Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 Y_RNA.48-201ENST00000362710 103 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TMPOP42166 Y_RNA.123-201ENST00000363338 102 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TMPOP42166 SET-203ENST00000372688 801 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
TMPOP42166 MIR627-201ENST00000384979 97 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TMPOP42166 AC035139.1-201ENST00000423256 273 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
TMPOP42166 AC003989.2-201ENST00000440224 169 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TMPOP42166 AC009296.1-201ENST00000443146 155 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TMPOP42166 OSTCP8-201ENST00000445117 448 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TMPOP42166 AC099520.1-202ENST00000503650 777 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
TMPOP42166 RNU4ATAC7P-201ENST00000516280 125 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TMPOP42166 RN7SKP40-201ENST00000517211 242 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TMPOP42166 AC025871.1-202ENST00000518819 432 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
TMPOP42166 CBX3P8-201ENST00000532412 525 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TMPOP42166 LINC02253-201ENST00000559321 448 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
TMPOP42166 AC090616.3-201ENST00000582184 217 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TMPOP42166 RPS15AP11-201ENST00000594193 385 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TMPOP42166 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
TMPOP42166 SNORA43.4-201ENST00000629559 138 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TMPOP42166 AK9-203ENST00000368948 2478 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
TMPOP42166 ZBBX-201ENST00000307529 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
TMPOP42166 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
TMPOP42166 OR8K3-203ENST00000641662 2438 ntAPPRIS P1 BASIC2.49□□□□□ -2.01
TMPOP42166 AC111000.4-202ENST00000505646 2648 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
TMPOP42166 RNU6-784P-201ENST00000384330 106 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TMPOP42166 Y_RNA.533-201ENST00000384596 114 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TMPOP42166 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC2.49□□□□□ -2.01
TMPOP42166 RNA5SP390-201ENST00000410191 113 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TMPOP42166 RPL23AP95-201ENST00000426806 265 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TMPOP42166 AL445259.1-203ENST00000427828 251 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
TMPOP42166 AL442638.1-201ENST00000443359 237 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
TMPOP42166 AC124916.1-201ENST00000444020 547 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TMPOP42166 Y_RNA.639-201ENST00000458981 102 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TMPOP42166 MIR2053-201ENST00000459295 91 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TMPOP42166 RPL30P12-201ENST00000474666 353 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TMPOP42166 AC114801.2-201ENST00000503825 781 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TMPOP42166 AC010420.1-201ENST00000515077 509 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
TMPOP42166 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TMPOP42166 ZNF616-202ENST00000596290 568 ntTSL 4 BASIC2.49□□□□□ -2.01
TMPOP42166 AL080274.1-201ENST00000605565 220 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TMPOP42166 AC005014.2-201ENST00000607795 599 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TMPOP42166 HMGB1P24-202ENST00000615653 685 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TMPOP42166 NCBP1-205ENST00000629069 249 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
TMPOP42166 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
TMPOP42166 LINC00836-202ENST00000626230 1640 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
TMPOP42166 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
TMPOP42166 LINC01938-201ENST00000521341 1864 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
TMPOP42166 MTND5P10-201ENST00000603719 1809 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
TMPOP42166 Y_RNA.40-201ENST00000362645 93 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
TMPOP42166 Y_RNA.132-201ENST00000363421 102 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
TMPOP42166 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
TMPOP42166 Y_RNA.146-201ENST00000363549 102 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
TMPOP42166 RNU6-1040P-201ENST00000383974 107 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
TMPOP42166 MIR559-201ENST00000385188 96 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
TMPOP42166 BTF3L4P2-201ENST00000392798 346 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
TMPOP42166 RNU6-1245P-201ENST00000411130 106 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
TMPOP42166 AC010731.2-201ENST00000415275 440 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
TMPOP42166 AL161935.1-201ENST00000420945 421 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
TMPOP42166 EIF4EP2-201ENST00000422816 654 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
TMPOP42166 MTCO2P12-201ENST00000427426 682 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
TMPOP42166 AL138900.1-201ENST00000449345 399 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
TMPOP42166 RPL23AP70-201ENST00000483361 460 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
TMPOP42166 AC022447.4-201ENST00000504053 364 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
TMPOP42166 RNA5SP182-201ENST00000516064 82 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
TMPOP42166 MIR5696-201ENST00000578474 85 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
TMPOP42166 RNU6-91P-201ENST00000607774 107 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
TMPOP42166 AL161782.1-201ENST00000622930 586 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
TMPOP42166 MTND5P30-201ENST00000452896 1731 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
TMPOP42166 CFHR4-202ENST00000367416 2178 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
TMPOP42166 AC009541.1-201ENST00000438279 2662 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
TMPOP42166 MTND5P9-201ENST00000503854 1755 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
TMPOP42166 RNU6-1115P-201ENST00000362490 106 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
TMPOP42166 RNU6-1285P-201ENST00000363480 105 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
TMPOP42166 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
TMPOP42166 RNU6-474P-201ENST00000384243 107 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
TMPOP42166 EIF1AXP1-201ENST00000419267 435 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
TMPOP42166 AL358075.3-201ENST00000426289 226 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
TMPOP42166 AL353997.1-201ENST00000432936 108 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
TMPOP42166 AC093083.1-201ENST00000438633 347 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
TMPOP42166 RPS15AP7-201ENST00000439294 405 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
TMPOP42166 MTCYBP6-201ENST00000441810 138 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
TMPOP42166 RPL39P29-201ENST00000447779 157 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
TMPOP42166 AC012308.1-201ENST00000451232 178 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
TMPOP42166 AC116666.1-201ENST00000453915 551 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
TMPOP42166 SNRPGP7-201ENST00000469016 106 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
TMPOP42166 RNU6-1170P-201ENST00000515974 106 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
TMPOP42166 MRPS36P4-201ENST00000534436 298 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
TMPOP42166 AC008115.2-201ENST00000539988 241 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
TMPOP42166 MIR4273-201ENST00000582824 84 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
TMPOP42166 LUZP6-201ENST00000589735 177 ntAPPRIS P1 BASIC2.47□□□□□ -2.01
TMPOP42166 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
TMPOP42166 AC133104.2-201ENST00000615272 193 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
TMPOP42166 AL159153.1-201ENST00000619688 317 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
TMPOP42166 AC090971.5-201ENST00000621102 293 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
TMPOP42166 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
TMPOP42166 E2F5-208ENST00000521429 1551 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
TMPOP42166 ZNF404-202ENST00000587539 1851 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
TMPOP42166 AL109809.4-201ENST00000603520 2185 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
TMPOP42166 OR5M1-202ENST00000641076 4302 ntAPPRIS P1 BASIC2.47□□□□□ -2.01
TMPOP42166 CFH-202ENST00000367429 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
TMPOP42166 RNU6-529P-201ENST00000363383 104 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
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