Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

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Length 3,210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 OR6C70-201ENST00000327335 939 ntAPPRIS P1 BASIC-1.27□□□□□ -2.61
CENPFP49454 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
CENPFP49454 MTCO1P5-201ENST00000433573 344 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
CENPFP49454 AC004223.4-201ENST00000612426 332 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
CENPFP49454 AC098679.4-201ENST00000624241 654 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
CENPFP49454 MIR1250-201ENST00000408098 113 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
CENPFP49454 AL160287.1-201ENST00000455612 432 ntTSL 3 BASIC-1.27□□□□□ -2.61
CENPFP49454 AC006199.1-201ENST00000548728 219 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
CENPFP49454 SCARNA4-202ENST00000625402 129 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
CENPFP49454 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
CENPFP49454 Y_RNA.49-201ENST00000362714 112 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
CENPFP49454 RNA5SP259-201ENST00000365541 109 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
CENPFP49454 RNU6-705P-201ENST00000410601 104 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
CENPFP49454 AC079349.1-201ENST00000509096 589 ntTSL 2 BASIC-1.28□□□□□ -2.61
CENPFP49454 AC025871.1-201ENST00000523935 443 ntTSL 2 BASIC-1.28□□□□□ -2.61
CENPFP49454 SNRPGP16-201ENST00000533275 226 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
CENPFP49454 AC100830.2-201ENST00000581636 240 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
CENPFP49454 AC092953.2-201ENST00000608000 699 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
CENPFP49454 Y_RNA.430-201ENST00000384081 110 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
CENPFP49454 MTCYBP32-201ENST00000427945 1084 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
CENPFP49454 STAG3L5P-204ENST00000443759 179 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
CENPFP49454 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
CENPFP49454 EPGN-208ENST00000509145 222 ntTSL 1 (best) BASIC-1.28□□□□□ -2.61
CENPFP49454 Y_RNA.715-201ENST00000517082 110 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
CENPFP49454 AC055764.2-201ENST00000610089 670 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
CENPFP49454 PLD1-217ENST00000627725 174 ntTSL 5 BASIC-1.28□□□□□ -2.61
CENPFP49454 AL139098.1-201ENST00000407291 389 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.62
CENPFP49454 MTCO3P9-201ENST00000506989 781 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.62
CENPFP49454 RNU5A-4P-201ENST00000516588 111 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.62
CENPFP49454 AL352984.1-201ENST00000556949 276 ntTSL 3 BASIC-1.28□□□□□ -2.62
CENPFP49454 AP005229.2-201ENST00000609980 697 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.62
CENPFP49454 AL391597.2-201ENST00000635698 479 ntTSL 5 BASIC-1.28□□□□□ -2.62
CENPFP49454 AL158050.1-201ENST00000416077 457 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
CENPFP49454 AL139397.1-201ENST00000430456 644 ntTSL 2 BASIC-1.29□□□□□ -2.62
CENPFP49454 RPL30P1-201ENST00000488676 339 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
CENPFP49454 LINC02066-201ENST00000492731 580 ntTSL 4 BASIC-1.29□□□□□ -2.62
CENPFP49454 AL163051.2-201ENST00000618976 735 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
CENPFP49454 ZNF204P-201ENST00000416749 2397 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
CENPFP49454 SMIM11P1-201ENST00000369586 178 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
CENPFP49454 AC010105.1-201ENST00000437290 385 ntTSL 5 BASIC-1.29□□□□□ -2.62
CENPFP49454 MCHR2-AS1-203ENST00000451220 429 ntTSL 3 BASIC-1.29□□□□□ -2.62
CENPFP49454 AC005042.3-201ENST00000453230 174 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
CENPFP49454 RNA5SP169-201ENST00000517268 117 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
CENPFP49454 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
CENPFP49454 RAC1P6-201ENST00000423911 575 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
CENPFP49454 AC002486.1-201ENST00000435098 391 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
CENPFP49454 AC092691.3-201ENST00000482766 510 ntTSL 3 BASIC-1.3□□□□□ -2.62
CENPFP49454 SOX2-OT-216ENST00000497122 578 ntTSL 4 BASIC-1.3□□□□□ -2.62
CENPFP49454 AC008883.1-201ENST00000506562 193 ntTSL 3 BASIC-1.3□□□□□ -2.62
CENPFP49454 MTND5P13-201ENST00000513046 1079 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
CENPFP49454 AC127540.1-201ENST00000580311 689 ntTSL 5 BASIC-1.3□□□□□ -2.62
