Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 RNU6-413P-201ENST00000384115 107 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
NEDD8Q15843 Y_RNA.472-201ENST00000384322 102 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
NEDD8Q15843 RNU6-1235P-201ENST00000384559 107 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
NEDD8Q15843 MIR660-201ENST00000385235 97 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
NEDD8Q15843 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
NEDD8Q15843 RNA5SP467-201ENST00000391274 118 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
NEDD8Q15843 MIR300-201ENST00000401138 83 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
NEDD8Q15843 MIR1295A-201ENST00000408463 79 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
NEDD8Q15843 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
NEDD8Q15843 AC244098.3-201ENST00000424803 96 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
NEDD8Q15843 AC000111.3-201ENST00000433478 193 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
NEDD8Q15843 MTND1P12-201ENST00000455231 147 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
NEDD8Q15843 snoU13.25-201ENST00000458945 104 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
NEDD8Q15843 RNU6-498P-201ENST00000459468 107 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
NEDD8Q15843 AC104663.1-201ENST00000508555 557 ntTSL 2 BASIC0.12□□□□□ -2.39
NEDD8Q15843 AC093206.1-201ENST00000515364 497 ntTSL 3 BASIC0.12□□□□□ -2.39
NEDD8Q15843 AC106038.2-201ENST00000520706 568 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
NEDD8Q15843 LINC02301-203ENST00000555798 789 ntTSL 3 BASIC0.12□□□□□ -2.39
NEDD8Q15843 PWRN1-203ENST00000564898 389 ntTSL 5 BASIC0.12□□□□□ -2.39
NEDD8Q15843 AC090517.1-201ENST00000569307 266 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
NEDD8Q15843 MIR4307-201ENST00000582802 84 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
NEDD8Q15843 AL356157.2-201ENST00000605122 111 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
NEDD8Q15843 AL359821.1-201ENST00000605519 182 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
NEDD8Q15843 snoU13.31-201ENST00000607291 104 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
NEDD8Q15843 AL355512.1-202ENST00000607952 209 ntTSL 5 BASIC0.12□□□□□ -2.39
NEDD8Q15843 AC104458.1-201ENST00000608243 463 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
NEDD8Q15843 AC243829.6-201ENST00000612652 106 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
NEDD8Q15843 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
NEDD8Q15843 AL589740.1-207ENST00000607823 1962 ntTSL 5 BASIC0.12□□□□□ -2.39
NEDD8Q15843 RNU6-562P-201ENST00000362731 107 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
NEDD8Q15843 RNU6-336P-201ENST00000364891 107 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
NEDD8Q15843 RNU6-417P-201ENST00000384712 107 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
NEDD8Q15843 MIR216A-201ENST00000385063 110 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
NEDD8Q15843 ERHP2-201ENST00000402323 299 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
NEDD8Q15843 AL355796.1-201ENST00000406706 323 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
NEDD8Q15843 C5orf58-201ENST00000421269 406 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC0.11□□□□□ -2.39
NEDD8Q15843 AC012445.1-201ENST00000442831 607 ntTSL 3 BASIC0.11□□□□□ -2.39
NEDD8Q15843 AC013470.1-201ENST00000453438 462 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
NEDD8Q15843 AC005062.1-201ENST00000457921 566 ntTSL 3 BASIC0.11□□□□□ -2.39
NEDD8Q15843 SNRPGP7-201ENST00000469016 106 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
NEDD8Q15843 LINC01323-201ENST00000486767 576 ntTSL 3 BASIC0.11□□□□□ -2.39
NEDD8Q15843 AC022493.2-201ENST00000506122 481 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
NEDD8Q15843 AC112206.4-201ENST00000515142 405 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
NEDD8Q15843 RNU6-947P-201ENST00000516264 106 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
NEDD8Q15843 XIRP2-AS1-201ENST00000525330 776 ntTSL 3 BASIC0.11□□□□□ -2.39
NEDD8Q15843 AC008521.1-201ENST00000587471 187 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
NEDD8Q15843 AL359740.1-201ENST00000624340 592 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
NEDD8Q15843 RNU6-1327P-201ENST00000365302 105 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
NEDD8Q15843 RNU6-975P-201ENST00000384296 105 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
NEDD8Q15843 SNAP23P1-201ENST00000433229 246 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
