Protein–RNA interactions for Protein: Q13445

TMED1, Transmembrane emp24 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED1Q13445 MIR4698-201ENST00000577795 80 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
TMED1Q13445 VN1R107P-201ENST00000601784 209 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
TMED1Q13445 AC064807.4-201ENST00000607201 407 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
TMED1Q13445 AC008250.2-201ENST00000615261 205 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
TMED1Q13445 uc_338.17-201ENST00000619633 179 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
TMED1Q13445 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
TMED1Q13445 TTK-211ENST00000627129 240 ntTSL 5 BASIC0.63□□□□□ -2.31
TMED1Q13445 RNU6-931P-201ENST00000363850 107 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
TMED1Q13445 LINC01674-201ENST00000427446 504 ntTSL 3 BASIC0.62□□□□□ -2.31
TMED1Q13445 AC034244.1-201ENST00000507687 207 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
TMED1Q13445 AC104136.1-201ENST00000512969 394 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
TMED1Q13445 AC126323.6-201ENST00000561701 451 ntTSL 3 BASIC0.62□□□□□ -2.31
TMED1Q13445 AC007631.1-201ENST00000578545 189 ntTSL 3 BASIC0.62□□□□□ -2.31
TMED1Q13445 AL136221.1-201ENST00000621449 509 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
TMED1Q13445 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
TMED1Q13445 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
TMED1Q13445 RNU6-533P-201ENST00000384144 107 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
TMED1Q13445 RNU6-505P-201ENST00000384427 107 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
TMED1Q13445 RNU6-417P-201ENST00000384712 107 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
TMED1Q13445 MIR520E-201ENST00000384867 87 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
TMED1Q13445 MIR1253-201ENST00000408273 105 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
TMED1Q13445 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
TMED1Q13445 MTND1P20-201ENST00000430341 950 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
TMED1Q13445 HSFY7P-201ENST00000432672 318 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
TMED1Q13445 HSFY8P-201ENST00000437934 318 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
TMED1Q13445 AL136972.1-201ENST00000443471 351 ntTSL 3 BASIC0.61□□□□□ -2.31
TMED1Q13445 SRRM1P2-201ENST00000464531 1192 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
TMED1Q13445 AL136537.1-201ENST00000508199 538 ntTSL 3 BASIC0.61□□□□□ -2.31
TMED1Q13445 RNU6-113P-201ENST00000516653 101 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
TMED1Q13445 LINC02155-201ENST00000519215 407 ntTSL 5 BASIC0.61□□□□□ -2.31
TMED1Q13445 AC007834.2-201ENST00000536310 343 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
TMED1Q13445 APOOP3-201ENST00000536787 586 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
TMED1Q13445 AC091489.2-201ENST00000566263 604 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
TMED1Q13445 MIR3973-201ENST00000579824 107 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
TMED1Q13445 AL359999.1-201ENST00000604513 294 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
TMED1Q13445 AL353765.1-201ENST00000605514 183 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
TMED1Q13445 AC005520.5-201ENST00000613926 164 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
TMED1Q13445 AL138960.2-201ENST00000625145 535 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
TMED1Q13445 VBP1-204ENST00000625964 1547 ntTSL 5 BASIC0.6□□□□□ -2.31
TMED1Q13445 Y_RNA.18-201ENST00000362461 102 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
TMED1Q13445 RNU6-562P-201ENST00000362731 107 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
TMED1Q13445 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
TMED1Q13445 RNU6-969P-201ENST00000383900 105 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
TMED1Q13445 RNU6-1235P-201ENST00000384559 107 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
TMED1Q13445 SNORD115.1-201ENST00000391109 76 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
TMED1Q13445 SNAP23P1-201ENST00000433229 246 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
TMED1Q13445 AL162395.1-201ENST00000457882 422 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
TMED1Q13445 RNU6-498P-201ENST00000459468 107 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
TMED1Q13445 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
TMED1Q13445 AC100807.1-201ENST00000517640 552 ntTSL 5 BASIC0.6□□□□□ -2.31