CENPFP49454 AC131159.1-201ENST00000621854 213 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
CENPFP49454 RNU4-28P-201ENST00000364739 141 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
CENPFP49454 RNU6-650P-201ENST00000365658 111 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
CENPFP49454 AC015983.2-201ENST00000446053 472 ntTSL 3 BASIC-1.3□□□□□ -2.62
CENPFP49454 AC022695.3-201ENST00000523385 478 ntTSL 3 BASIC-1.3□□□□□ -2.62
CENPFP49454 MIR6514-201ENST00000622549 70 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
CENPFP49454 RNU6-1157P-201ENST00000384456 106 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
CENPFP49454 AC091705.1-201ENST00000412197 209 ntTSL 5 BASIC-1.3□□□□□ -2.62
CENPFP49454 AL133217.1-201ENST00000450980 425 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
CENPFP49454 ZNF706-202ENST00000517844 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC-1.3□□□□□ -2.62
CENPFP49454 AC011773.2-201ENST00000551479 285 ntTSL 5 BASIC-1.3□□□□□ -2.62
CENPFP49454 RNU6-652P-201ENST00000365488 107 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
CENPFP49454 MIR1262-201ENST00000408276 93 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
CENPFP49454 AC011233.1-201ENST00000422812 283 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
CENPFP49454 AC121342.1-201ENST00000423914 550 ntTSL 3 BASIC-1.31□□□□□ -2.62
CENPFP49454 AL157387.1-201ENST00000436077 335 ntTSL 2 BASIC-1.31□□□□□ -2.62
CENPFP49454 AC007327.1-201ENST00000447461 264 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
CENPFP49454 AC022364.2-201ENST00000457963 554 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
CENPFP49454 AC011979.2-201ENST00000527568 352 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
CENPFP49454 AL355816.1-201ENST00000607951 118 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
CENPFP49454 GHRLOS.1-201ENST00000610995 70 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
CENPFP49454 CYLC2-204ENST00000612124 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-1.31□□□□□ -2.62
CENPFP49454 AC098831.1-201ENST00000440661 216 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
CENPFP49454 AC098483.2-201ENST00000603158 454 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
CENPFP49454 AL034555.1-201ENST00000604816 211 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
CENPFP49454 MTND4P5-201ENST00000435821 1374 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
CENPFP49454 Y_RNA.582-201ENST00000391023 95 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
CENPFP49454 RNU2-21P-201ENST00000410368 188 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
CENPFP49454 MTCO3P17-201ENST00000443775 513 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
CENPFP49454 MTND4LP26-201ENST00000518144 282 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
CENPFP49454 AL353803.5-201ENST00000599815 141 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
CENPFP49454 AL158050.2-201ENST00000605336 568 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
CENPFP49454 ZRANB2-AS2-218ENST00000608360 722 ntTSL 5 BASIC-1.32□□□□□ -2.62
CENPFP49454 AL356596.1-201ENST00000624230 379 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
CENPFP49454 U8.15-201ENST00000390947 134 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
CENPFP49454 AC119751.3-201ENST00000399720 670 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
CENPFP49454 AL391704.1-203ENST00000414903 462 ntTSL 3 BASIC-1.32□□□□□ -2.62
CENPFP49454 MTCO1P21-201ENST00000416634 589 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
CENPFP49454 PCDH9-AS3-201ENST00000434073 479 ntTSL 2 BASIC-1.32□□□□□ -2.62
CENPFP49454 AC093850.1-201ENST00000454121 251 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
CENPFP49454 AP001981.2-201ENST00000603241 418 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
CENPFP49454 AC011458.1-201ENST00000604034 617 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
CENPFP49454 Y_RNA.263-201ENST00000364659 114 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
CENPFP49454 RNU4-56P-201ENST00000364700 142 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
CENPFP49454 RNA5SP95-201ENST00000410319 137 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
CENPFP49454 AL163973.1-201ENST00000484753 577 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
CENPFP49454 RNA5SP272-201ENST00000516095 111 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
CENPFP49454 AC125232.2-201ENST00000592457 143 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
CENPFP49454 MIR6502-201ENST00000617296 76 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
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