Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 LINC00446-202ENST00000438327 357 ntTSL 3 BASIC-0.11□□□□□ -2.43
ALX1Q15699 AL163973.1-201ENST00000484753 577 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
ALX1Q15699 AP002428.1-201ENST00000527345 380 ntTSL 3 BASIC-0.11□□□□□ -2.43
ALX1Q15699 AL606834.3-201ENST00000602615 496 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
ALX1Q15699 OR4H6P-202ENST00000603819 340 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
ALX1Q15699 KIF20B-201ENST00000260753 6306 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC-0.11□□□□□ -2.43
ALX1Q15699 AC073544.1-201ENST00000600110 1595 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
ALX1Q15699 C20orf187-201ENST00000378252 446 ntTSL 2 BASIC-0.12□□□□□ -2.43
ALX1Q15699 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
ALX1Q15699 TRAJ54-201ENST00000390484 60 ntAPPRIS P1 BASIC-0.12□□□□□ -2.43
ALX1Q15699 MTCYBP2-201ENST00000407745 171 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
ALX1Q15699 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
ALX1Q15699 AL162399.1-201ENST00000426090 130 ntTSL 3 BASIC-0.12□□□□□ -2.43
ALX1Q15699 RPL31P35-201ENST00000431058 377 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
ALX1Q15699 RSL24D1P8-201ENST00000434442 492 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
ALX1Q15699 AP000542.1-201ENST00000448473 371 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
ALX1Q15699 AC119751.4-201ENST00000507498 357 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
ALX1Q15699 SEMA6A-AS1-204ENST00000510682 521 ntTSL 5 BASIC-0.12□□□□□ -2.43
ALX1Q15699 RNU1-86P-201ENST00000516108 154 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
ALX1Q15699 RNU1-107P-201ENST00000516617 154 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
ALX1Q15699 LINC01893-201ENST00000581750 479 ntTSL 3 BASIC-0.12□□□□□ -2.43
ALX1Q15699 RPL17P51-201ENST00000605218 238 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
ALX1Q15699 AC090517.2-201ENST00000614966 680 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
ALX1Q15699 C8orf59-212ENST00000615697 483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC-0.12□□□□□ -2.43
ALX1Q15699 AL031667.3-201ENST00000620124 655 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
ALX1Q15699 AL513423.1-201ENST00000621695 132 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
ALX1Q15699 TPTE2-204ENST00000400103 1652 ntTSL 5 BASIC-0.12□□□□□ -2.43
ALX1Q15699 AC092104.1-201ENST00000497346 1441 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
ALX1Q15699 RNU6-1285P-201ENST00000363480 105 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
ALX1Q15699 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
ALX1Q15699 RNU6-302P-201ENST00000365249 107 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
ALX1Q15699 RPL23AP50-201ENST00000434149 455 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
ALX1Q15699 AC005019.2-201ENST00000434321 359 ntTSL 5 BASIC-0.13□□□□□ -2.43
ALX1Q15699 AL591501.1-201ENST00000439992 495 ntTSL 5 BASIC-0.13□□□□□ -2.43
ALX1Q15699 AL133217.1-201ENST00000450980 425 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
ALX1Q15699 PCAT4-202ENST00000514836 373 ntTSL 3 BASIC-0.13□□□□□ -2.43
ALX1Q15699 RNU6-1098P-201ENST00000516772 96 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
ALX1Q15699 AC012404.2-201ENST00000558572 481 ntTSL 3 BASIC-0.13□□□□□ -2.43
ALX1Q15699 AL512347.1-201ENST00000566420 503 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
ALX1Q15699 EIF1P4-201ENST00000572664 335 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
ALX1Q15699 PRELID3BP2-201ENST00000605362 201 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
ALX1Q15699 AC104073.3-201ENST00000610942 955 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
ALX1Q15699 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
ALX1Q15699 RNU6-716P-201ENST00000365621 103 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
ALX1Q15699 Y_RNA.466-201ENST00000384294 113 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
ALX1Q15699 RNU6-700P-201ENST00000391043 107 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
ALX1Q15699 RNU6-1245P-201ENST00000411130 106 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
ALX1Q15699 AL663023.1-201ENST00000412932 853 ntTSL 3 BASIC-0.14□□□□□ -2.43
ALX1Q15699 MTCO2P34-201ENST00000421994 607 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
