Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

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Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 RNU6-1159P-201ENST00000362933 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CKAP5Q14008 RNU6-529P-201ENST00000363383 104 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CKAP5Q14008 RNU6-1210P-201ENST00000363775 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CKAP5Q14008 SEMG1-201ENST00000372781 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
CKAP5Q14008 Y_RNA.389-201ENST00000383924 113 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CKAP5Q14008 RN7SKP192-201ENST00000411291 327 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CKAP5Q14008 AL358234.1-201ENST00000421132 273 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
CKAP5Q14008 AC139712.2-201ENST00000424302 339 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CKAP5Q14008 AC007566.1-201ENST00000427458 643 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
CKAP5Q14008 AC004869.2-201ENST00000436501 229 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
CKAP5Q14008 RPL36AP48-201ENST00000485521 314 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CKAP5Q14008 TECRL-202ENST00000507440 2876 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
CKAP5Q14008 RNU6-1198P-201ENST00000516904 67 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CKAP5Q14008 SCARNA3-201ENST00000517097 143 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CKAP5Q14008 LINC00933-203ENST00000559812 219 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CKAP5Q14008 MIR4435-1-201ENST00000582552 80 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CKAP5Q14008 MIR4506-201ENST00000584693 77 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CKAP5Q14008 AC012254.1-201ENST00000592747 200 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
CKAP5Q14008 ZNF616-202ENST00000596290 568 ntTSL 4 BASIC2.57□□□□□ -2
CKAP5Q14008 AC073308.1-201ENST00000623696 305 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CKAP5Q14008 AL359854.1-201ENST00000614203 1594 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CKAP5Q14008 Y_RNA.44-201ENST00000362676 108 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CKAP5Q14008 Y_RNA.48-201ENST00000362710 103 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CKAP5Q14008 RNU6-799P-201ENST00000363567 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CKAP5Q14008 RNU1-100P-201ENST00000365255 165 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CKAP5Q14008 RNU6-611P-201ENST00000384276 104 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CKAP5Q14008 RPL21P75-201ENST00000396599 483 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CKAP5Q14008 RPL21P28-201ENST00000401418 483 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CKAP5Q14008 AC003685.2-201ENST00000422795 395 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CKAP5Q14008 AL590556.1-201ENST00000423231 483 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CKAP5Q14008 LINC00407-201ENST00000426509 295 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
CKAP5Q14008 RPS15AP7-201ENST00000439294 405 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CKAP5Q14008 AC007969.2-201ENST00000441891 191 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CKAP5Q14008 AC112492.4-201ENST00000456549 352 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CKAP5Q14008 RPL21P39-201ENST00000463605 483 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CKAP5Q14008 AC008571.1-201ENST00000467232 300 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CKAP5Q14008 AC087190.1-201ENST00000484462 480 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CKAP5Q14008 AC107032.1-201ENST00000485945 480 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CKAP5Q14008 AC132942.1-201ENST00000486753 483 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CKAP5Q14008 AC093591.1-201ENST00000491435 481 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CKAP5Q14008 RPL21P16-201ENST00000495531 483 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CKAP5Q14008 RN7SL636P-201ENST00000497504 294 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CKAP5Q14008 MRPS35P2-201ENST00000508242 191 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CKAP5Q14008 RNU6-1271P-201ENST00000517049 105 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CKAP5Q14008 HSPE1P20-201ENST00000538133 289 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CKAP5Q14008 MDM2-232ENST00000544561 213 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
CKAP5Q14008 AC027288.2-201ENST00000553028 243 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CKAP5Q14008 GNG2-205ENST00000554736 569 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.56□□□□□ -2
CKAP5Q14008 AL132819.1-201ENST00000555595 208 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
CKAP5Q14008 LINC01684-201ENST00000415182 2176 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
CKAP5Q14008 OR5V1-217ENST00000641768 2763 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
CKAP5Q14008 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
CKAP5Q14008 MIR27B-201ENST00000385129 97 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CKAP5Q14008 SNORA12-201ENST00000391162 147 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CKAP5Q14008 CBX3P9-201ENST00000402326 552 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CKAP5Q14008 YWHAEP4-201ENST00000505390 198 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CKAP5Q14008 AC074131.1-201ENST00000514662 253 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
CKAP5Q14008 AL359962.2-201ENST00000610044 303 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
CKAP5Q14008 AC241585.2-209ENST00000638217 143 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CKAP5Q14008 CNOT6L-201ENST00000504123 8843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
CKAP5Q14008 AC002543.1-201ENST00000299783 1954 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CKAP5Q14008 CYLC1-201ENST00000329312 2106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
CKAP5Q14008 U8.2-201ENST00000363156 134 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CKAP5Q14008 RNA5SP139-201ENST00000364340 117 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CKAP5Q14008 RNU6-505P-201ENST00000384427 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CKAP5Q14008 MIR518C-201ENST00000384822 101 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CKAP5Q14008 AL359511.1-201ENST00000402970 211 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CKAP5Q14008 Y_RNA.618-201ENST00000410949 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CKAP5Q14008 AL513008.1-201ENST00000412701 161 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
CKAP5Q14008 KCNJ6-AS1-201ENST00000435001 357 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
CKAP5Q14008 HMGN2P16-201ENST00000456802 261 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CKAP5Q14008 AP002884.2-201ENST00000471647 395 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CKAP5Q14008 RPL30P1-201ENST00000488676 339 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CKAP5Q14008 RNU6-475P-201ENST00000516073 104 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CKAP5Q14008 Y_RNA.721-201ENST00000517207 102 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CKAP5Q14008 AC009120.5-201ENST00000561669 475 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
CKAP5Q14008 AC130469.1-201ENST00000597256 388 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
CKAP5Q14008 U2.1-201ENST00000618978 145 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CKAP5Q14008 WARS-244ENST00000627608 123 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
CKAP5Q14008 N4BP2L2-211ENST00000504114 2513 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
CKAP5Q14008 RTL4-201ENST00000340433 2613 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
CKAP5Q14008 MGAT4C-211ENST00000621808 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
CKAP5Q14008 ZMYM2-203ENST00000382874 10139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
CKAP5Q14008 RRAS2-211ENST00000537760 2034 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
CKAP5Q14008 NBPF20-202ENST00000392971 18450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
CKAP5Q14008 AC092268.1-201ENST00000342691 405 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CKAP5Q14008 RNU4-50P-201ENST00000364361 141 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CKAP5Q14008 MIR568-201ENST00000385036 95 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CKAP5Q14008 RNA5SP390-201ENST00000410191 113 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CKAP5Q14008 AC114482.1-201ENST00000418010 247 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CKAP5Q14008 TRAPPC2P4-201ENST00000421750 331 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CKAP5Q14008 MS4A4E-203ENST00000425663 350 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
CKAP5Q14008 PCNPP5-201ENST00000452246 481 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CKAP5Q14008 AL139260.1-202ENST00000456813 441 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
CKAP5Q14008 AL441985.1-201ENST00000457727 251 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CKAP5Q14008 MRPS36P2-201ENST00000512569 299 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CKAP5Q14008 RNU6-1143P-201ENST00000516125 104 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CKAP5Q14008 GNAI2P1-201ENST00000541815 315 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CKAP5Q14008 AC007948.1-201ENST00000581632 242 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
CKAP5Q14008 RPS15AP11-201ENST00000594193 385 ntBASIC2.54□□□□□ -2
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