Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 Y_RNA.510-201ENST00000384511 114 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CBX3Q13185 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CBX3Q13185 MIR1283-1-201ENST00000408494 87 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CBX3Q13185 MIR1267-201ENST00000408723 78 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CBX3Q13185 AMD1P1-201ENST00000457220 922 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CBX3Q13185 RPL38P4-201ENST00000502376 214 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CBX3Q13185 AC092436.3-201ENST00000511788 257 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CBX3Q13185 RNU2-34P-201ENST00000516534 121 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CBX3Q13185 LINC02155-201ENST00000519215 407 ntTSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
CBX3Q13185 PTPN22-206ENST00000525799 2118 ntTSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
CBX3Q13185 AP005436.2-201ENST00000528458 252 ntTSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
CBX3Q13185 DEFB131C-201ENST00000528817 165 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CBX3Q13185 AC090592.1-203ENST00000533942 575 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
CBX3Q13185 AC036222.2-201ENST00000579033 333 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
CBX3Q13185 AC100830.2-201ENST00000581636 240 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CBX3Q13185 MIR4422-201ENST00000581938 83 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CBX3Q13185 CTHRC1P1-201ENST00000605383 469 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CBX3Q13185 AC104458.1-201ENST00000608243 463 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CBX3Q13185 AC013412.1-201ENST00000610687 192 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CBX3Q13185 MPP6-209ENST00000625307 126 ntTSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
CBX3Q13185 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
CBX3Q13185 E2F5-208ENST00000521429 1551 ntTSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
CBX3Q13185 GAGE12B-201ENST00000361446 117 ntAPPRIS P1 BASIC1.64□□□□□ -2.15
CBX3Q13185 RNU6-418P-201ENST00000384035 107 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CBX3Q13185 TRAJ6-201ENST00000390531 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.64□□□□□ -2.15
CBX3Q13185 RNU6-648P-201ENST00000410190 107 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CBX3Q13185 RNU2-7P-201ENST00000410794 178 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CBX3Q13185 AL162400.2-201ENST00000427547 157 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
CBX3Q13185 MRPS10P2-201ENST00000431226 381 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CBX3Q13185 FTH1P12-201ENST00000432137 551 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CBX3Q13185 AL359636.3-201ENST00000439471 301 ntTSL 2 BASIC1.64□□□□□ -2.15
CBX3Q13185 HSPE1P9-201ENST00000440046 311 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CBX3Q13185 AL365258.1-201ENST00000440885 247 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
CBX3Q13185 RPL26P26-201ENST00000480251 434 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CBX3Q13185 SNORA77B-201ENST00000578179 125 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CBX3Q13185 MIR4753-201ENST00000585119 83 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CBX3Q13185 AC016727.2-201ENST00000603988 621 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CBX3Q13185 Z99129.1-201ENST00000612510 255 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CBX3Q13185 LINC01515-217ENST00000620859 694 ntTSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
CBX3Q13185 AC124864.2-201ENST00000624736 186 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CBX3Q13185 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CBX3Q13185 AC121333.1-201ENST00000567488 2709 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CBX3Q13185 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
CBX3Q13185 RNU4-82P-201ENST00000362443 140 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CBX3Q13185 Y_RNA.67-201ENST00000362870 100 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CBX3Q13185 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CBX3Q13185 RNU6-968P-201ENST00000384076 107 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CBX3Q13185 MIR514A2-201ENST00000385131 88 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CBX3Q13185 MIR514A3-201ENST00000385132 88 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CBX3Q13185 MTCO3P40-201ENST00000392516 676 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CBX3Q13185 DPH3P2-201ENST00000422618 250 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CBX3Q13185 AC245047.4-201ENST00000433189 144 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CBX3Q13185 JTBP1-201ENST00000441314 247 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CBX3Q13185 AC004386.2-201ENST00000441858 148 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CBX3Q13185 AC022272.1-201ENST00000503478 777 ntTSL 2 BASIC1.63□□□□□ -2.15
CBX3Q13185 AC091435.1-201ENST00000505442 584 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CBX3Q13185 AC107208.1-201ENST00000508265 519 ntTSL 4 BASIC1.63□□□□□ -2.15
CBX3Q13185 AC096711.2-201ENST00000510592 454 ntTSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
CBX3Q13185 RNU6-1041P-201ENST00000516254 102 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CBX3Q13185 AC103853.2-201ENST00000519805 716 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
CBX3Q13185 AP003465.1-201ENST00000520575 382 ntTSL 2 BASIC1.63□□□□□ -2.15
CBX3Q13185 AC025043.1-201ENST00000558047 625 ntTSL 2 BASIC1.63□□□□□ -2.15
CBX3Q13185 AC025917.1-202ENST00000566344 635 ntTSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
CBX3Q13185 CPDP1-201ENST00000579660 283 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CBX3Q13185 AP005671.1-201ENST00000581798 463 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
CBX3Q13185 MIR5006-201ENST00000583027 110 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CBX3Q13185 MIR8076-201ENST00000611401 83 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CBX3Q13185 AC097520.1-201ENST00000624435 385 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CBX3Q13185 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
CBX3Q13185 Y_RNA.167-201ENST00000363735 109 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CBX3Q13185 SNORD116-1-201ENST00000384335 95 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CBX3Q13185 RNU2-66P-201ENST00000410650 161 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CBX3Q13185 RNU6-325P-201ENST00000411132 105 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CBX3Q13185 AL139156.1-201ENST00000412785 841 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CBX3Q13185 AC008440.2-201ENST00000413496 423 ntTSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
CBX3Q13185 AC060773.1-201ENST00000421698 310 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CBX3Q13185 AC096638.1-201ENST00000444678 216 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CBX3Q13185 LINC01774-201ENST00000453569 595 ntTSL 2 BASIC1.62□□□□□ -2.15
CBX3Q13185 MTCO1P29-201ENST00000496868 288 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CBX3Q13185 RNU6-948P-201ENST00000516374 107 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CBX3Q13185 RNA5SP481-201ENST00000516814 122 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CBX3Q13185 AC011092.2-201ENST00000533659 586 ntTSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
CBX3Q13185 LINC01495-202ENST00000534135 343 ntTSL 2 BASIC1.62□□□□□ -2.15
CBX3Q13185 MRPS36P4-201ENST00000534436 298 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CBX3Q13185 AC084364.2-201ENST00000546924 395 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CBX3Q13185 SNORA59B-202ENST00000578183 701 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CBX3Q13185 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CBX3Q13185 AP000907.4-201ENST00000604143 237 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CBX3Q13185 AC087241.4-201ENST00000612441 480 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CBX3Q13185 OR5AK4P-201ENST00000635912 903 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CBX3Q13185 MTND5P6-201ENST00000422338 1798 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CBX3Q13185 BX322639.1-202ENST00000423987 2213 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CBX3Q13185 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC1.61□□□□□ -2.15
CBX3Q13185 SNORA16.1-201ENST00000364597 132 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CBX3Q13185 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CBX3Q13185 RN7SKP32-201ENST00000410167 303 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CBX3Q13185 RNU2-20P-201ENST00000410425 191 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CBX3Q13185 RN7SKP192-201ENST00000411291 327 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CBX3Q13185 MTCO3P29-201ENST00000432119 779 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CBX3Q13185 AL603839.2-201ENST00000437060 546 ntTSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
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