Protein–RNA interactions for Protein: Q15270

NKX1-1, NK1 transcription factor-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-1Q15270 RNA5SP112-201ENST00000515937 99 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NKX1-1Q15270 RNU1-95P-201ENST00000516357 160 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NKX1-1Q15270 RNU1-128P-201ENST00000516704 160 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NKX1-1Q15270 AC006254.2-201ENST00000603259 279 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NKX1-1Q15270 AC090517.3-201ENST00000625170 141 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NKX1-1Q15270 CEP70-211ENST00000484888 1993 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
NKX1-1Q15270 MIR181A1HG-203ENST00000436880 2308 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
NKX1-1Q15270 SKP1-202ENST00000353411 9474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
NKX1-1Q15270 MAP2-202ENST00000360351 9711 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
NKX1-1Q15270 XRN1-201ENST00000264951 10143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
NKX1-1Q15270 DNAH6-202ENST00000389394 12795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
NKX1-1Q15270 INO80D-201ENST00000403263 14136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
NKX1-1Q15270 ZNF780B-202ENST00000434248 8665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
NKX1-1Q15270 ZNF780B-207ENST00000617676 8664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
NKX1-1Q15270 CNTN5-209ENST00000528682 3800 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
NKX1-1Q15270 C21orf91-201ENST00000284881 5433 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
NKX1-1Q15270 FAM135A-210ENST00000505868 5173 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
NKX1-1Q15270 U8.1-201ENST00000362843 134 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
NKX1-1Q15270 Y_RNA.114-201ENST00000363265 113 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
NKX1-1Q15270 AC063976.4-201ENST00000421971 163 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
NKX1-1Q15270 NDUFA5P6-201ENST00000542110 379 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
NKX1-1Q15270 AC025627.2-201ENST00000576220 160 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
NKX1-1Q15270 AC129510.2-201ENST00000582774 345 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
NKX1-1Q15270 AL049861.1-201ENST00000603130 150 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
NKX1-1Q15270 DLG1-216ENST00000450955 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
NKX1-1Q15270 PHTF2-202ENST00000275575 4541 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
NKX1-1Q15270 PHACTR2-207ENST00000427704 9531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
NKX1-1Q15270 ORC4-216ENST00000540442 6472 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
NKX1-1Q15270 CACNB4-260ENST00000637762 3800 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
NKX1-1Q15270 ZNF439-201ENST00000304030 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
NKX1-1Q15270 HERC4-205ENST00000412272 4211 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
NKX1-1Q15270 RMDN2-205ENST00000407257 2280 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
NKX1-1Q15270 TNRC6B-201ENST00000301923 15958 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
NKX1-1Q15270 CENPE-202ENST00000380026 8241 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
NKX1-1Q15270 WDR63-203ENST00000370596 2905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
NKX1-1Q15270 ZNF33A-201ENST00000307441 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.23□□□□□ -1.57
NKX1-1Q15270 SNORD116-21-201ENST00000384507 92 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
NKX1-1Q15270 HMGN2P8-201ENST00000391458 268 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
NKX1-1Q15270 SNORA57.3-201ENST00000411095 141 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
NKX1-1Q15270 RNU6-57P-201ENST00000411348 103 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
NKX1-1Q15270 PPIAP15-201ENST00000479662 484 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
NKX1-1Q15270 RPL29P14-201ENST00000495837 428 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
NKX1-1Q15270 AC026726.1-201ENST00000512859 601 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
NKX1-1Q15270 RN7SKP46-201ENST00000515942 234 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
NKX1-1Q15270 MIR4662B-201ENST00000579498 81 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
NKX1-1Q15270 AC103810.1-201ENST00000579873 453 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
NKX1-1Q15270 AL138721.1-201ENST00000616756 179 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
NKX1-1Q15270 AC100800.1-201ENST00000524252 2054 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
NKX1-1Q15270 RLIM-201ENST00000332687 8317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
