| RPA4 | Q13156 | AL158209.2-201 | ENST00000619266 | 216 nt | BASIC | 1.76 | □□□□□ -2.13 | | |
| RPA4 | Q13156 | FGF7-202 | ENST00000560270 | 1688 nt | TSL 1 (best) BASIC | 1.75 | □□□□□ -2.13 | | |
| RPA4 | Q13156 | MT-ND1-201 | ENST00000361390 | 956 nt | APPRIS P1 BASIC | 1.75 | □□□□□ -2.13 | | |
| RPA4 | Q13156 | Y_RNA.132-201 | ENST00000363421 | 102 nt | BASIC | 1.75 | □□□□□ -2.13 | | |
| RPA4 | Q13156 | RNU4-20P-201 | ENST00000365601 | 151 nt | BASIC | 1.75 | □□□□□ -2.13 | | |
| RPA4 | Q13156 | RNU6-259P-201 | ENST00000383999 | 107 nt | BASIC | 1.75 | □□□□□ -2.13 | | |
| RPA4 | Q13156 | MIR1289-2-201 | ENST00000408360 | 111 nt | BASIC | 1.75 | □□□□□ -2.13 | | |
| RPA4 | Q13156 | USP9YP28-201 | ENST00000435142 | 589 nt | BASIC | 1.75 | □□□□□ -2.13 | | |
| RPA4 | Q13156 | AL365258.1-201 | ENST00000440885 | 247 nt | TSL 3 BASIC | 1.75 | □□□□□ -2.13 | | |
| RPA4 | Q13156 | RNU6-1208P-201 | ENST00000459588 | 107 nt | BASIC | 1.75 | □□□□□ -2.13 | | |
| RPA4 | Q13156 | TRAV1-1-201 | ENST00000542354 | 392 nt | APPRIS P1 BASIC | 1.75 | □□□□□ -2.13 | | |
| RPA4 | Q13156 | AC092807.2-201 | ENST00000609367 | 243 nt | BASIC | 1.75 | □□□□□ -2.13 | | |
| RPA4 | Q13156 | AL121757.2-201 | ENST00000611223 | 313 nt | BASIC | 1.75 | □□□□□ -2.13 | | |
| RPA4 | Q13156 | SAGE1-202 | ENST00000370709 | 2879 nt | APPRIS P2 TSL 5 BASIC | 1.75 | □□□□□ -2.13 | | |
| RPA4 | Q13156 | AL159152.1-201 | ENST00000635019 | 2587 nt | BASIC | 1.74 | □□□□□ -2.13 | | |
| RPA4 | Q13156 | SLC9C2-201 | ENST00000367714 | 4428 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 1.74 | □□□□□ -2.13 | | |
| RPA4 | Q13156 | RNU6-562P-201 | ENST00000362731 | 107 nt | BASIC | 1.74 | □□□□□ -2.13 | | |
| RPA4 | Q13156 | RNU6-112P-201 | ENST00000363599 | 104 nt | BASIC | 1.74 | □□□□□ -2.13 | | |
| RPA4 | Q13156 | RNU6-214P-201 | ENST00000384130 | 107 nt | BASIC | 1.74 | □□□□□ -2.13 | | |
| RPA4 | Q13156 | SNORD116-1-201 | ENST00000384335 | 95 nt | BASIC | 1.74 | □□□□□ -2.13 | | |
| RPA4 | Q13156 | MIR504-201 | ENST00000385065 | 83 nt | BASIC | 1.74 | □□□□□ -2.13 | | |
| RPA4 | Q13156 | EIF4E2P1-201 | ENST00000393781 | 255 nt | BASIC | 1.74 | □□□□□ -2.13 | | |
| RPA4 | Q13156 | AC035139.1-201 | ENST00000423256 | 273 nt | TSL 3 BASIC | 1.74 | □□□□□ -2.13 | | |
| RPA4 | Q13156 | LANCL1-AS1-203 | ENST00000433296 | 864 nt | TSL 2 BASIC | 1.74 | □□□□□ -2.13 | | |
| RPA4 | Q13156 | AC003989.2-201 | ENST00000440224 | 169 nt | BASIC | 1.74 | □□□□□ -2.13 | | |
