Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 AL359851.1-201ENST00000569460 4997 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SGCGQ13326 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
SGCGQ13326 GLMN-201ENST00000370360 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
SGCGQ13326 RNU4-15P-201ENST00000362613 141 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SGCGQ13326 Y_RNA.88-201ENST00000363029 99 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SGCGQ13326 SNORA25B-201ENST00000365507 128 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SGCGQ13326 SNORA12-201ENST00000391162 147 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SGCGQ13326 BTF3L4P2-201ENST00000392798 346 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SGCGQ13326 AL033519.2-201ENST00000403958 392 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SGCGQ13326 MIR548K-201ENST00000408406 116 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SGCGQ13326 RNU4-14P-201ENST00000410858 122 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SGCGQ13326 LINC01853-201ENST00000417715 444 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SGCGQ13326 USP9YP30-201ENST00000430729 455 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SGCGQ13326 AL353689.1-201ENST00000438895 199 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SGCGQ13326 AC098614.3-201ENST00000438957 440 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SGCGQ13326 AL442638.1-201ENST00000443359 237 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SGCGQ13326 U8.21-201ENST00000459536 136 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SGCGQ13326 FO393415.2-201ENST00000480085 343 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SGCGQ13326 AC021785.1-201ENST00000520780 453 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SGCGQ13326 AC103794.1-201ENST00000531763 197 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SGCGQ13326 AC026765.1-201ENST00000547876 435 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SGCGQ13326 AC007375.1-201ENST00000554513 578 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SGCGQ13326 AL121579.1-201ENST00000555129 305 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SGCGQ13326 AL137847.3-201ENST00000611521 109 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SGCGQ13326 AL355073.2-201ENST00000612106 557 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SGCGQ13326 MIR7843-201ENST00000622274 79 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SGCGQ13326 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SGCGQ13326 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SGCGQ13326 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
SGCGQ13326 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
SGCGQ13326 AGR3-201ENST00000310398 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
SGCGQ13326 Y_RNA.339-201ENST00000365325 102 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SGCGQ13326 RNU6-933P-201ENST00000384424 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SGCGQ13326 SNORA51.11-201ENST00000384442 131 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SGCGQ13326 AL023284.1-201ENST00000403956 276 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SGCGQ13326 RNU6-1304P-201ENST00000411374 106 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SGCGQ13326 MAMDC2-AS1-203ENST00000420573 339 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
SGCGQ13326 AL133396.1-201ENST00000432048 687 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SGCGQ13326 RPS3AP52-201ENST00000435639 297 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SGCGQ13326 SIRPG-AS1-201ENST00000437384 410 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
SGCGQ13326 TTTY16-201ENST00000437686 192 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
SGCGQ13326 HMGB1P18-201ENST00000438801 619 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SGCGQ13326 AL035634.1-201ENST00000446768 372 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
SGCGQ13326 AL035415.1-201ENST00000447150 289 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
SGCGQ13326 snoU13.6-201ENST00000458785 104 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SGCGQ13326 HYDIN2-201ENST00000493714 554 ntTSL 4 BASIC2.11□□□□□ -2.07
SGCGQ13326 AC091951.2-201ENST00000500762 203 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SGCGQ13326 AC005741.1-201ENST00000511094 432 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SGCGQ13326 AC046134.1-201ENST00000514454 666 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SGCGQ13326 AC034114.1-201ENST00000520293 285 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
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SGCGQ13326 MIR548S-201ENST00000581352 82 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SGCGQ13326 AL034555.1-201ENST00000604816 211 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SGCGQ13326 HOXA11-AS1_4.1-201ENST00000620901 233 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SGCGQ13326 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
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SGCGQ13326 Y_RNA.48-201ENST00000362710 103 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SGCGQ13326 SNORD50.1-201ENST00000362987 71 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SGCGQ13326 AL356432.1-201ENST00000405809 419 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SGCGQ13326 RN7SKP61-201ENST00000410642 295 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SGCGQ13326 AL158823.1-201ENST00000418441 478 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SGCGQ13326 AC005154.1-208ENST00000440438 353 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
SGCGQ13326 LINC01564-201ENST00000448327 566 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
SGCGQ13326 AC025918.1-201ENST00000452467 383 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
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SGCGQ13326 AC104564.1-201ENST00000493028 407 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SGCGQ13326 LINC02064-201ENST00000506492 470 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
SGCGQ13326 RNU6-965P-201ENST00000516721 96 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SGCGQ13326 RNU6-586P-201ENST00000517265 104 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SGCGQ13326 NDUFA5P6-201ENST00000542110 379 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SGCGQ13326 AP003174.2-201ENST00000544663 294 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
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SGCGQ13326 POLR3GP2-201ENST00000588366 668 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SGCGQ13326 AC008749.1-201ENST00000597650 306 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SGCGQ13326 SNRPGP17-201ENST00000603780 214 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SGCGQ13326 AC124303.1-201ENST00000605703 360 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SGCGQ13326 MIR8076-201ENST00000611401 83 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SGCGQ13326 AL359757.2-201ENST00000624309 274 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SGCGQ13326 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
SGCGQ13326 CYSLTR1-203ENST00000614798 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
SGCGQ13326 DEUP1-202ENST00000525646 1920 ntTSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
SGCGQ13326 RNU6-842P-201ENST00000384269 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SGCGQ13326 MIR487A-201ENST00000385009 80 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SGCGQ13326 MIR549A-201ENST00000385268 96 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SGCGQ13326 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC2.09□□□□□ -2.07
SGCGQ13326 AL079342.1-201ENST00000401460 267 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SGCGQ13326 HMGB3P2-201ENST00000411913 584 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SGCGQ13326 RPL23AP3-201ENST00000453844 468 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SGCGQ13326 AC145146.1-201ENST00000496370 254 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SGCGQ13326 AC021146.2-201ENST00000504736 556 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SGCGQ13326 AC091976.1-202ENST00000509211 630 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
SGCGQ13326 AC010420.1-201ENST00000515077 509 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
SGCGQ13326 MIR449C-201ENST00000516047 92 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SGCGQ13326 IGHVII-53-1-201ENST00000519538 255 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SGCGQ13326 AC009120.5-201ENST00000561669 475 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
SGCGQ13326 AC007347.1-201ENST00000563879 281 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
SGCGQ13326 AC005668.1-201ENST00000571142 476 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SGCGQ13326 Z98751.3-201ENST00000604447 521 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SGCGQ13326 AL670379.2-201ENST00000604983 252 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SGCGQ13326 TPTEP1-208ENST00000636884 213 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
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