Protein–RNA interactions for Protein: Q15637

SF1, Splicing factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 639 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF1Q15637 RNA5SP119-201ENST00000362715 117 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SF1Q15637 RNU6-486P-201ENST00000363116 107 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SF1Q15637 RNA5SP50-201ENST00000363731 107 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SF1Q15637 Y_RNA.200-201ENST00000364018 102 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SF1Q15637 MIR7-3-201ENST00000384898 110 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SF1Q15637 MIR29B2-201ENST00000385055 81 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SF1Q15637 AC007179.2-207ENST00000435557 556 ntTSL 4 BASIC3.37□□□□□ -1.87
SF1Q15637 AL117341.1-201ENST00000437213 373 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
SF1Q15637 POLR2KP2-201ENST00000438155 177 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SF1Q15637 AC009237.7-201ENST00000447357 229 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SF1Q15637 CYCSP35-201ENST00000451978 304 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SF1Q15637 AL138752.1-201ENST00000452964 351 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SF1Q15637 COX6CP14-201ENST00000469580 174 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SF1Q15637 AC025518.1-201ENST00000479856 347 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SF1Q15637 AC022601.1-201ENST00000596954 577 ntTSL 4 BASIC3.37□□□□□ -1.87
SF1Q15637 SNORD11B-201ENST00000607707 90 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SF1Q15637 RMST_8.1-201ENST00000610287 165 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SF1Q15637 AC018692.3-201ENST00000623929 123 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SF1Q15637 AC110079.1-202ENST00000635213 138 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SF1Q15637 LIG4-205ENST00000614526 3884 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
SF1Q15637 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
SF1Q15637 ZNF804B-202ENST00000611114 3968 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
SF1Q15637 AC000403.1-201ENST00000613696 3585 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SF1Q15637 MANEA-201ENST00000358812 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
SF1Q15637 MACC1-205ENST00000589011 2686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
SF1Q15637 TSLP-202ENST00000379706 2411 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
SF1Q15637 ZNF83-201ENST00000301096 2599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
SF1Q15637 KIAA1841-202ENST00000356719 2149 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
SF1Q15637 Y_RNA.29-201ENST00000362570 113 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SF1Q15637 Y_RNA.269-201ENST00000364685 89 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SF1Q15637 RNU6-1264P-201ENST00000383891 107 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SF1Q15637 RNA5SP475-201ENST00000410568 110 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SF1Q15637 LINC01701-201ENST00000419614 451 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
SF1Q15637 Z98742.2-201ENST00000431564 187 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SF1Q15637 RBMY2UP-201ENST00000453474 324 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SF1Q15637 TSPY5P-202ENST00000456541 142 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
SF1Q15637 RN7SL293P-201ENST00000481765 281 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SF1Q15637 SNORA81.3-201ENST00000517283 198 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SF1Q15637 AC103810.1-201ENST00000579873 453 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SF1Q15637 AC008739.2-201ENST00000597006 317 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SF1Q15637 AL162424.1-201ENST00000602325 221 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SF1Q15637 AC019176.2-201ENST00000611579 315 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SF1Q15637 AC022149.2-201ENST00000621061 203 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SF1Q15637 IGHVIII-44-202ENST00000636235 289 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SF1Q15637 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SF1Q15637 CENPJ-205ENST00000545981 4299 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
SF1Q15637 SEL1L2-201ENST00000284951 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
SF1Q15637 NUFIP2-201ENST00000225388 10850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
SF1Q15637 DCUN1D1-208ENST00000632685 3147 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
SF1Q15637 RGS18-201ENST00000367460 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
SF1Q15637 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
SF1Q15637 ADGRV1-201ENST00000405460 19557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
SF1Q15637 SNORA71.3-201ENST00000362582 128 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SF1Q15637 RNA5-8SP4-201ENST00000365096 150 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SF1Q15637 Y_RNA.383-201ENST00000383855 97 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SF1Q15637 MIR184-201ENST00000384962 84 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SF1Q15637 RNA5SP171-201ENST00000391071 115 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SF1Q15637 LINC02337-201ENST00000401043 374 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
SF1Q15637 AC009414.1-201ENST00000427200 443 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SF1Q15637 YME1L1P1-201ENST00000429435 297 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SF1Q15637 MICF-203ENST00000432679 129 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SF1Q15637 AC004386.2-201ENST00000441858 148 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SF1Q15637 AL118523.1-201ENST00000444436 480 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
SF1Q15637 CFAP44-AS1-201ENST00000473329 396 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
SF1Q15637 AC026784.1-201ENST00000507986 352 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SF1Q15637 AC093331.1-201ENST00000521474 169 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SF1Q15637 TGIF1P1-201ENST00000558095 802 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SF1Q15637 AC120045.1-201ENST00000563502 251 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
SF1Q15637 AC139426.2-201ENST00000568289 251 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
SF1Q15637 AC130289.1-201ENST00000577321 73 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SF1Q15637 AL670379.2-201ENST00000604983 252 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SF1Q15637 AC068205.3-201ENST00000636385 468 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SF1Q15637 LPP-220ENST00000617246 18220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
SF1Q15637 SAMD3-214ENST00000532763 3690 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
SF1Q15637 RNU1-75P-201ENST00000347264 129 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SF1Q15637 RNU4-35P-201ENST00000362588 141 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SF1Q15637 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SF1Q15637 Y_RNA.446-201ENST00000384178 104 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SF1Q15637 RNU6-1248P-201ENST00000391096 64 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SF1Q15637 RNU2-54P-201ENST00000410299 190 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SF1Q15637 AC027124.2-201ENST00000428249 105 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SF1Q15637 NDUFB4P10-201ENST00000452541 359 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SF1Q15637 LINC02198-202ENST00000505371 526 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
SF1Q15637 SNORA27.4-201ENST00000516650 95 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SF1Q15637 AC069133.1-201ENST00000522857 566 ntTSL 4 BASIC3.34□□□□□ -1.87
SF1Q15637 LINC01965-204ENST00000545549 575 ntTSL 4 BASIC3.34□□□□□ -1.87
SF1Q15637 LINC02253-201ENST00000559321 448 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
SF1Q15637 ACTG1P17-203ENST00000561222 537 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
SF1Q15637 CR936218.1-201ENST00000570454 304 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
SF1Q15637 AC011471.1-201ENST00000585766 187 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SF1Q15637 AC107294.3-201ENST00000609211 526 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SF1Q15637 AC004467.1-201ENST00000615678 330 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SF1Q15637 UCA1.1-201ENST00000620952 75 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SF1Q15637 ABCC9-206ENST00000621589 450 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
SF1Q15637 IBTK-209ENST00000510291 4109 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.88
SF1Q15637 ZNF626-204ENST00000612591 4404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.88
SF1Q15637 UBE2W-203ENST00000517608 8426 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.88
SF1Q15637 PALMD-205ENST00000615664 1844 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
SF1Q15637 RMDN2-203ENST00000402091 1973 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
SF1Q15637 MIR30E-201ENST00000362104 92 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 143.2 ms