Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 MTND5P5-201ENST00000503764 376 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
NPTX1Q15818 AC008892.1-201ENST00000511861 384 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
NPTX1Q15818 RNU7-193P-201ENST00000516723 65 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
NPTX1Q15818 RNA5SP137-201ENST00000516833 135 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
NPTX1Q15818 RNU7-30P-201ENST00000516835 62 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
NPTX1Q15818 AC233702.2-202ENST00000562547 291 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
NPTX1Q15818 AC090517.1-201ENST00000569307 266 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
NPTX1Q15818 AP006219.1-201ENST00000580258 472 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
NPTX1Q15818 AC005520.5-201ENST00000613926 164 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
NPTX1Q15818 DLEU2_5.1-201ENST00000615567 84 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
NPTX1Q15818 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
NPTX1Q15818 AC243829.7-201ENST00000633081 225 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
NPTX1Q15818 ZBED5-202ENST00000432999 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
NPTX1Q15818 AP006437.1-201ENST00000641440 3685 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
NPTX1Q15818 RNA5SP289-201ENST00000362332 137 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
NPTX1Q15818 SNORD50.1-201ENST00000362987 71 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
NPTX1Q15818 RNU2-40P-201ENST00000410833 196 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
NPTX1Q15818 AC107399.1-201ENST00000451226 265 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
NPTX1Q15818 AC005703.2-201ENST00000453339 343 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
NPTX1Q15818 AL844175.1-201ENST00000455153 323 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
NPTX1Q15818 PRELID3BP1-201ENST00000457142 540 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
NPTX1Q15818 AF186996.7-201ENST00000492781 209 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
NPTX1Q15818 AC116337.1-201ENST00000509680 687 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
NPTX1Q15818 AC010457.1-201ENST00000510469 458 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
NPTX1Q15818 AC005741.1-201ENST00000511094 432 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
NPTX1Q15818 RNU6-991P-201ENST00000516168 107 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
NPTX1Q15818 AC108449.1-202ENST00000517632 478 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
NPTX1Q15818 AP005436.2-201ENST00000528458 252 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
NPTX1Q15818 AC022469.2-201ENST00000554759 396 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
NPTX1Q15818 RBM11P1-201ENST00000604951 799 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
NPTX1Q15818 AC116312.1-201ENST00000606841 314 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
NPTX1Q15818 AC009994.1-201ENST00000606889 253 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
NPTX1Q15818 AC009318.2-201ENST00000610917 651 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
NPTX1Q15818 MESTIT1_1.1-201ENST00000618871 140 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
NPTX1Q15818 ST7-OT4_2.1-201ENST00000619089 172 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
NPTX1Q15818 AC098657.3-201ENST00000620434 263 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
NPTX1Q15818 AC099654.14-201ENST00000638599 341 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
NPTX1Q15818 KNL1-204ENST00000527044 5404 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
NPTX1Q15818 RNU6-845P-201ENST00000362578 103 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
NPTX1Q15818 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
NPTX1Q15818 RNU6-234P-201ENST00000365229 104 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
NPTX1Q15818 RNU6-1283P-201ENST00000365314 105 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
NPTX1Q15818 DEFB134-201ENST00000382205 314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
NPTX1Q15818 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
NPTX1Q15818 MIR548K-201ENST00000408406 116 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
NPTX1Q15818 AC074085.1-201ENST00000413598 418 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
NPTX1Q15818 EIF4EP2-201ENST00000422816 654 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
NPTX1Q15818 AL355314.2-201ENST00000427182 436 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
NPTX1Q15818 RPS3AP52-201ENST00000435639 297 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
NPTX1Q15818 FTH1P25-201ENST00000447665 469 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
NPTX1Q15818 AC008154.1-201ENST00000453087 327 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
NPTX1Q15818 AC079354.2-201ENST00000453523 154 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
NPTX1Q15818 PMCHL2-203ENST00000457791 237 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
NPTX1Q15818 AC087477.1-201ENST00000465747 340 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
NPTX1Q15818 AC063944.1-201ENST00000496943 295 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
NPTX1Q15818 MTND5P9-201ENST00000503854 1755 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
NPTX1Q15818 ANXA2P1-201ENST00000505539 926 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
NPTX1Q15818 RNU1-40P-201ENST00000516816 164 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
NPTX1Q15818 RNU1-97P-201ENST00000516872 164 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
NPTX1Q15818 AP003171.1-201ENST00000532770 266 ntTSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
NPTX1Q15818 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
NPTX1Q15818 MIR4273-201ENST00000582824 84 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
NPTX1Q15818 uc_338.5-201ENST00000611839 155 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
NPTX1Q15818 AC009831.4-201ENST00000620744 325 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
NPTX1Q15818 MIR6132-201ENST00000622083 109 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
NPTX1Q15818 DUXAP9-208ENST00000622815 614 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
NPTX1Q15818 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
NPTX1Q15818 OR5M1-202ENST00000641076 4302 ntAPPRIS P1 BASIC2.04□□□□□ -2.08
NPTX1Q15818 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
NPTX1Q15818 OGN-202ENST00000375561 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
NPTX1Q15818 RNU6-1159P-201ENST00000362933 107 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
NPTX1Q15818 Y_RNA.184-201ENST00000363884 108 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
NPTX1Q15818 SNORA67.4-201ENST00000384688 142 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
NPTX1Q15818 MIR221-201ENST00000385135 110 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
NPTX1Q15818 SNORA48.3-201ENST00000391081 134 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
NPTX1Q15818 RNU2-41P-201ENST00000410991 178 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
NPTX1Q15818 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
NPTX1Q15818 RPS26P42-201ENST00000413485 326 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
NPTX1Q15818 AL358453.1-201ENST00000422522 250 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
NPTX1Q15818 USP9YP30-201ENST00000430729 455 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
NPTX1Q15818 TRBV25OR9-2-201ENST00000438417 374 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
NPTX1Q15818 SPIN4-AS1-201ENST00000451979 426 ntTSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
NPTX1Q15818 FO393415.2-201ENST00000480085 343 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
NPTX1Q15818 AC091976.1-202ENST00000509211 630 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
NPTX1Q15818 RNA5SP281-201ENST00000516504 135 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
NPTX1Q15818 RNU6-1016P-201ENST00000516689 94 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
NPTX1Q15818 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
NPTX1Q15818 AC104211.3-201ENST00000518861 270 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
NPTX1Q15818 LINC02442-201ENST00000537732 343 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
NPTX1Q15818 AP001363.1-201ENST00000544108 264 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
NPTX1Q15818 MIR5002-201ENST00000584713 97 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
NPTX1Q15818 AL591030.1-201ENST00000626131 627 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
NPTX1Q15818 SCARNA4-201ENST00000629045 128 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
NPTX1Q15818 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
NPTX1Q15818 GAGE12B-201ENST00000361446 117 ntAPPRIS P1 BASIC2.02□□□□□ -2.09
NPTX1Q15818 Y_RNA.166-201ENST00000363730 102 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
NPTX1Q15818 RNU6-1059P-201ENST00000363752 98 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
NPTX1Q15818 EQTN-201ENST00000380031 725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
NPTX1Q15818 SNORD23.1-201ENST00000408212 104 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
NPTX1Q15818 AC098614.3-201ENST00000438957 440 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
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