Protein–RNA interactions for Protein: Q10570

CPSF1, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPSF1Q10570 SNRPGP20-201ENST00000604477 205 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
CPSF1Q10570 AL136317.1-201ENST00000612653 226 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
CPSF1Q10570 TTK-211ENST00000627129 240 ntTSL 5 BASIC-0.2□□□□□ -2.44
CPSF1Q10570 MGST1-207ENST00000535309 1331 ntTSL 1 (best) BASIC-0.2□□□□□ -2.44
CPSF1Q10570 RNA5SP214-201ENST00000363378 118 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
CPSF1Q10570 SNORA32.1-201ENST00000364514 115 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
CPSF1Q10570 AL445259.1-203ENST00000427828 251 ntTSL 3 BASIC-0.21□□□□□ -2.44
CPSF1Q10570 AC006369.2-201ENST00000431712 384 ntTSL 3 BASIC-0.21□□□□□ -2.44
CPSF1Q10570 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
CPSF1Q10570 KRTAP13-6P-201ENST00000508999 371 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
CPSF1Q10570 NAF1-205ENST00000509434 385 ntTSL 3 BASIC-0.21□□□□□ -2.44
CPSF1Q10570 RNU1-86P-201ENST00000516108 154 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
CPSF1Q10570 RNU1-107P-201ENST00000516617 154 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
CPSF1Q10570 SNORA43.2-201ENST00000516652 128 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
CPSF1Q10570 AC115990.1-201ENST00000526957 301 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
CPSF1Q10570 SLC2A13P1-201ENST00000531560 322 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
CPSF1Q10570 AC093012.1-201ENST00000552999 446 ntTSL 3 BASIC-0.21□□□□□ -2.44
CPSF1Q10570 AC109446.1-201ENST00000566172 220 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
CPSF1Q10570 AP006219.1-201ENST00000580258 472 ntTSL 3 BASIC-0.21□□□□□ -2.44
CPSF1Q10570 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
CPSF1Q10570 UBE2E2-206ENST00000613545 282 ntTSL 5 BASIC-0.21□□□□□ -2.44
CPSF1Q10570 AC136475.10-201ENST00000620253 385 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
CPSF1Q10570 C9orf84-203ENST00000374287 4721 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC-0.21□□□□□ -2.44
CPSF1Q10570 Y_RNA.132-201ENST00000363421 102 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
CPSF1Q10570 RNA5SP368-201ENST00000364298 116 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
CPSF1Q10570 RNU4-76P-201ENST00000364509 141 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
CPSF1Q10570 RNU6-744P-201ENST00000365557 107 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
CPSF1Q10570 RNU4-48P-201ENST00000365559 182 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
CPSF1Q10570 RNU6-481P-201ENST00000384194 107 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
CPSF1Q10570 RNU6-1316P-201ENST00000384242 108 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
CPSF1Q10570 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
CPSF1Q10570 RNU6-177P-201ENST00000411257 104 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
CPSF1Q10570 AL663023.1-201ENST00000412932 853 ntTSL 3 BASIC-0.21□□□□□ -2.44
CPSF1Q10570 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC-0.21□□□□□ -2.44
CPSF1Q10570 AC016925.1-201ENST00000458303 298 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
CPSF1Q10570 AC093292.1-201ENST00000505050 449 ntTSL 3 BASIC-0.21□□□□□ -2.44
CPSF1Q10570 MTND3P5-201ENST00000512798 333 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
CPSF1Q10570 MTND2P7-201ENST00000521337 640 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
CPSF1Q10570 AL353778.1-201ENST00000603149 408 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
CPSF1Q10570 AC100814.1-201ENST00000606963 623 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
CPSF1Q10570 AC006001.4-201ENST00000622243 395 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
CPSF1Q10570 AL078595.3-201ENST00000623815 1166 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
CPSF1Q10570 AC112204.3-201ENST00000623822 332 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
CPSF1Q10570 SCARNA4-202ENST00000625402 129 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
CPSF1Q10570 AL157786.1-207ENST00000627771 695 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
CPSF1Q10570 MTND5P42-201ENST00000637720 498 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
CPSF1Q10570 MIR19A-201ENST00000384878 82 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.45
CPSF1Q10570 AP000432.1-201ENST00000416641 516 ntTSL 3 BASIC-0.22□□□□□ -2.45
CPSF1Q10570 AC010154.1-201ENST00000425857 269 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.45
CPSF1Q10570 AC104332.1-201ENST00000440471 797 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.45