NEDD8Q15843 ZNF736P1Y-201ENST00000440402 1276 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
NEDD8Q15843 AC099566.1-201ENST00000442558 479 ntTSL 3 BASIC0.1□□□□□ -2.39
NEDD8Q15843 AC025918.1-201ENST00000452467 383 ntTSL 3 BASIC0.1□□□□□ -2.39
NEDD8Q15843 AC245047.8-201ENST00000456455 284 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
NEDD8Q15843 AC022364.2-201ENST00000457963 554 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
NEDD8Q15843 RBBP4P6-201ENST00000508098 202 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
NEDD8Q15843 AC116353.3-201ENST00000511215 249 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
NEDD8Q15843 RNU6-377P-201ENST00000515965 102 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
NEDD8Q15843 RNU6-917P-201ENST00000516294 104 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
NEDD8Q15843 RNU6-948P-201ENST00000516374 107 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
NEDD8Q15843 MIR5692A1-201ENST00000580523 69 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
NEDD8Q15843 Z99289.3-201ENST00000605586 594 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
NEDD8Q15843 C8orf59-207ENST00000611854 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.1□□□□□ -2.39
NEDD8Q15843 AC243829.3-201ENST00000622177 108 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
NEDD8Q15843 LINC02033-202ENST00000623312 492 ntTSL 3 BASIC0.1□□□□□ -2.39
NEDD8Q15843 AL157786.1-207ENST00000627771 695 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
NEDD8Q15843 PDCL2-201ENST00000295645 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.09□□□□□ -2.4
NEDD8Q15843 RNU6-349P-201ENST00000362402 107 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
NEDD8Q15843 RNU6-552P-201ENST00000362869 119 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
NEDD8Q15843 RNU6-199P-201ENST00000362954 107 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
NEDD8Q15843 SNORA24.1-201ENST00000384401 135 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
NEDD8Q15843 RPS29P13-201ENST00000402041 169 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
NEDD8Q15843 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
NEDD8Q15843 AC018511.2-201ENST00000413431 189 ntTSL 3 BASIC0.09□□□□□ -2.4
NEDD8Q15843 AC016717.1-201ENST00000448918 286 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
NEDD8Q15843 AL358176.1-201ENST00000457477 357 ntTSL 5 BASIC0.09□□□□□ -2.4
NEDD8Q15843 RNU6-1146P-201ENST00000516282 102 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
NEDD8Q15843 RNU6-1069P-201ENST00000516612 133 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
NEDD8Q15843 RNA5SP102-201ENST00000516865 106 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
NEDD8Q15843 AC027419.1-201ENST00000522976 328 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
NEDD8Q15843 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
NEDD8Q15843 AC017083.3-201ENST00000609955 700 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
NEDD8Q15843 AL391903.3-201ENST00000612158 163 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
NEDD8Q15843 AC073349.3-201ENST00000617616 186 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
NEDD8Q15843 AP000484.1-201ENST00000620067 1252 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
NEDD8Q15843 AC126544.2-201ENST00000625174 749 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
NEDD8Q15843 MPP6-209ENST00000625307 126 ntTSL 5 BASIC0.09□□□□□ -2.4
NEDD8Q15843 ZNF736P9Y-201ENST00000439586 1345 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
NEDD8Q15843 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC0.09□□□□□ -2.4
NEDD8Q15843 C18orf54-201ENST00000300091 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.08□□□□□ -2.4
NEDD8Q15843 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.08□□□□□ -2.4
NEDD8Q15843 SNORD56.2-201ENST00000363242 71 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
NEDD8Q15843 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC0.08□□□□□ -2.4
NEDD8Q15843 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
NEDD8Q15843 AL391863.2-201ENST00000411838 681 ntTSL 2 BASIC0.08□□□□□ -2.4
NEDD8Q15843 MRPS18CP6-201ENST00000423587 223 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
NEDD8Q15843 AC005019.2-201ENST00000434321 359 ntTSL 5 BASIC0.08□□□□□ -2.4
NEDD8Q15843 BTBD7P2-201ENST00000441962 620 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
NEDD8Q15843 AL136972.1-201ENST00000443471 351 ntTSL 3 BASIC0.08□□□□□ -2.4
NEDD8Q15843 PLCH1-AS2-201ENST00000472913 408 ntTSL 2 BASIC0.08□□□□□ -2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113 ms