Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 Y_RNA.594-201ENST00000410373 140 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
BRD3Q15059 RNU2-52P-201ENST00000410680 190 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
BRD3Q15059 AC123900.1-201ENST00000420390 96 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
BRD3Q15059 AC098614.3-201ENST00000438957 440 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
BRD3Q15059 snoU13.30-201ENST00000458951 104 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
BRD3Q15059 Y_RNA.691-201ENST00000516611 103 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
BRD3Q15059 RNU2-44P-201ENST00000516795 194 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
BRD3Q15059 AC027018.1-202ENST00000534723 383 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
BRD3Q15059 AC009107.1-201ENST00000561923 330 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
BRD3Q15059 MYL12BP1-201ENST00000569826 507 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
BRD3Q15059 TCL6_2.1-201ENST00000615162 119 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
BRD3Q15059 TPTEP1-208ENST00000636884 213 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
BRD3Q15059 CYLC2-201ENST00000374798 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
BRD3Q15059 AP006437.1-201ENST00000641440 3685 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
BRD3Q15059 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
BRD3Q15059 SNORA5B-201ENST00000363786 132 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
BRD3Q15059 RNU6-160P-201ENST00000384591 107 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
BRD3Q15059 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
BRD3Q15059 SNORA12.2-201ENST00000391040 156 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
BRD3Q15059 RNA5SP465-201ENST00000391195 109 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
BRD3Q15059 PLCL2-AS1-201ENST00000414844 311 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
BRD3Q15059 AC004386.2-201ENST00000441858 148 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
BRD3Q15059 SNRPEP8-201ENST00000442866 260 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
BRD3Q15059 RPL30P10-201ENST00000488148 337 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
BRD3Q15059 HMGN1P12-201ENST00000499125 195 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
BRD3Q15059 LINC02233-201ENST00000513718 358 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
BRD3Q15059 MIR4801-201ENST00000582704 82 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
BRD3Q15059 MIR5006-201ENST00000583027 110 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
BRD3Q15059 ELOCP29-201ENST00000588193 334 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
BRD3Q15059 AC022335.1-204ENST00000590779 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
BRD3Q15059 RMST_6.1-201ENST00000611980 203 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
BRD3Q15059 ZNF404-202ENST00000587539 1851 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
BRD3Q15059 BX322639.1-202ENST00000423987 2213 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
BRD3Q15059 RNU1-58P-201ENST00000362413 163 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
BRD3Q15059 Y_RNA.482-201ENST00000384377 111 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
BRD3Q15059 MIR153-2-201ENST00000385225 87 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
BRD3Q15059 AL355497.1-201ENST00000406262 551 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
BRD3Q15059 RNU6-1050P-201ENST00000410388 107 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
BRD3Q15059 RNA5SP21-201ENST00000410917 96 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
BRD3Q15059 MTCO3P8-201ENST00000453691 755 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
BRD3Q15059 AC009468.2-201ENST00000457372 366 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
BRD3Q15059 AC016925.1-201ENST00000458303 298 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
BRD3Q15059 SNORD109B-201ENST00000458961 67 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
BRD3Q15059 SNORD109A-201ENST00000459128 67 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
BRD3Q15059 AL049873.1-201ENST00000480540 376 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
BRD3Q15059 AC105389.2-201ENST00000506475 435 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
BRD3Q15059 Y_RNA.670-201ENST00000516255 105 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
BRD3Q15059 IGHVII-62-1-201ENST00000519283 235 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
BRD3Q15059 IGHVIII-5-1-201ENST00000523059 99 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
BRD3Q15059 CBX3P8-201ENST00000532412 525 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
BRD3Q15059 AP003174.2-201ENST00000544663 294 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
BRD3Q15059 AC022035.1-201ENST00000579923 302 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
BRD3Q15059 7SK.7-201ENST00000603504 247 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
BRD3Q15059 SNRPGP20-201ENST00000604477 205 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
BRD3Q15059 WT1-AS_8.1-201ENST00000615200 275 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
BRD3Q15059 CDKN3-212ENST00000620759 196 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
BRD3Q15059 MPP6-209ENST00000625307 126 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
BRD3Q15059 DEUP1-202ENST00000525646 1920 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
BRD3Q15059 XRCC4-205ENST00000511817 1636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
BRD3Q15059 LINC02555-201ENST00000563933 1951 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
BRD3Q15059 ZNF204P-201ENST00000416749 2397 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
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BRD3Q15059 RNU6-595P-201ENST00000363944 107 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
BRD3Q15059 SNORD115-38-201ENST00000365037 82 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
BRD3Q15059 AL354864.1-201ENST00000373226 539 ntTSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
BRD3Q15059 AC009237.7-201ENST00000447357 229 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
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BRD3Q15059 Y_RNA.708-201ENST00000516950 96 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
BRD3Q15059 AC104211.3-201ENST00000518861 270 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
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BRD3Q15059 AC019183.1-201ENST00000580524 505 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
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BRD3Q15059 AC099654.5-201ENST00000636479 350 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
BRD3Q15059 ZNF720P1-201ENST00000562403 1939 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
BRD3Q15059 TAB3-203ENST00000378930 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
BRD3Q15059 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
BRD3Q15059 MIR21-201ENST00000362134 72 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
BRD3Q15059 Y_RNA.48-201ENST00000362710 103 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
BRD3Q15059 Y_RNA.319-201ENST00000365138 92 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
BRD3Q15059 EQTN-201ENST00000380031 725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
BRD3Q15059 Y_RNA.490-201ENST00000384413 102 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
BRD3Q15059 MIR597-201ENST00000384968 97 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
BRD3Q15059 RNU11-3P-201ENST00000391111 133 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
BRD3Q15059 MIR320B2-201ENST00000408479 138 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
BRD3Q15059 AC004866.1-201ENST00000411748 78 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
BRD3Q15059 NCOR1P3-201ENST00000420479 303 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
BRD3Q15059 HMGN2P3-201ENST00000433603 273 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
BRD3Q15059 HMGN2P5-201ENST00000436882 273 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
BRD3Q15059 AL109933.2-201ENST00000452651 260 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
BRD3Q15059 RN7SKP210-201ENST00000459176 261 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
BRD3Q15059 ATP1B3-AS1-201ENST00000492725 376 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
BRD3Q15059 RNA5SP82-201ENST00000516707 92 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
BRD3Q15059 RNA5SP54-201ENST00000516951 92 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
BRD3Q15059 AP005660.1-201ENST00000522972 293 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
BRD3Q15059 AL590705.4-201ENST00000532209 134 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
BRD3Q15059 AC009229.3-201ENST00000608056 282 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
BRD3Q15059 AL590240.4-201ENST00000616908 390 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
BRD3Q15059 AL807742.1-203ENST00000637444 759 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
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