CPSF1Q10570 RNU7-14P-201ENST00000459331 62 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.45
CPSF1Q10570 AC022447.4-201ENST00000504053 364 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.45
CPSF1Q10570 GTF2H2C-212ENST00000512736 832 ntTSL 1 (best) BASIC-0.22□□□□□ -2.45
CPSF1Q10570 RNU6-914P-201ENST00000516749 109 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.45
CPSF1Q10570 RNU6-856P-201ENST00000516959 98 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.45
CPSF1Q10570 AC027419.1-201ENST00000522976 328 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.45
CPSF1Q10570 AC090049.2-201ENST00000550377 109 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.45
CPSF1Q10570 AC009269.3-201ENST00000558429 472 ntTSL 5 BASIC-0.22□□□□□ -2.45
CPSF1Q10570 AC022523.2-201ENST00000561045 150 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.45
CPSF1Q10570 AC127540.1-201ENST00000580311 689 ntTSL 5 BASIC-0.22□□□□□ -2.45
CPSF1Q10570 AC005357.2-201ENST00000586473 583 ntTSL 2 BASIC-0.22□□□□□ -2.45
CPSF1Q10570 RNU6-278P-201ENST00000390945 109 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
CPSF1Q10570 FCF1P10-201ENST00000407590 479 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
CPSF1Q10570 RNU2-42P-201ENST00000410697 113 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
CPSF1Q10570 AL137856.1-202ENST00000418238 422 ntTSL 3 BASIC-0.23□□□□□ -2.45
CPSF1Q10570 LINC00397-201ENST00000422074 344 ntTSL 3 BASIC-0.23□□□□□ -2.45
CPSF1Q10570 AL596220.1-202ENST00000429768 314 ntTSL 3 BASIC-0.23□□□□□ -2.45
CPSF1Q10570 EEF1E1P1-201ENST00000446998 430 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
CPSF1Q10570 AL357793.2-201ENST00000447056 850 ntTSL 3 BASIC-0.23□□□□□ -2.45
CPSF1Q10570 AF129075.1-201ENST00000457162 794 ntTSL 3 BASIC-0.23□□□□□ -2.45
CPSF1Q10570 AC104692.1-201ENST00000472406 90 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
CPSF1Q10570 AC108729.2-201ENST00000476543 840 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
CPSF1Q10570 AC093534.1-201ENST00000504977 132 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
CPSF1Q10570 EPGN-208ENST00000509145 222 ntTSL 1 (best) BASIC-0.23□□□□□ -2.45
CPSF1Q10570 AC069113.3-201ENST00000521019 150 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
CPSF1Q10570 MIR4290-201ENST00000583807 95 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
CPSF1Q10570 MIR412-201ENST00000362142 91 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
CPSF1Q10570 SNORA75B-201ENST00000384053 137 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
CPSF1Q10570 U6.112-201ENST00000384129 70 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
CPSF1Q10570 SNORD65.1-201ENST00000390889 71 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
CPSF1Q10570 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
CPSF1Q10570 AL162725.1-201ENST00000435405 301 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
CPSF1Q10570 NDUFB1P2-201ENST00000449477 176 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
CPSF1Q10570 snoU13.19-201ENST00000459148 104 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
CPSF1Q10570 AC026414.1-201ENST00000504046 698 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
CPSF1Q10570 HMGB1P29-201ENST00000505659 499 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
CPSF1Q10570 SUMO2P5-201ENST00000506790 245 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
CPSF1Q10570 AC093206.1-201ENST00000515364 497 ntTSL 3 BASIC-0.24□□□□□ -2.45
CPSF1Q10570 LINC01337-201ENST00000515871 440 ntTSL 3 BASIC-0.24□□□□□ -2.45
CPSF1Q10570 NARSP2-202ENST00000522022 349 ntTSL 3 BASIC-0.24□□□□□ -2.45
CPSF1Q10570 MIR4789-201ENST00000577469 82 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
CPSF1Q10570 AC131055.1-201ENST00000584626 316 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
CPSF1Q10570 AL034555.1-201ENST00000604816 211 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
CPSF1Q10570 RPL21P136-201ENST00000605378 396 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
CPSF1Q10570 AC022893.3-201ENST00000607665 437 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
CPSF1Q10570 AC231657.1-201ENST00000624313 397 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
CPSF1Q10570 ZNF736P9Y-201ENST00000439586 1345 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
CPSF1Q10570 SNORA42.1-201ENST00000363515 137 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
CPSF1Q10570 RNY4P3-201ENST00000365254 95 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
CPSF1Q10570 RNU6-877P-201ENST00000383868 107 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.4 ms