Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 Y_RNA.333-201ENST00000365274 102 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
VAMP3Q15836 RNU6-975P-201ENST00000384296 105 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
VAMP3Q15836 MIR483-201ENST00000385070 76 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
VAMP3Q15836 RNU2-64P-201ENST00000411315 191 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
VAMP3Q15836 AC063976.4-201ENST00000421971 163 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
VAMP3Q15836 AL049637.1-201ENST00000424664 503 ntTSL 5 BASIC0.77□□□□□ -2.29
VAMP3Q15836 RPL31P35-201ENST00000431058 377 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
VAMP3Q15836 AC133865.1-201ENST00000438619 339 ntTSL 3 BASIC0.77□□□□□ -2.29
VAMP3Q15836 RPS4XP11-201ENST00000446897 772 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
VAMP3Q15836 AL139147.1-201ENST00000502413 1156 ntTSL 2 BASIC0.77□□□□□ -2.29
VAMP3Q15836 PDCD5P2-201ENST00000507570 312 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
VAMP3Q15836 AC111194.2-201ENST00000511222 455 ntTSL 5 BASIC0.77□□□□□ -2.29
VAMP3Q15836 MTATP6P9-201ENST00000515039 680 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
VAMP3Q15836 RNU6-922P-201ENST00000516753 99 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
VAMP3Q15836 AC112481.1-201ENST00000549669 901 ntTSL 2 BASIC0.77□□□□□ -2.29
VAMP3Q15836 AC084879.2-201ENST00000551656 369 ntTSL 3 BASIC0.77□□□□□ -2.29
VAMP3Q15836 AGGF1P4-201ENST00000568249 801 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
VAMP3Q15836 MIR4703-201ENST00000577728 79 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
VAMP3Q15836 MIR3683-201ENST00000580847 82 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
VAMP3Q15836 AC068790.6-201ENST00000602558 258 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
VAMP3Q15836 AL022161.1-201ENST00000604390 213 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
VAMP3Q15836 RNU6-85P-201ENST00000605989 107 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
VAMP3Q15836 AC097065.2-201ENST00000608159 533 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
VAMP3Q15836 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC0.77□□□□□ -2.29
VAMP3Q15836 VBP1-204ENST00000625964 1547 ntTSL 5 BASIC0.76□□□□□ -2.29
VAMP3Q15836 MIR449A-201ENST00000362113 91 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
VAMP3Q15836 RNU4-79P-201ENST00000362764 141 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
VAMP3Q15836 RNU4-91P-201ENST00000364778 135 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
VAMP3Q15836 RNU6-1127P-201ENST00000384580 107 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
VAMP3Q15836 RNU6-1031P-201ENST00000384773 107 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
VAMP3Q15836 MIR19B1-201ENST00000384829 87 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
VAMP3Q15836 RNU6-1106P-201ENST00000390845 107 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
VAMP3Q15836 SNORA67.5-201ENST00000391036 107 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
VAMP3Q15836 RNU6ATAC8P-201ENST00000408460 126 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
VAMP3Q15836 LINC01201-201ENST00000412420 294 ntTSL 3 BASIC0.76□□□□□ -2.29
VAMP3Q15836 PIGFP2-201ENST00000421400 651 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
VAMP3Q15836 AL593851.1-201ENST00000426171 157 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
VAMP3Q15836 RAB28P5-201ENST00000427490 651 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
VAMP3Q15836 AL512656.1-201ENST00000427492 401 ntTSL 2 BASIC0.76□□□□□ -2.29
VAMP3Q15836 TIMM9P3-201ENST00000428659 274 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
VAMP3Q15836 AC099566.1-201ENST00000442558 479 ntTSL 3 BASIC0.76□□□□□ -2.29
VAMP3Q15836 AC074290.1-201ENST00000448883 135 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
VAMP3Q15836 SCARNA18-201ENST00000459004 134 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
VAMP3Q15836 AC092991.1-201ENST00000477176 376 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
VAMP3Q15836 AC048334.1-201ENST00000477975 159 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
