Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 AL158209.2-201ENST00000619266 216 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
RPA4Q13156 FGF7-202ENST00000560270 1688 ntTSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
RPA4Q13156 MT-ND1-201ENST00000361390 956 ntAPPRIS P1 BASIC1.75□□□□□ -2.13
RPA4Q13156 Y_RNA.132-201ENST00000363421 102 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
RPA4Q13156 RNU4-20P-201ENST00000365601 151 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
RPA4Q13156 RNU6-259P-201ENST00000383999 107 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
RPA4Q13156 MIR1289-2-201ENST00000408360 111 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
RPA4Q13156 USP9YP28-201ENST00000435142 589 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
RPA4Q13156 AL365258.1-201ENST00000440885 247 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
RPA4Q13156 RNU6-1208P-201ENST00000459588 107 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
RPA4Q13156 TRAV1-1-201ENST00000542354 392 ntAPPRIS P1 BASIC1.75□□□□□ -2.13
RPA4Q13156 AC092807.2-201ENST00000609367 243 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
RPA4Q13156 AL121757.2-201ENST00000611223 313 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
RPA4Q13156 SAGE1-202ENST00000370709 2879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
RPA4Q13156 AL159152.1-201ENST00000635019 2587 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
RPA4Q13156 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
RPA4Q13156 RNU6-562P-201ENST00000362731 107 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
RPA4Q13156 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
RPA4Q13156 RNU6-214P-201ENST00000384130 107 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
RPA4Q13156 SNORD116-1-201ENST00000384335 95 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
RPA4Q13156 MIR504-201ENST00000385065 83 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
RPA4Q13156 EIF4E2P1-201ENST00000393781 255 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
RPA4Q13156 AC035139.1-201ENST00000423256 273 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
RPA4Q13156 LANCL1-AS1-203ENST00000433296 864 ntTSL 2 BASIC1.74□□□□□ -2.13
RPA4Q13156 AC003989.2-201ENST00000440224 169 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
RPA4Q13156 MTCO1P44-201ENST00000441935 243 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
RPA4Q13156 snoU13.6-201ENST00000458785 104 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
RPA4Q13156 AC087477.1-201ENST00000465747 340 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
RPA4Q13156 AC116337.1-201ENST00000509680 687 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
RPA4Q13156 FAM206BP-201ENST00000510179 541 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
RPA4Q13156 BMPR1B-AS1-201ENST00000510795 511 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
RPA4Q13156 RNU6-835P-201ENST00000516974 104 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
RPA4Q13156 TMCO5B-203ENST00000529623 509 ntTSL 4 BASIC1.74□□□□□ -2.13
RPA4Q13156 AL157687.1-201ENST00000554853 619 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
RPA4Q13156 MIR4255-201ENST00000579351 72 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
RPA4Q13156 MIR4285-201ENST00000581001 85 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
RPA4Q13156 AC011494.1-201ENST00000596454 237 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
RPA4Q13156 AC083806.3-201ENST00000614016 455 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
RPA4Q13156 MIR8074-201ENST00000615081 81 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
RPA4Q13156 AC068792.1-201ENST00000621354 417 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
RPA4Q13156 AL359697.1-201ENST00000624879 587 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
RPA4Q13156 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
RPA4Q13156 FER-210ENST00000628534 558 ntTSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
RPA4Q13156 XRCC4-202ENST00000338635 1579 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC1.73□□□□□ -2.13
RPA4Q13156 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
RPA4Q13156 MIR424-201ENST00000362227 98 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
RPA4Q13156 RNU6-1317P-201ENST00000364582 104 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
RPA4Q13156 SNORA18.2-201ENST00000383865 132 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
RPA4Q13156 SNORA29-201ENST00000384183 140 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
RPA4Q13156 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.73□□□□□ -2.13
RPA4Q13156 TRAJ6-201ENST00000390531 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.73□□□□□ -2.13
RPA4Q13156 MTCO3P40-201ENST00000392516 676 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
RPA4Q13156 MIR300-201ENST00000401138 83 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
RPA4Q13156 RNU6-648P-201ENST00000410190 107 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
RPA4Q13156 RNU2-66P-201ENST00000410650 161 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
RPA4Q13156 SNRPG-202ENST00000413456 398 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
RPA4Q13156 MTCO1P21-201ENST00000416634 589 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
RPA4Q13156 RPL21P111-201ENST00000418453 477 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
RPA4Q13156 MRPS10P2-201ENST00000431226 381 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
RPA4Q13156 AL357134.1-201ENST00000445848 426 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
RPA4Q13156 SNRPG-205ENST00000449935 428 ntTSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
RPA4Q13156 ATP5J2P3-201ENST00000451550 258 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
RPA4Q13156 MTND3P16-201ENST00000452205 344 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
RPA4Q13156 AC010531.2-201ENST00000465012 153 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
RPA4Q13156 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
RPA4Q13156 AC025465.3-201ENST00000510570 311 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
RPA4Q13156 AC011257.1-201ENST00000519048 281 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
RPA4Q13156 AC026470.2-201ENST00000561492 181 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
RPA4Q13156 MIR4419B-201ENST00000577260 68 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
RPA4Q13156 MIR3618-201ENST00000580330 88 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
RPA4Q13156 SCOC-AS1-203ENST00000609616 405 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
RPA4Q13156 Z99129.1-201ENST00000612510 255 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
RPA4Q13156 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
RPA4Q13156 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
RPA4Q13156 RNU6-1286P-201ENST00000383871 107 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
RPA4Q13156 MIR514A2-201ENST00000385131 88 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
RPA4Q13156 MIR514A3-201ENST00000385132 88 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
RPA4Q13156 DEFB110-202ENST00000393660 189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
RPA4Q13156 RNA5SP494-201ENST00000410653 129 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
RPA4Q13156 RPS26P42-201ENST00000413485 326 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
RPA4Q13156 HMGB1P18-201ENST00000438801 619 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
RPA4Q13156 AC004930.1-201ENST00000470677 254 ntTSL 2 BASIC1.72□□□□□ -2.13
RPA4Q13156 AC096745.1-201ENST00000509945 370 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
RPA4Q13156 IGHVII-53-1-201ENST00000519538 255 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
RPA4Q13156 AC099520.1-206ENST00000523434 486 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
RPA4Q13156 LINC01495-202ENST00000534135 343 ntTSL 2 BASIC1.72□□□□□ -2.13
RPA4Q13156 AK6P1-201ENST00000540219 478 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
RPA4Q13156 AC026765.1-201ENST00000547876 435 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
RPA4Q13156 AC025043.1-201ENST00000558047 625 ntTSL 2 BASIC1.72□□□□□ -2.13
RPA4Q13156 PTP4A1-204ENST00000578299 135 ntTSL 2 BASIC1.72□□□□□ -2.13
RPA4Q13156 AP005136.1-201ENST00000579765 429 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
RPA4Q13156 NBR2-204ENST00000587322 63 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
RPA4Q13156 AC069114.2-201ENST00000604699 304 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
RPA4Q13156 AC016925.2-201ENST00000605108 242 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
RPA4Q13156 AL359880.1-201ENST00000621879 266 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
RPA4Q13156 AC124864.2-201ENST00000624736 186 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
RPA4Q13156 AC068733.3-201ENST00000632757 269 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
RPA4Q13156 OR5AK4P-201ENST00000635912 903 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
RPA4Q13156 PIK3C2G-203ENST00000535651 2497 ntTSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
RPA4Q13156 RNU5B-2P-201ENST00000363036 113 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
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