Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 TBC1D31-214ENST00000522420 3167 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
TRIM28Q13263 EPC1-203ENST00000375110 3909 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
TRIM28Q13263 SERPINA7-201ENST00000327674 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
TRIM28Q13263 SCEL-202ENST00000377246 3081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
TRIM28Q13263 NR3C1-206ENST00000424646 4591 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
TRIM28Q13263 N4BP2L2-201ENST00000267068 9427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
TRIM28Q13263 CNGB3-201ENST00000320005 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
TRIM28Q13263 PHF6-201ENST00000332070 4759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
TRIM28Q13263 NLGN1-201ENST00000361589 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
TRIM28Q13263 NCOA1-201ENST00000288599 6952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
TRIM28Q13263 CEP170P1-201ENST00000502249 4587 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
TRIM28Q13263 RNA5SP235-201ENST00000365411 114 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
TRIM28Q13263 MIR153-1-201ENST00000384914 90 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
TRIM28Q13263 RNU4-47P-201ENST00000410876 114 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
TRIM28Q13263 NDUFB4P7-201ENST00000423198 363 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
TRIM28Q13263 AL360175.1-201ENST00000426547 285 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
TRIM28Q13263 AC112220.1-201ENST00000434628 355 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
TRIM28Q13263 RN7SL504P-201ENST00000494496 287 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
TRIM28Q13263 AC008871.1-201ENST00000510935 398 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
TRIM28Q13263 RNU6-436P-201ENST00000516171 114 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
TRIM28Q13263 SNORA70.19-201ENST00000516717 90 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
TRIM28Q13263 AC100871.2-201ENST00000522005 327 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
TRIM28Q13263 RGS5-206ENST00000527988 373 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
TRIM28Q13263 AC016256.1-201ENST00000547971 354 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
TRIM28Q13263 MTND5P34-201ENST00000568888 325 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
TRIM28Q13263 DSCR8-208ENST00000614538 403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
TRIM28Q13263 AC090132.2-201ENST00000615881 347 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
TRIM28Q13263 KBTBD3-207ENST00000534815 3396 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
TRIM28Q13263 RNF38-201ENST00000259605 5012 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
TRIM28Q13263 IFI16-208ENST00000448393 2245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
TRIM28Q13263 AC058791.1-201ENST00000608412 3198 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
TRIM28Q13263 PRKACB-219ENST00000614872 4306 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
TRIM28Q13263 CCDC178-205ENST00000406524 3039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.73
TRIM28Q13263 NEDD4-201ENST00000338963 7019 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.73
TRIM28Q13263 DNAJC10-201ENST00000264065 20129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.73
TRIM28Q13263 NR3C1-212ENST00000504572 3389 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
TRIM28Q13263 ZBED5-201ENST00000413761 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
TRIM28Q13263 RNU6-1180P-201ENST00000364935 107 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
TRIM28Q13263 RNU6-407P-201ENST00000365280 104 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
TRIM28Q13263 RNU6-629P-201ENST00000384061 103 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
TRIM28Q13263 AL442638.1-201ENST00000443359 237 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
TRIM28Q13263 RPS4XP2-201ENST00000458402 793 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
TRIM28Q13263 SNRPGP7-201ENST00000469016 106 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
TRIM28Q13263 RPS29P2-201ENST00000479278 136 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
TRIM28Q13263 TMEM132D-AS1-202ENST00000510001 293 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
TRIM28Q13263 Vault.1-201ENST00000516474 102 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
TRIM28Q13263 AP001328.1-201ENST00000528550 176 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
TRIM28Q13263 AC090049.2-201ENST00000550377 109 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
TRIM28Q13263 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
TRIM28Q13263 AL391813.1-201ENST00000603098 260 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
TRIM28Q13263 AC013791.1-201ENST00000616619 62 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
TRIM28Q13263 FPGT-TNNI3K-202ENST00000370895 7566 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
TRIM28Q13263 G2E3-201ENST00000206595 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
TRIM28Q13263 NAIP-205ENST00000508426 4153 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
TRIM28Q13263 PPP1R9A-208ENST00000456331 10090 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
TRIM28Q13263 AC134026.1-201ENST00000623249 2239 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
TRIM28Q13263 RNU1-140P-201ENST00000365040 165 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
TRIM28Q13263 SNORD6-201ENST00000365444 73 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
TRIM28Q13263 MIR518D-201ENST00000385014 87 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
TRIM28Q13263 MIR549A-201ENST00000385268 96 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
TRIM28Q13263 TRAV7-201ENST00000390429 337 ntAPPRIS P1 BASIC4.2□□□□□ -1.74
TRIM28Q13263 RPL26P27-201ENST00000414397 437 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
TRIM28Q13263 AL356867.1-201ENST00000429623 299 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
TRIM28Q13263 GPM6BP3-201ENST00000442797 145 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
TRIM28Q13263 AC113383.1-204ENST00000507060 552 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
TRIM28Q13263 MIR4738-201ENST00000579134 87 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
TRIM28Q13263 AC011471.1-201ENST00000585766 187 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
TRIM28Q13263 AP005264.4-201ENST00000592203 422 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
TRIM28Q13263 AC020895.1-201ENST00000595362 272 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
TRIM28Q13263 AL078604.3-201ENST00000615580 211 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
TRIM28Q13263 BMP5-201ENST00000370830 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
TRIM28Q13263 ZNF280D-201ENST00000267807 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
TRIM28Q13263 PTPN22-207ENST00000528414 3424 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
TRIM28Q13263 LUM-201ENST00000266718 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
TRIM28Q13263 RAP2C-AS1-202ENST00000441399 3473 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
TRIM28Q13263 CUL3-203ENST00000409096 2701 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
TRIM28Q13263 AL359693.1-201ENST00000614959 2407 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
TRIM28Q13263 Y_RNA.24-201ENST00000362508 103 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
TRIM28Q13263 Y_RNA.179-201ENST00000363844 90 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
TRIM28Q13263 Y_RNA.294-201ENST00000364916 102 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
TRIM28Q13263 SNORA48.2-201ENST00000390926 124 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
TRIM28Q13263 AL158823.1-201ENST00000418441 478 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
TRIM28Q13263 AC007969.2-201ENST00000441891 191 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
TRIM28Q13263 AC146507.2-201ENST00000460608 476 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
TRIM28Q13263 AC023141.12-201ENST00000512399 199 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
TRIM28Q13263 AP004607.1-201ENST00000524456 203 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
TRIM28Q13263 HSPE1P4-201ENST00000550617 308 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
TRIM28Q13263 AC007493.1-202ENST00000567899 517 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
TRIM28Q13263 U7.2-201ENST00000607576 63 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
TRIM28Q13263 AC012531.5-201ENST00000611375 151 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
TRIM28Q13263 AC024581.2-201ENST00000619986 252 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
TRIM28Q13263 AC068631.1-219ENST00000625826 668 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
TRIM28Q13263 hsa-mir-548d-1.1-201ENST00000636914 97 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
TRIM28Q13263 PSMD5-AS1-215ENST00000640622 205 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
TRIM28Q13263 SLC30A6-204ENST00000406369 4589 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
TRIM28Q13263 RAD17-202ENST00000305138 3164 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
TRIM28Q13263 DTWD1-201ENST00000251250 13776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
TRIM28Q13263 OR9K2-202ENST00000641329 3120 ntAPPRIS P1 BASIC4.19□□□□□ -1.74
TRIM28Q13263 UBE2W-203ENST00000517608 8426 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
TRIM28Q13263 PARPBP-201ENST00000327680 3014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
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