Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 OR8K3-204ENST00000641689 2380 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
TRHP20396 ANKRD20A9P-201ENST00000457997 2978 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
TRHP20396 ERBIN-208ENST00000506030 4386 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
TRHP20396 SPRR2E-201ENST00000368750 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
TRHP20396 SNORD24-201ENST00000383884 75 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
TRHP20396 RNU6-629P-201ENST00000384061 103 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
TRHP20396 AC010598.1-201ENST00000510378 103 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
TRHP20396 RNA5SP20-201ENST00000515976 84 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
TRHP20396 NRDE2-210ENST00000628832 132 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
TRHP20396 SLC2A2-201ENST00000314251 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
TRHP20396 RGS4-202ENST00000367908 2606 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
TRHP20396 PLCXD3-201ENST00000328457 7538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
TRHP20396 PRRC1-201ENST00000296666 4699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
TRHP20396 ARHGEF3-203ENST00000413728 3992 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
TRHP20396 AGBL2-201ENST00000357610 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
TRHP20396 NTRK3-205ENST00000394480 19984 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
TRHP20396 CCDC30-201ENST00000340612 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
TRHP20396 PTPRD-205ENST00000397611 8242 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
TRHP20396 GRID2-208ENST00000611049 4844 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
TRHP20396 TUG1-201ENST00000519077 5673 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
TRHP20396 DOCK7-201ENST00000251157 7084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
TRHP20396 GPAM-201ENST00000348367 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
TRHP20396 RNY1P4-201ENST00000384595 115 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
TRHP20396 Y_RNA.545-201ENST00000384652 105 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
TRHP20396 RNA5SP354-201ENST00000391247 136 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
TRHP20396 AC106707.2-201ENST00000484182 374 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
TRHP20396 AC113410.1-201ENST00000505029 247 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
TRHP20396 RNA5SP497-201ENST00000516081 97 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
TRHP20396 RNU6-1270P-201ENST00000517128 108 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
TRHP20396 MIR376A2-201ENST00000636782 80 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
TRHP20396 AC004925.1-201ENST00000624256 2706 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
TRHP20396 TTBK2-201ENST00000267890 10905 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
TRHP20396 ZBED6-201ENST00000545588 7979 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
TRHP20396 EMSY-201ENST00000334736 5508 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
TRHP20396 C5orf42-201ENST00000425232 11199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
TRHP20396 TDRD1-202ENST00000369280 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
TRHP20396 ETV1-205ENST00000405192 4402 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
TRHP20396 DNAH14-208ENST00000430092 13763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
TRHP20396 RNU6-117P-201ENST00000365415 107 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
TRHP20396 RNU6-616P-201ENST00000384353 107 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
TRHP20396 Y_RNA.507-201ENST00000384500 99 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
TRHP20396 MIR325-201ENST00000385260 98 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
TRHP20396 RPL23AP46-201ENST00000438548 490 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
TRHP20396 SNORD65B-201ENST00000459126 73 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
TRHP20396 RNU7-164P-201ENST00000459221 62 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
TRHP20396 RN7SL601P-201ENST00000471221 293 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
TRHP20396 AC108752.1-201ENST00000484679 576 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
TRHP20396 RNU7-123P-201ENST00000515911 60 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
TRHP20396 SNORA31.20-201ENST00000517111 133 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
TRHP20396 CYCSP30-201ENST00000546447 172 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
TRHP20396 EIF4BP1-201ENST00000554881 351 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
TRHP20396 MIR5197-201ENST00000583721 112 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
TRHP20396 MIR4712-201ENST00000583750 82 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
TRHP20396 ST7-OT3_3.1-201ENST00000611709 115 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
TRHP20396 ZNF33B-208ENST00000613419 5843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
TRHP20396 PIGN-239ENST00000639902 4439 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
TRHP20396 PTPRC-209ENST00000442510 5164 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
TRHP20396 AGTR1-202ENST00000402260 2172 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
TRHP20396 COPB2-205ENST00000507777 3034 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
TRHP20396 WDR64-201ENST00000366552 4371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
TRHP20396 RNA5SP175-201ENST00000364275 119 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
TRHP20396 RNU6-750P-201ENST00000390946 107 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
TRHP20396 RNU6-887P-201ENST00000410660 100 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
TRHP20396 Y_RNA.705-201ENST00000516862 110 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
TRHP20396 AC107934.2-201ENST00000518653 310 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
TRHP20396 HSPE1P7-201ENST00000604681 321 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
TRHP20396 FAM107B-229ENST00000622567 3510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
TRHP20396 MBNL2-204ENST00000397601 4487 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
TRHP20396 ASXL3-201ENST00000269197 11399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
TRHP20396 AL136964.1-201ENST00000622038 2990 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
TRHP20396 N4BP2L2-202ENST00000357505 2917 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
TRHP20396 RNU6-509P-201ENST00000363519 107 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
TRHP20396 Y_RNA.360-201ENST00000365512 102 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
TRHP20396 MIR181A2-201ENST00000384863 110 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
TRHP20396 U8.17-201ENST00000391292 132 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
TRHP20396 AL035423.1-201ENST00000420331 213 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
TRHP20396 RPL35AP21-201ENST00000437667 333 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
TRHP20396 AL138900.1-201ENST00000449345 399 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
TRHP20396 AC080013.2-201ENST00000460866 323 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
TRHP20396 DGKH-206ENST00000536612 3957 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
TRHP20396 SLC39A10-201ENST00000359634 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
TRHP20396 USP26-201ENST00000370832 3642 ntAPPRIS P1 BASIC6.61□□□□□ -1.35
TRHP20396 CDK14-201ENST00000265741 4953 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
TRHP20396 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
TRHP20396 RAD17-203ENST00000345306 2789 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
TRHP20396 AC079160.1-202ENST00000508406 2795 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
TRHP20396 NADK2-203ENST00000397338 3614 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
TRHP20396 ERGIC2-212ENST00000611644 4961 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
TRHP20396 XIRP2-207ENST00000628543 12182 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
TRHP20396 SPINK5-201ENST00000256084 3535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
TRHP20396 RNU1-108P-201ENST00000362556 161 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
TRHP20396 SNORA18-201ENST00000384416 132 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
TRHP20396 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
TRHP20396 TRAJ25-201ENST00000390512 60 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
TRHP20396 RNA5SP296-201ENST00000410523 111 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
TRHP20396 AC108145.1-201ENST00000503770 153 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
TRHP20396 AC020891.1-201ENST00000558785 174 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
TRHP20396 AC013412.1-201ENST00000610687 192 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
TRHP20396 MIR8058-201ENST00000615737 89 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
TRHP20396 VCAN-201ENST00000265077 12625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
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