| RPA4 | Q13156 | MTCO1P44-201 | ENST00000441935 | 243 nt | BASIC | 1.74 | □□□□□ -2.13 | | |
| RPA4 | Q13156 | snoU13.6-201 | ENST00000458785 | 104 nt | BASIC | 1.74 | □□□□□ -2.13 | | |
| RPA4 | Q13156 | AC087477.1-201 | ENST00000465747 | 340 nt | BASIC | 1.74 | □□□□□ -2.13 | | |
| RPA4 | Q13156 | AC116337.1-201 | ENST00000509680 | 687 nt | BASIC | 1.74 | □□□□□ -2.13 | | |
| RPA4 | Q13156 | FAM206BP-201 | ENST00000510179 | 541 nt | BASIC | 1.74 | □□□□□ -2.13 | | |
| RPA4 | Q13156 | BMPR1B-AS1-201 | ENST00000510795 | 511 nt | TSL 3 BASIC | 1.74 | □□□□□ -2.13 | | |
| RPA4 | Q13156 | RNU6-835P-201 | ENST00000516974 | 104 nt | BASIC | 1.74 | □□□□□ -2.13 | | |
| RPA4 | Q13156 | TMCO5B-203 | ENST00000529623 | 509 nt | TSL 4 BASIC | 1.74 | □□□□□ -2.13 | | |
| RPA4 | Q13156 | AL157687.1-201 | ENST00000554853 | 619 nt | BASIC | 1.74 | □□□□□ -2.13 | | |
| RPA4 | Q13156 | MIR4255-201 | ENST00000579351 | 72 nt | BASIC | 1.74 | □□□□□ -2.13 | | |
| RPA4 | Q13156 | MIR4285-201 | ENST00000581001 | 85 nt | BASIC | 1.74 | □□□□□ -2.13 | | |
| RPA4 | Q13156 | AC011494.1-201 | ENST00000596454 | 237 nt | BASIC | 1.74 | □□□□□ -2.13 | | |
| RPA4 | Q13156 | AC083806.3-201 | ENST00000614016 | 455 nt | BASIC | 1.74 | □□□□□ -2.13 | | |
| RPA4 | Q13156 | MIR8074-201 | ENST00000615081 | 81 nt | BASIC | 1.74 | □□□□□ -2.13 | | |
| RPA4 | Q13156 | AC068792.1-201 | ENST00000621354 | 417 nt | BASIC | 1.74 | □□□□□ -2.13 | | |
| RPA4 | Q13156 | AL359697.1-201 | ENST00000624879 | 587 nt | BASIC | 1.74 | □□□□□ -2.13 | | |
| RPA4 | Q13156 | FANCD2-213 | ENST00000625535 | 117 nt | TSL 5 BASIC | 1.74 | □□□□□ -2.13 | | |
| RPA4 | Q13156 | FER-210 | ENST00000628534 | 558 nt | TSL 5 BASIC | 1.74 | □□□□□ -2.13 | | |
| RPA4 | Q13156 | XRCC4-202 | ENST00000338635 | 1579 nt | APPRIS P4 TSL 2 BASIC | 1.73 | □□□□□ -2.13 | | |
| RPA4 | Q13156 | CALCRL-201 | ENST00000392370 | 5155 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 1.73 | □□□□□ -2.13 | | |
| RPA4 | Q13156 | MIR424-201 | ENST00000362227 | 98 nt | BASIC | 1.73 | □□□□□ -2.13 | | |
| RPA4 | Q13156 | RNU6-1317P-201 | ENST00000364582 | 104 nt | BASIC | 1.73 | □□□□□ -2.13 | | |
| RPA4 | Q13156 | SNORA18.2-201 | ENST00000383865 | 132 nt | BASIC | 1.73 | □□□□□ -2.13 | | |
| RPA4 | Q13156 | SNORA29-201 | ENST00000384183 | 140 nt | BASIC | 1.73 | □□□□□ -2.13 | | |
| RPA4 | Q13156 | TRAJ39-201 | ENST00000390498 | 63 nt | APPRIS P1 BASIC | 1.73 | □□□□□ -2.13 | | |
