Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 RNU6-611P-201ENST00000384276 104 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
RBBP4Q09028 OPRPN-201ENST00000399575 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
RBBP4Q09028 SNRPG-202ENST00000413456 398 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
RBBP4Q09028 Z98742.3-201ENST00000418637 326 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
RBBP4Q09028 LANCL1-AS1-203ENST00000433296 864 ntTSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.11
RBBP4Q09028 DAP3P1-201ENST00000441522 278 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
RBBP4Q09028 AC073325.1-201ENST00000443714 542 ntTSL 4 BASIC1.9□□□□□ -2.11
RBBP4Q09028 SNRPG-205ENST00000449935 428 ntTSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
RBBP4Q09028 AF186996.7-201ENST00000492781 209 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
RBBP4Q09028 AC063944.1-201ENST00000496943 295 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
RBBP4Q09028 MTND5P5-201ENST00000503764 376 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
RBBP4Q09028 AC100801.1-202ENST00000518266 371 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
RBBP4Q09028 MIR4790-201ENST00000577799 79 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
RBBP4Q09028 AC009994.1-201ENST00000606889 253 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
RBBP4Q09028 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
RBBP4Q09028 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.11
RBBP4Q09028 AGR3-201ENST00000310398 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
RBBP4Q09028 RNU6-968P-201ENST00000384076 107 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
RBBP4Q09028 RNU6-767P-201ENST00000384132 107 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
RBBP4Q09028 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC1.89□□□□□ -2.11
RBBP4Q09028 SNORA3.2-201ENST00000408221 125 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
RBBP4Q09028 MIR548K-201ENST00000408406 116 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
RBBP4Q09028 RNU2-40P-201ENST00000410833 196 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
RBBP4Q09028 GHRL-208ENST00000439975 326 ntTSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
RBBP4Q09028 AL353572.1-201ENST00000442490 417 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
RBBP4Q09028 AL035634.1-201ENST00000446768 372 ntTSL 2 BASIC1.89□□□□□ -2.11
RBBP4Q09028 RPL31P58-201ENST00000469001 379 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
RBBP4Q09028 TRBV12-1-201ENST00000479785 344 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
RBBP4Q09028 AC008549.1-201ENST00000512900 643 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
RBBP4Q09028 RNU6-567P-201ENST00000516746 107 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
RBBP4Q09028 HSPE1P18-201ENST00000517602 280 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
RBBP4Q09028 AC087664.2-201ENST00000522898 551 ntTSL 4 BASIC1.89□□□□□ -2.11
RBBP4Q09028 IGKV3-31-201ENST00000523109 329 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
RBBP4Q09028 AC022469.2-201ENST00000554759 396 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
RBBP4Q09028 AC091544.4-201ENST00000555268 342 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
RBBP4Q09028 AC012435.2-201ENST00000562869 361 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
RBBP4Q09028 AC109446.1-201ENST00000566172 220 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
RBBP4Q09028 MIR3126-201ENST00000577443 74 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
RBBP4Q09028 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
RBBP4Q09028 POLR3GP2-201ENST00000588366 668 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
RBBP4Q09028 UBE2E2-206ENST00000613545 282 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
RBBP4Q09028 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC1.89□□□□□ -2.11
RBBP4Q09028 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
RBBP4Q09028 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
RBBP4Q09028 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
RBBP4Q09028 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC1.88□□□□□ -2.11
RBBP4Q09028 RNU6-845P-201ENST00000362578 103 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RBBP4Q09028 RNU6-1059P-201ENST00000363752 98 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RBBP4Q09028 U3.9-201ENST00000363823 204 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RBBP4Q09028 Y_RNA.184-201ENST00000363884 108 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RBBP4Q09028 RNU6-743P-201ENST00000364151 106 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RBBP4Q09028 RNA5SP126-201ENST00000365092 109 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RBBP4Q09028 Y_RNA.339-201ENST00000365325 102 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RBBP4Q09028 MIR208B-201ENST00000401172 77 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RBBP4Q09028 MIR1262-201ENST00000408276 93 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RBBP4Q09028 RNU6ATAC37P-201ENST00000408328 131 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RBBP4Q09028 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RBBP4Q09028 AC138393.2-201ENST00000414742 246 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RBBP4Q09028 PDCL2P1-201ENST00000419302 352 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RBBP4Q09028 AL355314.2-201ENST00000427182 436 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
RBBP4Q09028 PRELID3BP1-201ENST00000457142 540 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RBBP4Q09028 PMCHL2-203ENST00000457791 237 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RBBP4Q09028 RNA5SP233-201ENST00000459153 113 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RBBP4Q09028 AC069528.1-201ENST00000490344 705 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
RBBP4Q09028 AC116563.1-201ENST00000505454 396 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
RBBP4Q09028 AC046134.1-201ENST00000514454 666 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RBBP4Q09028 RNU7-30P-201ENST00000516835 62 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RBBP4Q09028 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RBBP4Q09028 SNORA31.25-201ENST00000517242 134 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RBBP4Q09028 RNU2-19P-201ENST00000517288 84 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RBBP4Q09028 AP005436.2-201ENST00000528458 252 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
RBBP4Q09028 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
RBBP4Q09028 EIF4A1P12-201ENST00000551910 141 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RBBP4Q09028 PWRN1-203ENST00000564898 389 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
RBBP4Q09028 PWRN1-209ENST00000568019 359 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
RBBP4Q09028 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RBBP4Q09028 AP006219.1-201ENST00000580258 472 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
RBBP4Q09028 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RBBP4Q09028 AL022345.1-201ENST00000607292 135 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RBBP4Q09028 AC009318.2-201ENST00000610917 651 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RBBP4Q09028 MIR6128-201ENST00000615528 109 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RBBP4Q09028 AC099654.14-201ENST00000638599 341 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RBBP4Q09028 CYLC1-201ENST00000329312 2106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
RBBP4Q09028 ZBED5-202ENST00000432999 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
RBBP4Q09028 MIPOL1-203ENST00000537471 5954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
RBBP4Q09028 FSD1L-201ENST00000374707 7062 ntTSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
RBBP4Q09028 U8.2-201ENST00000363156 134 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
RBBP4Q09028 RNU6-26P-201ENST00000383985 107 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
RBBP4Q09028 MIR676-201ENST00000390702 67 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
RBBP4Q09028 SUMO2P12-201ENST00000405924 140 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
RBBP4Q09028 MIR548F5-201ENST00000408421 86 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
RBBP4Q09028 RNA5SP494-201ENST00000410653 129 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
RBBP4Q09028 RN7SKP192-201ENST00000411291 327 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
RBBP4Q09028 RPL21P111-201ENST00000418453 477 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
RBBP4Q09028 DPH3P2-201ENST00000422618 250 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
RBBP4Q09028 AC027124.2-201ENST00000428249 105 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
RBBP4Q09028 USP9YP30-201ENST00000430729 455 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
RBBP4Q09028 AL513124.1-201ENST00000450410 614 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
RBBP4Q09028 AC025918.1-201ENST00000452467 383 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
RBBP4Q09028 KPNA2P1-201ENST00000458289 1591 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.1 ms