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CNGA3Q16281 U8.10-201ENST00000384260 133 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CNGA3Q16281 NPS-201ENST00000398023 270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CNGA3Q16281 RNA5SP21-201ENST00000410917 96 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CNGA3Q16281 AC007064.1-201ENST00000412238 351 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CNGA3Q16281 AIMP1P2-201ENST00000425294 312 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CNGA3Q16281 AL358075.3-201ENST00000426289 226 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CNGA3Q16281 RPS15AP7-201ENST00000439294 405 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CNGA3Q16281 TSPY5P-202ENST00000456541 142 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CNGA3Q16281 MTND5P22-201ENST00000458380 195 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CNGA3Q16281 RNU7-87P-201ENST00000459343 62 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CNGA3Q16281 snoU13.14-201ENST00000459372 104 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CNGA3Q16281 RPL36AP48-201ENST00000485521 314 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CNGA3Q16281 AC008115.2-201ENST00000539988 241 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CNGA3Q16281 AC079598.5-201ENST00000547460 117 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CNGA3Q16281 PWRN1-209ENST00000568019 359 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CNGA3Q16281 MYL12BP1-201ENST00000569826 507 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CNGA3Q16281 Z98751.3-201ENST00000604447 521 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CNGA3Q16281 RMST_6.1-201ENST00000611980 203 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CNGA3Q16281 Z84484.1-202ENST00000612718 60 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CNGA3Q16281 U2.1-201ENST00000618978 145 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CNGA3Q16281 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CNGA3Q16281 SNORD98-201ENST00000636377 67 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CNGA3Q16281 ANKRD18EP-201ENST00000405487 2632 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CNGA3Q16281 AP000560.1-201ENST00000624150 1937 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CNGA3Q16281 FOXP2-210ENST00000403559 6415 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CNGA3Q16281 GLMN-201ENST00000370360 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
CNGA3Q16281 MAPK10-266ENST00000641066 6555 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CNGA3Q16281 RNU6-222P-201ENST00000362438 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CNGA3Q16281 SNORD115-32-201ENST00000364079 82 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CNGA3Q16281 Y_RNA.455-201ENST00000384230 98 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CNGA3Q16281 MIR186-201ENST00000384988 86 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CNGA3Q16281 AL356057.3-201ENST00000402607 340 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CNGA3Q16281 AL592435.1-201ENST00000416401 469 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CNGA3Q16281 AL353680.1-201ENST00000433788 337 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CNGA3Q16281 AC112220.1-201ENST00000434628 355 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CNGA3Q16281 AL592309.2-201ENST00000444647 607 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CNGA3Q16281 RPL31P41-201ENST00000477967 372 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CNGA3Q16281 AC105389.2-201ENST00000506475 435 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CNGA3Q16281 SNORA40.14-201ENST00000516543 86 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CNGA3Q16281 RNA5SP82-201ENST00000516707 92 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CNGA3Q16281 AC115990.1-201ENST00000526957 301 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CNGA3Q16281 AP005436.2-201ENST00000528458 252 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CNGA3Q16281 MIR4319-201ENST00000577285 85 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CNGA3Q16281 AC113195.1-201ENST00000579952 141 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CNGA3Q16281 VN1R91P-201ENST00000594377 169 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CNGA3Q16281 DDIAS-201ENST00000329143 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
CNGA3Q16281 ZNF271P-202ENST00000465539 1970 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CNGA3Q16281 SKIL-203ENST00000426052 2757 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CNGA3Q16281 CCDC66-201ENST00000326595 3027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.1 ms