Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 AC121342.1-201ENST00000423914 550 ntTSL 3 BASIC0.03□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 AC010154.1-201ENST00000425857 269 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 AC013262.1-201ENST00000426710 252 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 LINC00354-202ENST00000440860 376 ntTSL 2 BASIC0.03□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 DAP3P1-201ENST00000441522 278 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 AC007000.2-201ENST00000442564 487 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 Y_RNA.654-201ENST00000497848 106 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 AC116347.2-201ENST00000514912 523 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 RNU6-917P-201ENST00000516294 104 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 AC025524.2-207ENST00000520097 506 ntTSL 3 BASIC0.03□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 DEFB131D-201ENST00000526803 184 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 AC087318.1-201ENST00000536786 389 ntTSL 3 BASIC0.03□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 AC099811.4-201ENST00000592536 496 ntTSL 2 BASIC0.03□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 AL929325.1-201ENST00000603096 117 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 MIR15A-201ENST00000607334 83 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 AC021506.2-201ENST00000612354 169 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
CACNA1CQ13936 PMCH-201ENST00000329406 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.02□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 MIR16-2-201ENST00000362117 81 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 SNORD114-16-201ENST00000363044 70 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 SNORA42.1-201ENST00000363515 137 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 SNORD114-9-201ENST00000364370 72 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 Y_RNA.534-201ENST00000384599 112 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 AL031779.1-201ENST00000415663 330 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 ELOCP9-201ENST00000418624 239 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 AC244098.3-201ENST00000424803 96 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 AC245047.3-201ENST00000429428 127 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 AC097473.1-201ENST00000508142 408 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 LINC01337-201ENST00000515871 440 ntTSL 3 BASIC0.02□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 AP003174.2-201ENST00000544663 294 ntTSL 3 BASIC0.02□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 AC093012.1-202ENST00000549403 582 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 AC090517.1-201ENST00000569307 266 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 AC137800.2-201ENST00000574375 120 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 AC127540.1-201ENST00000580311 689 ntTSL 5 BASIC0.02□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 LINC01893-201ENST00000581750 479 ntTSL 3 BASIC0.02□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 Z99497.2-201ENST00000603634 310 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 AC022217.4-201ENST00000604389 163 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 AL450270.1-201ENST00000606160 391 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 uc_338.6-201ENST00000613544 171 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 MIR8084-201ENST00000614105 89 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 TUG1_2.1-201ENST00000614234 87 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 MIR103A2-201ENST00000362154 78 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 RNU4-79P-201ENST00000362764 141 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 Y_RNA.132-201ENST00000363421 102 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 RNU4-56P-201ENST00000364700 142 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 RNY3-201ENST00000365484 102 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 MIR520G-201ENST00000385064 90 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 MIR520H-201ENST00000385126 88 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 RNA5SP219-201ENST00000390940 113 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 SPINK13-201ENST00000398450 509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.02□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 BX664727.1-201ENST00000416024 466 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 AL354692.1-201ENST00000423044 315 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 ZFAND6P1-201ENST00000434138 605 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 RPL23AP50-201ENST00000434149 455 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 AC005019.2-201ENST00000434321 359 ntTSL 5 BASIC0.02□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 AC002486.1-201ENST00000435098 391 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 AC099063.1-201ENST00000437128 324 ntTSL 5 BASIC0.02□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 AL008629.1-201ENST00000438615 184 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 RPS27AP8-201ENST00000452665 445 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 AC114501.3-201ENST00000453648 164 ntTSL 5 BASIC0.02□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 AC016751.1-201ENST00000458254 306 ntTSL 3 BASIC0.02□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 AC016925.1-201ENST00000458303 298 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 AC079943.1-201ENST00000491909 466 ntTSL 3 BASIC0.02□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 AC010469.2-201ENST00000496412 480 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 Y_RNA.689-201ENST00000516589 107 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 ZNF706-202ENST00000517844 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC0.02□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 MDM2-221ENST00000517852 393 ntTSL 1 (best) BASIC0.02□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 MTND4LP26-201ENST00000518144 282 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 AC023632.1-201ENST00000518463 375 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 CCDC7-209ENST00000539197 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.02□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 AC092325.1-201ENST00000566449 554 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 AL445435.1-201ENST00000604232 665 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 AP001033.2-201ENST00000609701 1003 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 AL360219.1-201ENST00000610230 366 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 AC092634.7-201ENST00000621022 103 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 MTND5P16-201ENST00000460269 1703 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 RNU4-15P-201ENST00000362613 141 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 Y_RNA.124-201ENST00000363339 93 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 Y_RNA.457-201ENST00000384237 111 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 Y_RNA.572-201ENST00000384757 98 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 RNU6-1025P-201ENST00000410629 104 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 MTND4LP7-201ENST00000431728 294 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 SEPT7P5-201ENST00000434048 306 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 RPL18AP17-201ENST00000455326 198 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 RPL39P39-201ENST00000455840 151 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 AC108729.2-201ENST00000476543 840 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 AC114981.1-201ENST00000503897 678 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 RNU6-914P-201ENST00000516749 109 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 AC023538.1-201ENST00000534576 736 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 AC126177.2-201ENST00000552154 452 ntTSL 3 BASIC0.01□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 AC009269.4-201ENST00000557828 440 ntTSL 3 BASIC0.01□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 MIR1273C-201ENST00000578669 77 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 MIR4742-201ENST00000581069 85 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 AC091135.1-201ENST00000585943 307 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 AL451064.1-201ENST00000607718 471 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 AC005696.2-201ENST00000610120 626 ntTSL 3 BASIC0.01□□□□□ -2.41
CACNA1CQ13936 AC097478.2-201ENST00000610572 514 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
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