Protein–RNA interactions for Protein: Q13127

REST, RE1-silencing transcription factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,097 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RESTQ13127 RMST_6.1-201ENST00000611980 203 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
RESTQ13127 AC240442.1-201ENST00000616055 283 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
RESTQ13127 AC024581.2-201ENST00000619986 252 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
RESTQ13127 OFD1P6Y-202ENST00000451061 2724 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
RESTQ13127 MME-216ENST00000615825 5523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
RESTQ13127 CHD9-203ENST00000447540 11509 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
RESTQ13127 LINC02555-201ENST00000563933 1951 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
RESTQ13127 ANKAR-209ENST00000520309 4410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
RESTQ13127 LINC01684-201ENST00000415182 2176 ntTSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
RESTQ13127 NEDD4-208ENST00000508342 7235 ntTSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
RESTQ13127 DLEU2_6.3-201ENST00000340052 136 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
RESTQ13127 MIR335-201ENST00000362173 94 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
RESTQ13127 Y_RNA.20-201ENST00000362479 113 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
RESTQ13127 RNU5B-2P-201ENST00000363036 113 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
RESTQ13127 SNORA5B-201ENST00000363786 132 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
RESTQ13127 SNORA29-201ENST00000384183 140 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
RESTQ13127 MIR548I3-201ENST00000408378 149 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
RESTQ13127 MIR548I1-201ENST00000408810 149 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
RESTQ13127 EEF1A1P41-201ENST00000414667 207 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
RESTQ13127 AFDN-AS1-202ENST00000417244 182 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
RESTQ13127 AC099548.1-201ENST00000421443 426 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
RESTQ13127 AC013727.2-201ENST00000447761 545 ntTSL 4 BASIC3.14□□□□□ -1.91
RESTQ13127 HMGN2P10-201ENST00000448085 265 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
RESTQ13127 RPS26P21-201ENST00000475397 348 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
RESTQ13127 RN7SL499P-201ENST00000481141 276 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
RESTQ13127 SNORA31.1-201ENST00000515993 133 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
RESTQ13127 SNORA31.5-201ENST00000516190 133 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
RESTQ13127 Y_RNA.713-201ENST00000517013 96 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
RESTQ13127 RNU6-111P-201ENST00000517179 105 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
RESTQ13127 AC007536.1-201ENST00000533382 349 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
RESTQ13127 AC093023.1-201ENST00000547375 507 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
RESTQ13127 AC079600.2-201ENST00000550076 130 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
RESTQ13127 AL356157.2-201ENST00000605122 111 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
RESTQ13127 AC004832.5-201ENST00000608677 401 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
RESTQ13127 DLEU2_6.2-201ENST00000620994 136 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
RESTQ13127 DLD-214ENST00000639772 421 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
RESTQ13127 STAU2-201ENST00000355780 4061 ntTSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
RESTQ13127 FAM35CP-201ENST00000554755 2470 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
RESTQ13127 AL161431.1-201ENST00000618966 4205 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
RESTQ13127 HDX-206ENST00000506585 6158 ntTSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
RESTQ13127 Y_RNA.143-201ENST00000363520 106 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
RESTQ13127 Y_RNA.237-201ENST00000364439 102 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
RESTQ13127 Y_RNA.416-201ENST00000384014 113 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
RESTQ13127 RNU6-318P-201ENST00000384283 103 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
RESTQ13127 Y_RNA.539-201ENST00000384635 107 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
RESTQ13127 MIR32-201ENST00000384965 70 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
RESTQ13127 MIR887-201ENST00000401258 79 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
RESTQ13127 AL079342.1-201ENST00000401460 267 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
RESTQ13127 AL031121.1-201ENST00000406553 254 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
RESTQ13127 RNU6-1245P-201ENST00000411130 106 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
RESTQ13127 BPY2DP-201ENST00000422208 265 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
RESTQ13127 EIF1P2-201ENST00000428233 350 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
RESTQ13127 RAB6C-AS1-202ENST00000433431 123 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
RESTQ13127 AC004383.1-201ENST00000438135 289 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
RESTQ13127 AC020743.3-201ENST00000440351 360 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
RESTQ13127 AC016700.2-201ENST00000446011 156 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
RESTQ13127 UBE2DNL-203ENST00000474922 222 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
RESTQ13127 HMGB3P17-201ENST00000504195 649 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
RESTQ13127 AC116563.1-201ENST00000505454 396 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
RESTQ13127 SNORA31.23-201ENST00000517219 133 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
RESTQ13127 AC022868.1-201ENST00000517767 391 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
RESTQ13127 AL391261.3-201ENST00000557194 520 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
RESTQ13127 AC018904.1-201ENST00000560594 542 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
RESTQ13127 LINC02165-201ENST00000563061 443 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
RESTQ13127 MIR3609-201ENST00000582661 80 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
RESTQ13127 AC010900.2-201ENST00000604508 210 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
RESTQ13127 AC019159.1-201ENST00000605094 187 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
RESTQ13127 AL033523.1-201ENST00000605153 153 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
RESTQ13127 MIR376A1-201ENST00000616574 68 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
RESTQ13127 ZNF676-201ENST00000397121 2944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
RESTQ13127 AC110774.1-201ENST00000623567 2018 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
RESTQ13127 RFESD-202ENST00000380005 2587 ntTSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
RESTQ13127 ZMYM1-203ENST00000373330 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
RESTQ13127 AL391987.6-201ENST00000305671 199 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
RESTQ13127 RNU1-112P-201ENST00000364401 164 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
RESTQ13127 RNU6-1280P-201ENST00000365211 107 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
RESTQ13127 AP003170.3-201ENST00000399123 158 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
RESTQ13127 AL590135.1-201ENST00000422215 156 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
RESTQ13127 AC096920.1-201ENST00000423991 241 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
RESTQ13127 AC087477.1-201ENST00000465747 340 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
RESTQ13127 AC095059.1-201ENST00000502570 349 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
RESTQ13127 HMGB1P35-201ENST00000503360 598 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
RESTQ13127 AC020703.1-201ENST00000505051 521 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
RESTQ13127 RNU6-581P-201ENST00000516214 105 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
RESTQ13127 SNORD59.2-201ENST00000516873 68 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
RESTQ13127 NACAP3-201ENST00000552100 481 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
RESTQ13127 AC021739.1-201ENST00000559631 174 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
RESTQ13127 AC007347.1-201ENST00000563879 281 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
RESTQ13127 AC023824.2-201ENST00000566185 400 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
RESTQ13127 MIR4659A-201ENST00000580269 81 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
RESTQ13127 AC135178.3-204ENST00000585181 451 ntTSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
RESTQ13127 Y_RNA.772-201ENST00000606692 102 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
RESTQ13127 DLX6-AS1_2.1-201ENST00000613701 207 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
RESTQ13127 LINC01002-202ENST00000631412 459 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
RESTQ13127 MIER3-203ENST00000381213 5198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
RESTQ13127 CEP57L1-216ENST00000521522 2259 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
RESTQ13127 ZCCHC10-201ENST00000324170 2178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
RESTQ13127 Y_RNA.515-201ENST00000384535 112 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
RESTQ13127 MIR544A-201ENST00000384855 91 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
RESTQ13127 MIR153-2-201ENST00000385225 87 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103 ms