Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 AL031577.2-201ENST00000404133 280 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
APOFQ13790 AC105271.1-202ENST00000411417 445 ntTSL 3 BASIC0.88□□□□□ -2.27
APOFQ13790 AC005009.1-201ENST00000423979 269 ntTSL 2 BASIC0.88□□□□□ -2.27
APOFQ13790 AC003659.1-201ENST00000424251 465 ntTSL 5 BASIC0.88□□□□□ -2.27
APOFQ13790 AC002486.1-201ENST00000435098 391 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
APOFQ13790 PLCB1-IT1-201ENST00000441231 373 ntTSL 3 BASIC0.88□□□□□ -2.27
APOFQ13790 ZNF736P12Y-201ENST00000443152 1243 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
APOFQ13790 snoU13.30-201ENST00000458951 104 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
APOFQ13790 RPL39P28-201ENST00000465655 155 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
APOFQ13790 GMFBP1-201ENST00000467831 427 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
APOFQ13790 UBL5P1-201ENST00000507979 193 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
APOFQ13790 LINC02220-201ENST00000510065 270 ntTSL 5 BASIC0.88□□□□□ -2.27
APOFQ13790 RNU6-567P-201ENST00000516746 107 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
APOFQ13790 AC021231.3-201ENST00000558497 370 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
APOFQ13790 PWRN1-203ENST00000564898 389 ntTSL 5 BASIC0.88□□□□□ -2.27
APOFQ13790 AGGF1P4-201ENST00000568249 801 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
APOFQ13790 AC136932.1-201ENST00000574771 208 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
APOFQ13790 MIR4703-201ENST00000577728 79 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
APOFQ13790 AC002044.1-201ENST00000606707 158 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
APOFQ13790 MIR3976-201ENST00000606807 139 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
APOFQ13790 AC064807.4-201ENST00000607201 407 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
APOFQ13790 AC008250.2-201ENST00000615261 205 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
APOFQ13790 AC022960.3-201ENST00000619794 441 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
APOFQ13790 SNORA43.4-201ENST00000629559 138 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
APOFQ13790 MTND5P35-201ENST00000557537 1720 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
APOFQ13790 Y_RNA.164-201ENST00000363709 102 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
APOFQ13790 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
APOFQ13790 Y_RNA.399-201ENST00000383955 105 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
APOFQ13790 RNU2-7P-201ENST00000410794 178 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
APOFQ13790 HMGN1P14-201ENST00000412459 517 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
APOFQ13790 MTCO2P34-201ENST00000421994 607 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
APOFQ13790 AL512656.1-201ENST00000427492 401 ntTSL 2 BASIC0.87□□□□□ -2.27
APOFQ13790 RPL31P35-201ENST00000431058 377 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
APOFQ13790 DYNLT3P2-201ENST00000442517 295 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
APOFQ13790 AC099566.1-201ENST00000442558 479 ntTSL 3 BASIC0.87□□□□□ -2.27
APOFQ13790 AF127577.5-201ENST00000449746 446 ntTSL 3 BASIC0.87□□□□□ -2.27
APOFQ13790 AL133217.1-201ENST00000450980 425 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
APOFQ13790 LINC01813-201ENST00000451034 712 ntTSL 1 (best) BASIC0.87□□□□□ -2.27
APOFQ13790 AL033528.1-201ENST00000453780 140 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
APOFQ13790 RPS29P15-201ENST00000458329 171 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
APOFQ13790 RPS23P5-201ENST00000495419 428 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
APOFQ13790 AC067942.3-201ENST00000512025 362 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
APOFQ13790 RNU6-856P-201ENST00000516959 98 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
APOFQ13790 IL7-206ENST00000520269 456 ntTSL 3 BASIC0.87□□□□□ -2.27
APOFQ13790 AC096558.1-203ENST00000550516 574 ntTSL 3 BASIC0.87□□□□□ -2.27
APOFQ13790 AC025580.2-205ENST00000559960 552 ntTSL 4 BASIC0.87□□□□□ -2.27
APOFQ13790 U91328.3-201ENST00000608931 354 ntTSL 3 BASIC0.87□□□□□ -2.27
APOFQ13790 AC006566.1-201ENST00000608943 513 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
APOFQ13790 AP001506.1-201ENST00000615444 211 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
APOFQ13790 AP3S1-209ENST00000640413 489 ntTSL 5 BASIC0.87□□□□□ -2.27
APOFQ13790 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.87□□□□□ -2.27
APOFQ13790 SEMG1-201ENST00000372781 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.87□□□□□ -2.27
APOFQ13790 AGR3-201ENST00000310398 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.86□□□□□ -2.27
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APOFQ13790 LINC00894-208ENST00000455777 284 ntTSL 2 BASIC0.86□□□□□ -2.27
APOFQ13790 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
APOFQ13790 AC093292.1-201ENST00000505050 449 ntTSL 3 BASIC0.86□□□□□ -2.27
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APOFQ13790 SNORA59B-202ENST00000578183 701 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
APOFQ13790 MIR3941-201ENST00000582572 103 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
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APOFQ13790 Y_RNA.504-201ENST00000384481 104 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
APOFQ13790 Y_RNA.560-201ENST00000384689 102 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
APOFQ13790 LINC01701-201ENST00000419614 451 ntTSL 2 BASIC0.85□□□□□ -2.27
APOFQ13790 AC012306.1-201ENST00000423267 114 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
APOFQ13790 CYCSP46-201ENST00000423569 204 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
APOFQ13790 MTCO3P29-201ENST00000432119 779 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
APOFQ13790 AC244505.5-201ENST00000443639 207 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
APOFQ13790 AL589678.1-201ENST00000452685 561 ntTSL 3 BASIC0.85□□□□□ -2.27
APOFQ13790 SCARNA18-201ENST00000459004 134 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
APOFQ13790 PLCH1-AS2-201ENST00000472913 408 ntTSL 2 BASIC0.85□□□□□ -2.27
APOFQ13790 RNA5SP384-201ENST00000516615 116 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
APOFQ13790 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC0.85□□□□□ -2.27
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APOFQ13790 AC109446.2-201ENST00000567872 497 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
APOFQ13790 AC025887.1-201ENST00000578349 264 ntTSL 3 BASIC0.85□□□□□ -2.27
APOFQ13790 RSL24D1P11-201ENST00000591045 491 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
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APOFQ13790 MESTIT1_1.1-201ENST00000618871 140 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
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