Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
HSPB3Q12988 RNU6-1159P-201ENST00000362933 107 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
HSPB3Q12988 RNU6-842P-201ENST00000384269 107 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
HSPB3Q12988 RNU6-174P-201ENST00000410406 106 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
HSPB3Q12988 AC074085.1-201ENST00000413598 418 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
HSPB3Q12988 PDCL2P1-201ENST00000419302 352 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
HSPB3Q12988 AL355314.2-201ENST00000427182 436 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
HSPB3Q12988 AC027124.2-201ENST00000428249 105 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
HSPB3Q12988 AL132875.2-201ENST00000436418 325 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
HSPB3Q12988 AC107399.1-201ENST00000451226 265 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
HSPB3Q12988 AC055731.1-201ENST00000474387 401 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
HSPB3Q12988 AC103851.1-201ENST00000506833 274 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
HSPB3Q12988 AC022690.2-201ENST00000525673 589 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
HSPB3Q12988 MIR4529-201ENST00000578110 78 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
HSPB3Q12988 MIR4273-201ENST00000582824 84 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
HSPB3Q12988 AC010928.2-201ENST00000588017 287 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
HSPB3Q12988 AL359314.1-201ENST00000616913 261 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
HSPB3Q12988 AC009831.4-201ENST00000620744 325 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
HSPB3Q12988 MIR6132-201ENST00000622083 109 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
HSPB3Q12988 SCARNA15.3-201ENST00000626315 122 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
HSPB3Q12988 SCARNA4.1-201ENST00000628597 123 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
HSPB3Q12988 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
HSPB3Q12988 RNU1-76P-201ENST00000362903 159 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
HSPB3Q12988 Y_RNA.99-201ENST00000363138 105 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
HSPB3Q12988 Y_RNA.339-201ENST00000365325 102 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
HSPB3Q12988 Y_RNA.533-201ENST00000384596 114 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
HSPB3Q12988 BX510359.4-201ENST00000423750 193 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
HSPB3Q12988 SMG7-AS1-202ENST00000432837 466 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
HSPB3Q12988 HMGB1P18-201ENST00000438801 619 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
HSPB3Q12988 AC245102.2-201ENST00000448956 180 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
HSPB3Q12988 SNORD5.1-201ENST00000458800 75 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
HSPB3Q12988 RNU7-14P-201ENST00000459331 62 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
HSPB3Q12988 TOMM22P6-201ENST00000465035 409 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
HSPB3Q12988 AC104435.1-201ENST00000483483 166 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
HSPB3Q12988 AC096711.1-201ENST00000510967 347 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
HSPB3Q12988 RNU6-1016P-201ENST00000516689 94 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
HSPB3Q12988 RNU2-19P-201ENST00000517288 84 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
HSPB3Q12988 AC108449.1-202ENST00000517632 478 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
HSPB3Q12988 ACTG1P17-203ENST00000561222 537 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
HSPB3Q12988 MIR4672-201ENST00000583126 81 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
HSPB3Q12988 AL158827.2-201ENST00000602494 330 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
HSPB3Q12988 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
HSPB3Q12988 AC018462.2-201ENST00000605375 395 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
HSPB3Q12988 AL355512.1-202ENST00000607952 209 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
HSPB3Q12988 uc_338.5-201ENST00000611839 155 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
HSPB3Q12988 AL691447.3-201ENST00000635020 330 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
HSPB3Q12988 CHORDC1-205ENST00000529726 4805 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
HSPB3Q12988 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
HSPB3Q12988 Y_RNA.166-201ENST00000363730 102 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
HSPB3Q12988 RNU6-1164P-201ENST00000364428 107 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
HSPB3Q12988 RNU4-9P-201ENST00000364951 139 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
HSPB3Q12988 RNU6-596P-201ENST00000365395 98 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
HSPB3Q12988 DEFB134-201ENST00000382205 314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
HSPB3Q12988 U8.10-201ENST00000384260 133 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
HSPB3Q12988 SNORA80E-201ENST00000384744 137 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
HSPB3Q12988 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
HSPB3Q12988 AC138393.2-201ENST00000414742 246 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
HSPB3Q12988 LINC01344-201ENST00000420760 261 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
HSPB3Q12988 AL035666.1-201ENST00000446195 348 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
HSPB3Q12988 RPS23P5-201ENST00000495419 428 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
HSPB3Q12988 AC026782.1-201ENST00000512952 449 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
HSPB3Q12988 SNORA20.3-201ENST00000516880 132 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
HSPB3Q12988 AC087664.2-201ENST00000522898 551 ntTSL 4 BASIC2.05□□□□□ -2.08
HSPB3Q12988 ANP32BP3-201ENST00000559213 706 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
HSPB3Q12988 PTP4A1-204ENST00000578299 135 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
HSPB3Q12988 MIR5696-201ENST00000578474 85 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
HSPB3Q12988 AC007229.1-201ENST00000590455 412 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
HSPB3Q12988 AC011494.1-201ENST00000596454 237 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
HSPB3Q12988 ZNF667-AS1-209ENST00000601875 495 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
HSPB3Q12988 AC022306.2-201ENST00000617563 647 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
HSPB3Q12988 AC005562.2-201ENST00000618264 111 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
HSPB3Q12988 DEUP1-202ENST00000525646 1920 ntTSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
HSPB3Q12988 ZCCHC10-202ENST00000355372 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
HSPB3Q12988 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
HSPB3Q12988 Y_RNA.48-201ENST00000362710 103 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
HSPB3Q12988 Y_RNA.88-201ENST00000363029 99 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
HSPB3Q12988 SNORD81.2-201ENST00000365153 76 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
HSPB3Q12988 Y_RNA.332-201ENST00000365271 113 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
HSPB3Q12988 RNU6-601P-201ENST00000384540 107 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
HSPB3Q12988 MIR32-201ENST00000384965 70 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
HSPB3Q12988 SNORA12.2-201ENST00000391040 156 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
HSPB3Q12988 RNU4-53P-201ENST00000410828 140 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
HSPB3Q12988 RN7SKP284-201ENST00000411002 343 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
HSPB3Q12988 RPL37P10-201ENST00000412884 288 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
HSPB3Q12988 PLCL2-AS1-201ENST00000414844 311 ntTSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
HSPB3Q12988 AC243428.1-201ENST00000421099 264 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
HSPB3Q12988 FO680682.1-201ENST00000421261 345 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
HSPB3Q12988 AC098614.3-201ENST00000438957 440 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
HSPB3Q12988 AL445524.1-202ENST00000440665 416 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
HSPB3Q12988 SNRPEP8-201ENST00000442866 260 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
HSPB3Q12988 MTND4P17-201ENST00000470444 350 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
HSPB3Q12988 AC116353.2-201ENST00000505332 712 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
HSPB3Q12988 AP001363.1-201ENST00000544108 264 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
HSPB3Q12988 AC009107.1-201ENST00000561923 330 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
HSPB3Q12988 RPL17P51-201ENST00000605218 238 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
HSPB3Q12988 MIR6895-201ENST00000613497 78 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
HSPB3Q12988 TEX41-243ENST00000614173 190 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
HSPB3Q12988 DSCR8-208ENST00000614538 403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
HSPB3Q12988 AC137590.2-201ENST00000619709 240 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
HSPB3Q12988 IGHVIII-44-202ENST00000636235 289 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 157.9 ms