| RPA4 | Q13156 | TRAJ6-201 | ENST00000390531 | 62 nt | APPRIS P1 BASIC | 1.73 | □□□□□ -2.13 | | |
| RPA4 | Q13156 | MTCO3P40-201 | ENST00000392516 | 676 nt | BASIC | 1.73 | □□□□□ -2.13 | | |
| RPA4 | Q13156 | MIR300-201 | ENST00000401138 | 83 nt | BASIC | 1.73 | □□□□□ -2.13 | | |
| RPA4 | Q13156 | RNU6-648P-201 | ENST00000410190 | 107 nt | BASIC | 1.73 | □□□□□ -2.13 | | |
| RPA4 | Q13156 | RNU2-66P-201 | ENST00000410650 | 161 nt | BASIC | 1.73 | □□□□□ -2.13 | | |
| RPA4 | Q13156 | SNRPG-202 | ENST00000413456 | 398 nt | TSL 3 BASIC | 1.73 | □□□□□ -2.13 | | |
| RPA4 | Q13156 | MTCO1P21-201 | ENST00000416634 | 589 nt | BASIC | 1.73 | □□□□□ -2.13 | | |
| RPA4 | Q13156 | RPL21P111-201 | ENST00000418453 | 477 nt | BASIC | 1.73 | □□□□□ -2.13 | | |
| RPA4 | Q13156 | MRPS10P2-201 | ENST00000431226 | 381 nt | BASIC | 1.73 | □□□□□ -2.13 | | |
| RPA4 | Q13156 | AL357134.1-201 | ENST00000445848 | 426 nt | BASIC | 1.73 | □□□□□ -2.13 | | |
| RPA4 | Q13156 | SNRPG-205 | ENST00000449935 | 428 nt | TSL 1 (best) BASIC | 1.73 | □□□□□ -2.13 | | |
| RPA4 | Q13156 | ATP5J2P3-201 | ENST00000451550 | 258 nt | BASIC | 1.73 | □□□□□ -2.13 | | |
| RPA4 | Q13156 | MTND3P16-201 | ENST00000452205 | 344 nt | BASIC | 1.73 | □□□□□ -2.13 | | |
| RPA4 | Q13156 | AC010531.2-201 | ENST00000465012 | 153 nt | BASIC | 1.73 | □□□□□ -2.13 | | |
| RPA4 | Q13156 | RPS29P11-201 | ENST00000496507 | 171 nt | BASIC | 1.73 | □□□□□ -2.13 | | |
| RPA4 | Q13156 | AC025465.3-201 | ENST00000510570 | 311 nt | BASIC | 1.73 | □□□□□ -2.13 | | |
| RPA4 | Q13156 | AC011257.1-201 | ENST00000519048 | 281 nt | TSL 3 BASIC | 1.73 | □□□□□ -2.13 | | |
| RPA4 | Q13156 | AC026470.2-201 | ENST00000561492 | 181 nt | BASIC | 1.73 | □□□□□ -2.13 | | |
| RPA4 | Q13156 | MIR4419B-201 | ENST00000577260 | 68 nt | BASIC | 1.73 | □□□□□ -2.13 | | |
| RPA4 | Q13156 | MIR3618-201 | ENST00000580330 | 88 nt | BASIC | 1.73 | □□□□□ -2.13 | | |
| RPA4 | Q13156 | SCOC-AS1-203 | ENST00000609616 | 405 nt | TSL 3 BASIC | 1.73 | □□□□□ -2.13 | | |
| RPA4 | Q13156 | Z99129.1-201 | ENST00000612510 | 255 nt | BASIC | 1.73 | □□□□□ -2.13 | | |
| RPA4 | Q13156 | AC084768.2-201 | ENST00000622736 | 221 nt | BASIC | 1.73 | □□□□□ -2.13 | | |
| RPA4 | Q13156 | AC007370.2-201 | ENST00000506899 | 2694 nt | TSL 5 BASIC | 1.72 | □□□□□ -2.13 | | |
| RPA4 | Q13156 | RNU6-1286P-201 | ENST00000383871 | 107 nt | BASIC | 1.72 | □□□□□ -2.13 | | |
