Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 RNU6-1274P-201ENST00000384557 107 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PDCD1Q15116 FO393413.1-201ENST00000402892 195 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PDCD1Q15116 AC093578.1-201ENST00000415219 368 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PDCD1Q15116 AL161788.1-201ENST00000441805 169 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PDCD1Q15116 RNU6-625P-201ENST00000459412 107 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PDCD1Q15116 AC026784.1-201ENST00000507986 352 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PDCD1Q15116 AC104619.4-201ENST00000510773 249 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PDCD1Q15116 RNU5F-4P-201ENST00000516581 114 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PDCD1Q15116 AC009623.2-201ENST00000522524 465 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
PDCD1Q15116 AC040936.1-201ENST00000534543 172 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
PDCD1Q15116 LINC01965-204ENST00000545549 575 ntTSL 4 BASIC3□□□□□ -1.93
PDCD1Q15116 NKAIN2-205ENST00000546092 148 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
PDCD1Q15116 TGIF1P1-201ENST00000558095 802 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PDCD1Q15116 LINC02165-201ENST00000563061 443 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
PDCD1Q15116 LINC02164-201ENST00000566684 272 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
PDCD1Q15116 CR936218.1-201ENST00000570454 304 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
PDCD1Q15116 MIR4423-201ENST00000580922 80 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PDCD1Q15116 AC005176.2-201ENST00000596933 147 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PDCD1Q15116 AL161756.2-201ENST00000604597 246 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PDCD1Q15116 AL355512.1-202ENST00000607952 209 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
PDCD1Q15116 DLX6-AS1_2.1-201ENST00000613701 207 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PDCD1Q15116 SNORA50A-202ENST00000629536 136 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PDCD1Q15116 KIAA1841-202ENST00000356719 2149 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
PDCD1Q15116 LUZP4-201ENST00000371920 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
PDCD1Q15116 SNORD113-8-201ENST00000363497 74 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PDCD1Q15116 Y_RNA.188-201ENST00000363952 111 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PDCD1Q15116 MIR491-201ENST00000384877 84 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PDCD1Q15116 MIR184-201ENST00000384962 84 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PDCD1Q15116 MIR95-201ENST00000385072 81 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PDCD1Q15116 Y_RNA.581-201ENST00000391017 97 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PDCD1Q15116 RNU2-25P-201ENST00000411041 191 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PDCD1Q15116 AC017079.2-201ENST00000416102 485 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PDCD1Q15116 TRIAP1P1-201ENST00000427062 225 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PDCD1Q15116 NDUFB4P10-201ENST00000452541 359 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PDCD1Q15116 RNU2-27P-201ENST00000516185 142 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PDCD1Q15116 AL356133.2-201ENST00000521572 371 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
PDCD1Q15116 AP001458.1-201ENST00000532626 92 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
PDCD1Q15116 AC026333.2-201ENST00000542164 106 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PDCD1Q15116 RRN3P3-201ENST00000549207 578 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PDCD1Q15116 AC110588.1-201ENST00000559699 137 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PDCD1Q15116 AL356280.1-201ENST00000603614 379 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PDCD1Q15116 AC011373.1-201ENST00000607270 237 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PDCD1Q15116 ZNRD1-AS1_2.5-201ENST00000614729 76 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PDCD1Q15116 AC022149.2-201ENST00000621061 203 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PDCD1Q15116 ABCC9-206ENST00000621589 450 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
PDCD1Q15116 ANKRD30BP1-201ENST00000451052 2186 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PDCD1Q15116 FOXP2-206ENST00000393491 6085 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
PDCD1Q15116 ERBIN-202ENST00000380935 6692 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
PDCD1Q15116 ARHGAP11A-207ENST00000565905 3318 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
PDCD1Q15116 Z83843.1-201ENST00000604070 3685 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PDCD1Q15116 ZNF83-201ENST00000301096 2599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
PDCD1Q15116 ZBBX-201ENST00000307529 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
PDCD1Q15116 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
PDCD1Q15116 CEP70-211ENST00000484888 1993 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
PDCD1Q15116 ABCG2-204ENST00000515655 4276 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
PDCD1Q15116 GABRG2-209ENST00000638660 3799 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
PDCD1Q15116 CYSLTR1-201ENST00000373304 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
PDCD1Q15116 LUZP2-208ENST00000620308 4981 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
PDCD1Q15116 MIR410-201ENST00000362222 80 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PDCD1Q15116 SNORD9-201ENST00000362566 104 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PDCD1Q15116 RNU4-90P-201ENST00000362773 141 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PDCD1Q15116 Y_RNA.84-201ENST00000363011 104 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PDCD1Q15116 RNU6-961P-201ENST00000363893 105 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PDCD1Q15116 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PDCD1Q15116 SPRR2D-203ENST00000368757 800 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
PDCD1Q15116 LINC01545-201ENST00000377879 521 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
PDCD1Q15116 Y_RNA.518-201ENST00000384552 113 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PDCD1Q15116 MIR183-201ENST00000384958 110 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PDCD1Q15116 MIR300-201ENST00000401138 83 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PDCD1Q15116 U3.39-201ENST00000408569 239 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PDCD1Q15116 RNA5SP475-201ENST00000410568 110 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PDCD1Q15116 RPL23AP36-201ENST00000413895 458 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PDCD1Q15116 RPL21P38-201ENST00000418090 167 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PDCD1Q15116 AC004870.4-201ENST00000424359 360 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
PDCD1Q15116 RN7SL293P-201ENST00000481765 281 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PDCD1Q15116 LINC02064-201ENST00000506492 470 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
PDCD1Q15116 DEFB131C-201ENST00000528817 165 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PDCD1Q15116 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
PDCD1Q15116 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
PDCD1Q15116 RNVU1-4-201ENST00000612985 164 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PDCD1Q15116 AC023490.1-201ENST00000614584 375 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
PDCD1Q15116 AL357075.2-201ENST00000614906 189 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PDCD1Q15116 AC011718.1-201ENST00000622906 375 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
PDCD1Q15116 ANP32E-209ENST00000616917 2989 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
PDCD1Q15116 PHF3-202ENST00000393387 6947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
PDCD1Q15116 ZNF483-201ENST00000309235 3655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
PDCD1Q15116 TMEM232-201ENST00000455884 2501 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
PDCD1Q15116 EPS15-202ENST00000371730 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
PDCD1Q15116 BMP5-201ENST00000370830 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
PDCD1Q15116 APCS-201ENST00000255040 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
PDCD1Q15116 CASP1-201ENST00000353247 423 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
PDCD1Q15116 MIR30E-201ENST00000362104 92 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PDCD1Q15116 MIR335-201ENST00000362173 94 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PDCD1Q15116 RNU6-727P-201ENST00000363592 107 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PDCD1Q15116 RNU6-461P-201ENST00000364195 107 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PDCD1Q15116 RNU6-1264P-201ENST00000383891 107 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PDCD1Q15116 RNU6-21P-201ENST00000384710 107 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PDCD1Q15116 Y_RNA.570-201ENST00000384750 101 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PDCD1Q15116 MT-TW-201ENST00000387382 68 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PDCD1Q15116 RNU6-1203P-201ENST00000410703 110 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
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