VAMP3Q15836 AC025423.5-201ENST00000550230 219 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
VAMP3Q15836 AC109446.2-201ENST00000567872 497 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
VAMP3Q15836 LINC02104-202ENST00000604954 599 ntTSL 3 BASIC0.76□□□□□ -2.29
VAMP3Q15836 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
VAMP3Q15836 CEP57L1-201ENST00000359793 2515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.76□□□□□ -2.29
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VAMP3Q15836 RNU6-1305P-201ENST00000364353 104 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
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VAMP3Q15836 AC003659.1-201ENST00000424251 465 ntTSL 5 BASIC0.75□□□□□ -2.29
VAMP3Q15836 AL445259.1-203ENST00000427828 251 ntTSL 3 BASIC0.75□□□□□ -2.29
VAMP3Q15836 AL589935.1-209ENST00000432050 418 ntTSL 5 BASIC0.75□□□□□ -2.29
VAMP3Q15836 ZNF736P12Y-201ENST00000443152 1243 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
VAMP3Q15836 NFU1P2-201ENST00000448700 469 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
VAMP3Q15836 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC0.75□□□□□ -2.29
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VAMP3Q15836 LINC02276-201ENST00000508388 138 ntTSL 3 BASIC0.75□□□□□ -2.29
VAMP3Q15836 AC097467.3-212ENST00000512269 568 ntTSL 3 BASIC0.75□□□□□ -2.29
VAMP3Q15836 AC008700.1-202ENST00000513657 468 ntTSL 5 BASIC0.75□□□□□ -2.29
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VAMP3Q15836 AC009930.1-201ENST00000522330 191 ntTSL 5 BASIC0.75□□□□□ -2.29
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VAMP3Q15836 uc_338.11-201ENST00000619132 160 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
VAMP3Q15836 AC022306.3-201ENST00000619930 550 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
VAMP3Q15836 TTK-211ENST00000627129 240 ntTSL 5 BASIC0.75□□□□□ -2.29
VAMP3Q15836 SLC25A46-204ENST00000504098 2345 ntTSL 5 BASIC0.75□□□□□ -2.29
VAMP3Q15836 SNORD114-1-201ENST00000362705 72 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
VAMP3Q15836 Y_RNA.287-201ENST00000364853 94 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
VAMP3Q15836 RNU4-48P-201ENST00000365559 182 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
VAMP3Q15836 RNU6-57P-201ENST00000411348 103 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
VAMP3Q15836 AL606490.4-201ENST00000423117 127 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
VAMP3Q15836 AL606517.2-201ENST00000442855 241 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
VAMP3Q15836 UBL5P3-201ENST00000475112 231 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
VAMP3Q15836 AC106892.1-201ENST00000491608 406 ntTSL 3 BASIC0.74□□□□□ -2.29
VAMP3Q15836 RNU6-947P-201ENST00000516264 106 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
VAMP3Q15836 RNU1-142P-201ENST00000516682 145 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
VAMP3Q15836 AC099520.1-206ENST00000523434 486 ntTSL 3 BASIC0.74□□□□□ -2.29
VAMP3Q15836 AC026470.2-201ENST00000561492 181 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
VAMP3Q15836 AL391840.1-201ENST00000571144 367 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
VAMP3Q15836 AC146944.4-201ENST00000602697 718 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
VAMP3Q15836 AP000907.4-201ENST00000604143 237 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
VAMP3Q15836 AC006566.1-201ENST00000608943 513 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
VAMP3Q15836 AC018630.2-201ENST00000534866 2403 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
VAMP3Q15836 Y_RNA.124-201ENST00000363339 93 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
VAMP3Q15836 RNU6-108P-201ENST00000365558 107 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
VAMP3Q15836 MIR146A-201ENST00000385201 99 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
VAMP3Q15836 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
VAMP3Q15836 RNU6-174P-201ENST00000410406 106 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
VAMP3Q15836 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
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