NKX1-1Q15270 AC000403.1-201ENST00000613696 3585 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
NKX1-1Q15270 TLR3-201ENST00000296795 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
NKX1-1Q15270 EMSY-215ENST00000533248 3798 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
NKX1-1Q15270 Y_RNA.333-201ENST00000365274 102 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
NKX1-1Q15270 Y_RNA.346-201ENST00000365385 112 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
NKX1-1Q15270 RNU6-147P-201ENST00000383983 107 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
NKX1-1Q15270 MIR767-201ENST00000390228 109 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
NKX1-1Q15270 STON1-GTF2A1L-204ENST00000405008 3821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
NKX1-1Q15270 CYP1B1-AS1-202ENST00000427168 484 ntTSL 4 BASIC5.22□□□□□ -1.57
NKX1-1Q15270 AC098820.1-201ENST00000453157 512 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
NKX1-1Q15270 AL136097.2-201ENST00000457003 333 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
NKX1-1Q15270 RNU6ATAC13P-201ENST00000516152 131 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
NKX1-1Q15270 SCARNA14-201ENST00000516903 136 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
NKX1-1Q15270 RNA5SP179-201ENST00000517284 121 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
NKX1-1Q15270 AC087499.8-201ENST00000578406 226 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
NKX1-1Q15270 MIR4765-201ENST00000585007 77 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
NKX1-1Q15270 AC108081.1-201ENST00000604358 221 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
NKX1-1Q15270 AC091167.4-201ENST00000605079 184 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
NKX1-1Q15270 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
NKX1-1Q15270 AC009093.8-201ENST00000641769 292 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
NKX1-1Q15270 PTPRC-209ENST00000442510 5164 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
NKX1-1Q15270 ADGRG4-202ENST00000394141 8971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
NKX1-1Q15270 CEP192-201ENST00000325971 7764 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
NKX1-1Q15270 CLUL1-208ENST00000581619 2449 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
NKX1-1Q15270 PUS7L-207ENST00000551923 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
NKX1-1Q15270 PIK3C3-201ENST00000262039 9443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
NKX1-1Q15270 VIRMA-201ENST00000297591 6528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
NKX1-1Q15270 ABI3BP-201ENST00000284322 4498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
NKX1-1Q15270 N4BP2L2-211ENST00000504114 2513 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
NKX1-1Q15270 ZNF479-202ENST00000331162 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
NKX1-1Q15270 SNORD31B-201ENST00000364977 69 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NKX1-1Q15270 SNORA5A-201ENST00000384111 134 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NKX1-1Q15270 SNORD14D-201ENST00000384390 87 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NKX1-1Q15270 MIR7-3-201ENST00000384898 110 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NKX1-1Q15270 SNORA3.3-201ENST00000408712 125 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NKX1-1Q15270 CYCSP49-201ENST00000420810 319 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NKX1-1Q15270 AC010531.2-201ENST00000465012 153 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NKX1-1Q15270 Y_RNA.694-201ENST00000516677 117 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NKX1-1Q15270 uc_338.4-201ENST00000616635 176 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NKX1-1Q15270 RBMS2-209ENST00000639027 192 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
NKX1-1Q15270 PCDH15-206ENST00000373965 9237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
NKX1-1Q15270 STON1-GTF2A1L-203ENST00000402114 3790 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
NKX1-1Q15270 OR52E4-202ENST00000641726 2947 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
NKX1-1Q15270 USP8-202ENST00000396444 19026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
NKX1-1Q15270 EFCAB5-201ENST00000394835 5132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
NKX1-1Q15270 AP003122.5-201ENST00000527668 3766 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
NKX1-1Q15270 OR5A1-202ENST00000641045 8612 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
NKX1-1Q15270 RNA5SP399-201ENST00000364003 117 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
NKX1-1Q15270 RNU6-234P-201ENST00000365229 104 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
NKX1-1Q15270 IGLV5-37-201ENST00000390300 374 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
NKX1-1Q15270 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
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