| RPA4 | Q13156 | MIR514A2-201 | ENST00000385131 | 88 nt | BASIC | 1.72 | □□□□□ -2.13 | | |
| RPA4 | Q13156 | MIR514A3-201 | ENST00000385132 | 88 nt | BASIC | 1.72 | □□□□□ -2.13 | | |
| RPA4 | Q13156 | DEFB110-202 | ENST00000393660 | 189 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 1.72 | □□□□□ -2.13 | | |
| RPA4 | Q13156 | RNA5SP494-201 | ENST00000410653 | 129 nt | BASIC | 1.72 | □□□□□ -2.13 | | |
| RPA4 | Q13156 | RPS26P42-201 | ENST00000413485 | 326 nt | BASIC | 1.72 | □□□□□ -2.13 | | |
| RPA4 | Q13156 | HMGB1P18-201 | ENST00000438801 | 619 nt | BASIC | 1.72 | □□□□□ -2.13 | | |
| RPA4 | Q13156 | AC004930.1-201 | ENST00000470677 | 254 nt | TSL 2 BASIC | 1.72 | □□□□□ -2.13 | | |
| RPA4 | Q13156 | AC096745.1-201 | ENST00000509945 | 370 nt | BASIC | 1.72 | □□□□□ -2.13 | | |
| RPA4 | Q13156 | IGHVII-53-1-201 | ENST00000519538 | 255 nt | BASIC | 1.72 | □□□□□ -2.13 | | |
| RPA4 | Q13156 | AC099520.1-206 | ENST00000523434 | 486 nt | TSL 3 BASIC | 1.72 | □□□□□ -2.13 | | |
| RPA4 | Q13156 | LINC01495-202 | ENST00000534135 | 343 nt | TSL 2 BASIC | 1.72 | □□□□□ -2.13 | | |
| RPA4 | Q13156 | AK6P1-201 | ENST00000540219 | 478 nt | BASIC | 1.72 | □□□□□ -2.13 | | |
| RPA4 | Q13156 | AC026765.1-201 | ENST00000547876 | 435 nt | TSL 3 BASIC | 1.72 | □□□□□ -2.13 | | |
| RPA4 | Q13156 | AC025043.1-201 | ENST00000558047 | 625 nt | TSL 2 BASIC | 1.72 | □□□□□ -2.13 | | |
| RPA4 | Q13156 | PTP4A1-204 | ENST00000578299 | 135 nt | TSL 2 BASIC | 1.72 | □□□□□ -2.13 | | |
| RPA4 | Q13156 | AP005136.1-201 | ENST00000579765 | 429 nt | BASIC | 1.72 | □□□□□ -2.13 | | |
| RPA4 | Q13156 | NBR2-204 | ENST00000587322 | 63 nt | BASIC | 1.72 | □□□□□ -2.13 | | |
| RPA4 | Q13156 | AC069114.2-201 | ENST00000604699 | 304 nt | BASIC | 1.72 | □□□□□ -2.13 | | |
| RPA4 | Q13156 | AC016925.2-201 | ENST00000605108 | 242 nt | BASIC | 1.72 | □□□□□ -2.13 | | |
| RPA4 | Q13156 | AL359880.1-201 | ENST00000621879 | 266 nt | BASIC | 1.72 | □□□□□ -2.13 | | |
| RPA4 | Q13156 | AC124864.2-201 | ENST00000624736 | 186 nt | BASIC | 1.72 | □□□□□ -2.13 | | |
| RPA4 | Q13156 | AC068733.3-201 | ENST00000632757 | 269 nt | TSL 3 BASIC | 1.72 | □□□□□ -2.13 | | |
| RPA4 | Q13156 | OR5AK4P-201 | ENST00000635912 | 903 nt | BASIC | 1.72 | □□□□□ -2.13 | | |
| RPA4 | Q13156 | PIK3C2G-203 | ENST00000535651 | 2497 nt | TSL 5 BASIC | 1.72 | □□□□□ -2.13 | | |
| RPA4 | Q13156 | RNU5B-2P-201 | ENST00000363036 | 113 nt | BASIC | 1.71 | □□□□□ -2.14 | | |