TMED1Q13445 Z99289.3-201ENST00000605586 594 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
TMED1Q13445 LINC01515-217ENST00000620859 694 ntTSL 5 BASIC0.6□□□□□ -2.31
TMED1Q13445 AL359697.1-201ENST00000624879 587 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
TMED1Q13445 AL445984.1-201ENST00000637834 659 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
TMED1Q13445 MIR337-201ENST00000362281 93 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
TMED1Q13445 RNU4-1-201ENST00000363925 141 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
TMED1Q13445 MIR92A1-201ENST00000385233 78 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
TMED1Q13445 MTCO3P18-201ENST00000440206 761 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
TMED1Q13445 AL133217.1-201ENST00000450980 425 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
TMED1Q13445 AC117454.1-201ENST00000491120 168 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
TMED1Q13445 MTCO3P7-201ENST00000510008 774 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
TMED1Q13445 AF131216.2-201ENST00000512316 564 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
TMED1Q13445 AC068205.1-204ENST00000532989 481 ntTSL 3 BASIC0.59□□□□□ -2.31
TMED1Q13445 AL359821.1-201ENST00000605519 182 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
TMED1Q13445 Y_RNA.576-201ENST00000384781 102 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
TMED1Q13445 RNU6-1093P-201ENST00000391194 107 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
TMED1Q13445 RNU2-8P-201ENST00000410727 190 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
TMED1Q13445 MTCO2P21-201ENST00000419780 677 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
TMED1Q13445 AC244505.5-201ENST00000443639 207 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
TMED1Q13445 AC016717.1-201ENST00000448918 286 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
TMED1Q13445 AC008628.2-201ENST00000502605 298 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
TMED1Q13445 ZNF436-AS1-205ENST00000518600 376 ntTSL 5 BASIC0.58□□□□□ -2.32
TMED1Q13445 AP003181.2-201ENST00000528941 181 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
TMED1Q13445 AC009229.3-201ENST00000608056 282 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
TMED1Q13445 PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 587 ntTSL 5 BASIC0.58□□□□□ -2.32
TMED1Q13445 HOXA11-AS1_6.1-201ENST00000620092 179 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
TMED1Q13445 AC138058.1-201ENST00000620572 449 ntTSL 3 BASIC0.58□□□□□ -2.32
TMED1Q13445 AC006001.4-201ENST00000622243 395 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
TMED1Q13445 AL603839.4-201ENST00000624658 1005 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
TMED1Q13445 PTP4A2-220ENST00000627328 615 ntTSL 5 BASIC0.58□□□□□ -2.32
TMED1Q13445 AL450472.1-202ENST00000637286 180 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
TMED1Q13445 E2F5-208ENST00000521429 1551 ntTSL 5 BASIC0.57□□□□□ -2.32
TMED1Q13445 AC018630.2-201ENST00000534866 2403 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
TMED1Q13445 RNU4-76P-201ENST00000364509 141 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
TMED1Q13445 SNORA36A-201ENST00000384221 132 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
TMED1Q13445 RPS29P13-201ENST00000402041 169 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
TMED1Q13445 AC095032.2-201ENST00000414923 418 ntTSL 2 BASIC0.57□□□□□ -2.32
TMED1Q13445 AC012306.1-201ENST00000423267 114 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
TMED1Q13445 AC005009.1-201ENST00000423979 269 ntTSL 2 BASIC0.57□□□□□ -2.32
TMED1Q13445 AL031274.1-201ENST00000450334 232 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
TMED1Q13445 AC013470.1-201ENST00000453438 462 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
TMED1Q13445 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
TMED1Q13445 AC010486.2-201ENST00000505572 483 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
TMED1Q13445 AK3P2-201ENST00000507976 429 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
TMED1Q13445 APELA-204ENST00000515275 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC0.57□□□□□ -2.32
TMED1Q13445 AP003484.1-201ENST00000530974 250 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
TMED1Q13445 AC100763.1-201ENST00000532735 522 ntTSL 3 BASIC0.57□□□□□ -2.32
TMED1Q13445 AC112481.1-201ENST00000549669 901 ntTSL 2 BASIC0.57□□□□□ -2.32
TMED1Q13445 Z99497.2-201ENST00000603634 310 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
TMED1Q13445 AC091805.2-201ENST00000603848 235 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 139.6 ms