Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 ARF4P2-201ENST00000430209 526 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
SF3B2Q13435 AC110995.1-201ENST00000444185 628 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
SF3B2Q13435 AL590422.1-201ENST00000451829 364 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
SF3B2Q13435 PRELID3BP1-201ENST00000457142 540 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
SF3B2Q13435 RNU7-23P-201ENST00000459465 62 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
SF3B2Q13435 RPL26P26-201ENST00000480251 434 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
SF3B2Q13435 TRBV12-2-201ENST00000489763 344 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
SF3B2Q13435 SNORA40.9-201ENST00000515895 93 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
SF3B2Q13435 Y_RNA.700-201ENST00000516806 100 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
SF3B2Q13435 RNU6-1231P-201ENST00000517185 103 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
SF3B2Q13435 AP003128.1-201ENST00000531414 448 ntTSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
SF3B2Q13435 RRN3P3-201ENST00000549207 578 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
SF3B2Q13435 MIR5047-201ENST00000579212 100 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
SF3B2Q13435 ZNF280C-201ENST00000370978 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
SF3B2Q13435 TTN-204ENST00000360870 18218 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
SF3B2Q13435 FIGNL1-201ENST00000356889 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
SF3B2Q13435 DMD-201ENST00000288447 3856 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
SF3B2Q13435 DEUP1-201ENST00000298050 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
SF3B2Q13435 CYSLTR1-201ENST00000373304 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
SF3B2Q13435 FOXP2-206ENST00000393491 6085 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
SF3B2Q13435 PCDH11X-208ENST00000504220 4017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
SF3B2Q13435 SNORA70B-201ENST00000384210 135 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SF3B2Q13435 Y_RNA.785-201ENST00000384290 109 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SF3B2Q13435 AC112220.1-201ENST00000434628 355 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SF3B2Q13435 SUMO1P3-201ENST00000439961 304 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SF3B2Q13435 AL445490.2-201ENST00000440492 441 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
SF3B2Q13435 RN7SL330P-201ENST00000469709 307 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SF3B2Q13435 AIG1P1-201ENST00000503376 148 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SF3B2Q13435 SNORA25.14-201ENST00000516481 132 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SF3B2Q13435 AK6P2-201ENST00000549020 471 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SF3B2Q13435 MIR4319-201ENST00000577285 85 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SF3B2Q13435 MIR4425-201ENST00000580572 84 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SF3B2Q13435 BX546450.2-201ENST00000602419 435 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
SF3B2Q13435 AL138880.2-201ENST00000616214 239 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SF3B2Q13435 NPPA-AS1_3.1-201ENST00000617059 108 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SF3B2Q13435 5S_rRNA.12-201ENST00000617631 107 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SF3B2Q13435 AC006111.3-201ENST00000622137 383 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SF3B2Q13435 OXR1-207ENST00000497705 2007 ntTSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
SF3B2Q13435 GLMN-201ENST00000370360 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
SF3B2Q13435 OGN-202ENST00000375561 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
SF3B2Q13435 ADGRG4-203ENST00000394143 9931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
SF3B2Q13435 ERBIN-203ENST00000380938 4701 ntTSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
SF3B2Q13435 RAD17-206ENST00000358030 2648 ntTSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
SF3B2Q13435 IL6ST-205ENST00000381294 2574 ntTSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
SF3B2Q13435 BAZ2B-202ENST00000343439 2364 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
SF3B2Q13435 MIR181A1HG-203ENST00000436880 2308 ntTSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
SF3B2Q13435 Y_RNA.29-201ENST00000362570 113 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
SF3B2Q13435 RNU6-961P-201ENST00000363893 105 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
SF3B2Q13435 Y_RNA.200-201ENST00000364018 102 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
SF3B2Q13435 Y_RNA.274-201ENST00000364714 101 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
SF3B2Q13435 Y_RNA.569-201ENST00000384749 103 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
SF3B2Q13435 MIR549A-201ENST00000385268 96 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
SF3B2Q13435 TRAJ17-201ENST00000390520 63 ntAPPRIS P1 BASIC4.31□□□□□ -1.72
SF3B2Q13435 MIR208B-201ENST00000401172 77 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
SF3B2Q13435 RPS26P42-201ENST00000413485 326 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
SF3B2Q13435 EEF1A1P41-201ENST00000414667 207 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
SF3B2Q13435 AL353743.2-202ENST00000439544 473 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
SF3B2Q13435 AC020743.3-201ENST00000440351 360 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
SF3B2Q13435 RNA5SP367-201ENST00000516557 118 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
SF3B2Q13435 RNU2-31P-201ENST00000516954 155 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
SF3B2Q13435 AL139193.1-201ENST00000554967 539 ntTSL 4 BASIC4.31□□□□□ -1.72
SF3B2Q13435 MIR3136-201ENST00000583498 78 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
SF3B2Q13435 TEX41-243ENST00000614173 190 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
SF3B2Q13435 SEL1L2-201ENST00000284951 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
SF3B2Q13435 UBE2W-203ENST00000517608 8426 ntTSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
SF3B2Q13435 AC010889.1-201ENST00000566193 2666 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SF3B2Q13435 PLPPR4-201ENST00000370184 4505 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SF3B2Q13435 Y_RNA.44-201ENST00000362676 108 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SF3B2Q13435 RNY1-201ENST00000364228 113 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SF3B2Q13435 SNORD58.1-201ENST00000391313 66 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SF3B2Q13435 MIR1298-201ENST00000408783 112 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SF3B2Q13435 AL390729.2-201ENST00000416137 156 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SF3B2Q13435 AL136320.1-201ENST00000417273 430 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SF3B2Q13435 AP000235.1-201ENST00000424017 479 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SF3B2Q13435 IGKV1OR9-2-201ENST00000431378 277 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SF3B2Q13435 IFT74-AS1-201ENST00000456198 405 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SF3B2Q13435 RN7SL594P-201ENST00000470590 287 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SF3B2Q13435 NDUFB9P3-201ENST00000521269 501 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SF3B2Q13435 AC026894.1-202ENST00000533843 477 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SF3B2Q13435 CYP4A27P-201ENST00000567218 190 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SF3B2Q13435 AC245748.3-201ENST00000588710 241 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SF3B2Q13435 RPS15AP11-201ENST00000594193 385 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SF3B2Q13435 AC103858.1-201ENST00000607019 476 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SF3B2Q13435 AC006001.4-201ENST00000622243 395 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SF3B2Q13435 AC073073.2-201ENST00000609827 2578 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SF3B2Q13435 DMXL1-201ENST00000311085 11072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
SF3B2Q13435 RTN4-209ENST00000405240 4061 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
SF3B2Q13435 SYNE1-201ENST00000341594 26584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SF3B2Q13435 ZNF83-201ENST00000301096 2599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SF3B2Q13435 AC135776.4-201ENST00000624300 1904 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SF3B2Q13435 SNORA25.1-201ENST00000362326 128 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SF3B2Q13435 Y_RNA.179-201ENST00000363844 90 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SF3B2Q13435 SNORA71.1-201ENST00000364523 117 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SF3B2Q13435 RNU6-1175P-201ENST00000365200 107 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SF3B2Q13435 RNU6-326P-201ENST00000365480 107 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SF3B2Q13435 RNU6-514P-201ENST00000384208 107 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SF3B2Q13435 Y_RNA.570-201ENST00000384750 101 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SF3B2Q13435 AC017079.2-201ENST00000416102 485 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SF3B2Q13435 SMG7-AS1-202ENST00000432837 466 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SF3B2Q13435 NDUFB1P1-201ENST00000435191 180 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
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