Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 AC069540.2-201ENST00000441776 351 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
CUL4BQ13620 AC009238.1-201ENST00000442165 424 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CUL4BQ13620 SNRPEP8-201ENST00000442866 260 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CUL4BQ13620 AC009237.6-201ENST00000446969 424 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CUL4BQ13620 snoU13.30-201ENST00000458951 104 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CUL4BQ13620 RPL7P42-201ENST00000481005 679 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CUL4BQ13620 RPL30P10-201ENST00000488148 337 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CUL4BQ13620 AC234781.5-201ENST00000508429 271 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CUL4BQ13620 AC097467.1-201ENST00000513660 370 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
CUL4BQ13620 AC021269.2-201ENST00000532318 330 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CUL4BQ13620 AC022616.8-201ENST00000533569 253 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CUL4BQ13620 APOOP3-201ENST00000536787 586 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CUL4BQ13620 AC026462.3-202ENST00000564361 515 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
CUL4BQ13620 FRG2DP-202ENST00000566967 323 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CUL4BQ13620 AL158827.2-201ENST00000602494 330 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CUL4BQ13620 B3GNTL1P2-201ENST00000603673 288 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CUL4BQ13620 AL589935.1-202ENST00000612512 393 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
CUL4BQ13620 AC133104.2-201ENST00000615272 193 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CUL4BQ13620 AL691447.3-201ENST00000635020 330 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CUL4BQ13620 ENAM-201ENST00000396073 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
CUL4BQ13620 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
CUL4BQ13620 ARHGAP15-202ENST00000409869 2968 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
CUL4BQ13620 AGL-204ENST00000370161 6923 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
CUL4BQ13620 RNU1-23P-201ENST00000363361 144 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CUL4BQ13620 RNU6-944P-201ENST00000364023 107 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CUL4BQ13620 Y_RNA.404-201ENST00000383978 102 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CUL4BQ13620 RNU6-378P-201ENST00000384324 107 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CUL4BQ13620 RNU2-32P-201ENST00000411193 191 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CUL4BQ13620 MTCO2P27-201ENST00000420740 428 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CUL4BQ13620 AL356010.2-201ENST00000422844 197 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
CUL4BQ13620 MS4A4E-203ENST00000425663 350 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
CUL4BQ13620 NCOA7-AS1-201ENST00000429007 501 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
CUL4BQ13620 AC236972.2-201ENST00000434979 310 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CUL4BQ13620 AC018634.1-201ENST00000437554 401 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CUL4BQ13620 HMGB3P3-201ENST00000510526 400 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CUL4BQ13620 RNU6-1198P-201ENST00000516904 67 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CUL4BQ13620 AL590705.4-201ENST00000532209 134 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CUL4BQ13620 RAB11AP2-201ENST00000545905 639 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CUL4BQ13620 AC104581.2-201ENST00000572227 430 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CUL4BQ13620 AL117336.2-201ENST00000602435 335 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CUL4BQ13620 AC023490.3-201ENST00000621762 358 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
CUL4BQ13620 AC243829.7-201ENST00000633081 225 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CUL4BQ13620 AC112487.2-201ENST00000637950 304 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CUL4BQ13620 AP000550.4-201ENST00000639507 358 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
CUL4BQ13620 ANP32E-209ENST00000616917 2989 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
CUL4BQ13620 RNU6-137P-201ENST00000363680 108 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CUL4BQ13620 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CUL4BQ13620 Y_RNA.473-201ENST00000384333 102 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CUL4BQ13620 RNU6-1093P-201ENST00000391194 107 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CUL4BQ13620 AL513328.1-201ENST00000446460 224 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CUL4BQ13620 Y_RNA.653-201ENST00000459091 95 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CUL4BQ13620 AC007215.1-201ENST00000464893 276 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CUL4BQ13620 AC097473.1-201ENST00000508142 408 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CUL4BQ13620 LINC02501-201ENST00000510420 426 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CUL4BQ13620 RNU7-175P-201ENST00000515915 61 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CUL4BQ13620 AP005436.2-201ENST00000528458 252 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CUL4BQ13620 CBX3P8-201ENST00000532412 525 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CUL4BQ13620 AC121758.2-201ENST00000553271 193 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CUL4BQ13620 DEUP1-202ENST00000525646 1920 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
CUL4BQ13620 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
CUL4BQ13620 RNU4-73P-201ENST00000363164 141 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CUL4BQ13620 SNORD114-30-201ENST00000364448 72 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CUL4BQ13620 SNORA25B-201ENST00000365507 128 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CUL4BQ13620 FAM206A-202ENST00000374624 499 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
CUL4BQ13620 RNU6-26P-201ENST00000383985 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CUL4BQ13620 MIR153-2-201ENST00000385225 87 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CUL4BQ13620 TRDJ2-201ENST00000390475 54 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
CUL4BQ13620 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CUL4BQ13620 LINC01549-201ENST00000440664 714 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
CUL4BQ13620 AL445524.1-202ENST00000440665 416 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
CUL4BQ13620 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CUL4BQ13620 snoU13.6-201ENST00000458785 104 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CUL4BQ13620 RN7SL636P-201ENST00000497504 294 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CUL4BQ13620 AC107222.1-201ENST00000510899 637 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CUL4BQ13620 RNA5SP384-201ENST00000516615 116 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CUL4BQ13620 HSPE1P18-201ENST00000517602 280 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CUL4BQ13620 IGHVIII-5-1-201ENST00000523059 99 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CUL4BQ13620 AP000889.1-201ENST00000530968 660 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CUL4BQ13620 MIR5701-3-201ENST00000578890 82 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CUL4BQ13620 MIR5701-1-201ENST00000585138 82 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CUL4BQ13620 AC010928.2-201ENST00000588017 287 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CUL4BQ13620 AL160408.5-201ENST00000607759 526 ntTSL 4 BASIC2.58□□□□□ -2
CUL4BQ13620 MIR5701-2-201ENST00000615634 82 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CUL4BQ13620 ST7-OT4_2.1-201ENST00000619089 172 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CUL4BQ13620 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
CUL4BQ13620 CCPG1-203ENST00000442196 3453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
CUL4BQ13620 SNORD115-8-201ENST00000363856 82 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CUL4BQ13620 Y_RNA.259-201ENST00000364619 101 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CUL4BQ13620 SNORD115-38-201ENST00000365037 82 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CUL4BQ13620 RNU6-611P-201ENST00000384276 104 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CUL4BQ13620 RNU6-310P-201ENST00000384655 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CUL4BQ13620 SNORA75.6-201ENST00000391318 127 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CUL4BQ13620 AL157709.1-201ENST00000412695 424 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
CUL4BQ13620 Y_RNA.632-201ENST00000459189 102 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CUL4BQ13620 AC018868.1-201ENST00000491307 315 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CUL4BQ13620 AC010255.2-201ENST00000505209 428 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
CUL4BQ13620 RNA5SP54-201ENST00000516951 92 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CUL4BQ13620 Y_RNA.718-201ENST00000517110 102 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CUL4BQ13620 NDUFA5P6-201ENST00000542110 379 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CUL4BQ13620 AC026470.2-201ENST00000561492 181 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.8 ms