Protein–RNA interactions for Protein: Q15223

NECTIN1, Nectin-1, humanhuman

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN1Q15223 MIR521-1-201ENST00000384902 87 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
NECTIN1Q15223 MIR147B-201ENST00000390185 80 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
NECTIN1Q15223 RNA5SP390-201ENST00000410191 113 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
NECTIN1Q15223 BX276092.3-201ENST00000424182 230 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
NECTIN1Q15223 Z82205.1-201ENST00000428456 297 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
NECTIN1Q15223 KCNMA1-AS2-201ENST00000428936 427 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
NECTIN1Q15223 LINC02041-201ENST00000440726 246 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
NECTIN1Q15223 MAMDC2-AS1-205ENST00000451488 317 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
NECTIN1Q15223 AC079354.2-201ENST00000453523 154 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
NECTIN1Q15223 Y_RNA.653-201ENST00000459091 95 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
NECTIN1Q15223 U8.21-201ENST00000459536 136 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
NECTIN1Q15223 FO393415.2-201ENST00000480085 343 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
NECTIN1Q15223 LINC02046-202ENST00000481334 390 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
NECTIN1Q15223 RN7SL274P-201ENST00000492268 272 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
NECTIN1Q15223 AC091874.1-201ENST00000511402 339 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
NECTIN1Q15223 EBAG9-207ENST00000531677 777 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
NECTIN1Q15223 AC109446.1-201ENST00000566172 220 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
NECTIN1Q15223 AC002558.3-201ENST00000574021 401 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
NECTIN1Q15223 MIR5696-201ENST00000578474 85 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
NECTIN1Q15223 AC090897.2-201ENST00000581715 130 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
NECTIN1Q15223 MIR4448-201ENST00000584360 86 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
NECTIN1Q15223 AL356055.1-201ENST00000602528 446 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
NECTIN1Q15223 AC018889.1-201ENST00000605372 397 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
NECTIN1Q15223 RNU6-91P-201ENST00000607774 107 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
NECTIN1Q15223 HMHB1-202ENST00000638299 126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
NECTIN1Q15223 ST7-AS2-206ENST00000456577 1351 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
NECTIN1Q15223 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
NECTIN1Q15223 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
NECTIN1Q15223 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
NECTIN1Q15223 Y_RNA.138-201ENST00000363462 102 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
NECTIN1Q15223 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
NECTIN1Q15223 MIR544A-201ENST00000384855 91 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
NECTIN1Q15223 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
NECTIN1Q15223 RNU6-1328P-201ENST00000410938 106 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
NECTIN1Q15223 AC243428.1-201ENST00000421099 264 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
NECTIN1Q15223 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
NECTIN1Q15223 RPL23AP95-201ENST00000426806 265 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
NECTIN1Q15223 AL442638.1-201ENST00000443359 237 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
NECTIN1Q15223 AL357873.1-201ENST00000449215 282 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
NECTIN1Q15223 RPL30P15-201ENST00000457129 321 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
NECTIN1Q15223 AP001324.2-201ENST00000461163 319 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
NECTIN1Q15223 AC027575.1-201ENST00000481064 460 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
NECTIN1Q15223 AC108037.1-201ENST00000514103 423 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
NECTIN1Q15223 AC093303.1-201ENST00000514549 295 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
NECTIN1Q15223 RNU6-120P-201ENST00000516077 103 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
NECTIN1Q15223 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
NECTIN1Q15223 AC023866.1-201ENST00000518064 579 ntTSL 4 BASIC2.16□□□□□ -2.06
NECTIN1Q15223 LINC02425-201ENST00000536217 376 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
NECTIN1Q15223 LINC02095-202ENST00000543512 323 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
NECTIN1Q15223 AC093249.1-201ENST00000567049 203 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
NECTIN1Q15223 AL158827.2-201ENST00000602494 330 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
NECTIN1Q15223 AC024581.2-201ENST00000619986 252 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
NECTIN1Q15223 AL691447.3-201ENST00000635020 330 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
NECTIN1Q15223 MIR7157-201ENST00000635801 60 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
NECTIN1Q15223 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
NECTIN1Q15223 DEUP1-202ENST00000525646 1920 ntTSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
NECTIN1Q15223 AL109809.4-201ENST00000603520 2185 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
NECTIN1Q15223 EFCAB3-202ENST00000450662 1694 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.06
NECTIN1Q15223 AL359854.1-201ENST00000614203 1594 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
NECTIN1Q15223 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.06
NECTIN1Q15223 Y_RNA.2-201ENST00000362330 96 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
NECTIN1Q15223 Y_RNA.48-201ENST00000362710 103 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
NECTIN1Q15223 RNU6-529P-201ENST00000363383 104 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
NECTIN1Q15223 RNU6-1285P-201ENST00000363480 105 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
NECTIN1Q15223 Y_RNA.431-201ENST00000384086 102 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
NECTIN1Q15223 RNU6-890P-201ENST00000384121 107 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
NECTIN1Q15223 RNU6-784P-201ENST00000384330 106 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
NECTIN1Q15223 RNU6-933P-201ENST00000384424 107 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
NECTIN1Q15223 SNORA75.6-201ENST00000391318 127 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
NECTIN1Q15223 AL591034.2-201ENST00000402839 359 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
NECTIN1Q15223 AL354751.2-201ENST00000415471 210 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
NECTIN1Q15223 MTCYBP6-201ENST00000441810 138 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
NECTIN1Q15223 LINC01594-201ENST00000445083 611 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
NECTIN1Q15223 AC007677.1-201ENST00000445757 515 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
NECTIN1Q15223 AC025918.1-201ENST00000452467 383 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
NECTIN1Q15223 Y_RNA.639-201ENST00000458981 102 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
NECTIN1Q15223 SCARNA16.2-201ENST00000516520 172 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
NECTIN1Q15223 POC1B-211ENST00000549504 581 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
NECTIN1Q15223 MIR4419B-201ENST00000577260 68 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
NECTIN1Q15223 MIR3945-201ENST00000581853 98 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
NECTIN1Q15223 MIR4719-201ENST00000585233 84 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
NECTIN1Q15223 AC013412.1-201ENST00000610687 192 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
NECTIN1Q15223 PISRT1.1-201ENST00000616930 107 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
NECTIN1Q15223 AL159153.1-201ENST00000619688 317 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
NECTIN1Q15223 SNORA43.4-201ENST00000629559 138 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
NECTIN1Q15223 AL450472.1-202ENST00000637286 180 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
NECTIN1Q15223 LINC01938-201ENST00000521341 1864 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
NECTIN1Q15223 CFHR4-202ENST00000367416 2178 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
NECTIN1Q15223 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
NECTIN1Q15223 SEL1L2-201ENST00000284951 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
NECTIN1Q15223 Z82209.1-201ENST00000422141 2135 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
NECTIN1Q15223 ZNF404-202ENST00000587539 1851 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
NECTIN1Q15223 Y_RNA.533-201ENST00000384596 114 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
NECTIN1Q15223 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
NECTIN1Q15223 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
NECTIN1Q15223 AC010731.2-201ENST00000415275 440 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
NECTIN1Q15223 AL161935.1-201ENST00000420945 421 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
NECTIN1Q15223 USMG5P1-201ENST00000425964 177 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
NECTIN1Q15223 AL445259.1-203ENST00000427828 251 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
NECTIN1Q15223 TSPY5P-202ENST00000456541 142 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
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