ALX1Q15699 UBE2D3P3-201ENST00000426992 425 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
ALX1Q15699 AL596220.1-202ENST00000429768 314 ntTSL 3 BASIC-0.14□□□□□ -2.43
ALX1Q15699 SNRPGP12-201ENST00000449481 213 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
ALX1Q15699 AC067940.1-201ENST00000458411 300 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
ALX1Q15699 AC092925.1-201ENST00000470739 493 ntTSL 3 BASIC-0.14□□□□□ -2.43
ALX1Q15699 HMGB1P29-201ENST00000505659 499 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
ALX1Q15699 AC112206.3-201ENST00000514578 389 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
ALX1Q15699 RNY4P37-201ENST00000516225 96 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
ALX1Q15699 AC027419.1-201ENST00000522976 328 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
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ALX1Q15699 AC090531.1-202ENST00000548450 499 ntTSL 3 BASIC-0.14□□□□□ -2.43
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ALX1Q15699 MIR4290-201ENST00000583807 95 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
ALX1Q15699 CTHRC1P1-201ENST00000605383 469 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
ALX1Q15699 MALAT1-206ENST00000612781 234 ntTSL 3 BASIC-0.14□□□□□ -2.43
ALX1Q15699 AL354696.1-201ENST00000614652 497 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
ALX1Q15699 AC026585.1-201ENST00000619582 524 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
ALX1Q15699 DLG2-AS1_1.1-201ENST00000622319 213 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
ALX1Q15699 SNORA32.1-201ENST00000364514 115 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
ALX1Q15699 SMIM11P1-201ENST00000369586 178 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
ALX1Q15699 MIR653-201ENST00000385279 96 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
ALX1Q15699 AC092809.3-201ENST00000415453 231 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
ALX1Q15699 AL953862.1-201ENST00000423016 168 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
ALX1Q15699 AL583859.1-201ENST00000455871 335 ntTSL 3 BASIC-0.15□□□□□ -2.43
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ALX1Q15699 ZNF321P-202ENST00000550843 495 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
ALX1Q15699 AC012507.3-201ENST00000603556 477 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
ALX1Q15699 RNU6-527P-201ENST00000363425 104 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
ALX1Q15699 RNA5SP457-201ENST00000363657 124 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
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ALX1Q15699 RNU6-418P-201ENST00000384035 107 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
ALX1Q15699 RNU6-815P-201ENST00000384080 113 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
ALX1Q15699 RNA5SP323-201ENST00000391094 133 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
ALX1Q15699 AL603865.2-201ENST00000401679 213 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
ALX1Q15699 HIGD1AP15-201ENST00000416198 280 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
ALX1Q15699 BX005214.1-201ENST00000427327 476 ntTSL 5 BASIC-0.16□□□□□ -2.44
ALX1Q15699 AL357873.1-201ENST00000449215 282 ntTSL 3 BASIC-0.16□□□□□ -2.44
ALX1Q15699 AC245047.8-201ENST00000456455 284 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
ALX1Q15699 SNRPGP7-201ENST00000469016 106 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
ALX1Q15699 AC113347.3-201ENST00000509113 148 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
ALX1Q15699 RPL23AP91-201ENST00000569211 455 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
ALX1Q15699 AL590491.2-201ENST00000614608 499 ntTSL 5 BASIC-0.16□□□□□ -2.44
ALX1Q15699 AC067863.3-201ENST00000624172 122 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
ALX1Q15699 MIR4315-1-201ENST00000636800 73 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
ALX1Q15699 MIR4315-2-201ENST00000640925 73 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
ALX1Q15699 PDCL2-201ENST00000295645 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.17□□□□□ -2.44
ALX1Q15699 AL356583.2-201ENST00000426536 280 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
ALX1Q15699 AL162725.1-201ENST00000435405 301 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
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