Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
VPREB1P12018 MIR5690-201ENST00000583739 73 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
VPREB1P12018 AC125232.2-201ENST00000592457 143 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
VPREB1P12018 SNORD11B-201ENST00000607707 90 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
VPREB1P12018 ZNF334-205ENST00000615481 3706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
VPREB1P12018 KTN1-214ENST00000554507 2057 ntTSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
VPREB1P12018 AP006437.1-201ENST00000641440 3685 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
VPREB1P12018 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
VPREB1P12018 MT-ND4L-201ENST00000361335 297 ntAPPRIS P1 BASIC1.96□□□□□ -2.1
VPREB1P12018 Y_RNA.67-201ENST00000362870 100 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
VPREB1P12018 Y_RNA.384-201ENST00000383909 102 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
VPREB1P12018 MIR586-201ENST00000385035 97 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
VPREB1P12018 RNA5SP213-201ENST00000391031 106 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
VPREB1P12018 DEFB116-201ENST00000400549 309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
VPREB1P12018 RNU6-1001P-201ENST00000411265 100 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
VPREB1P12018 LINC01870-201ENST00000427042 390 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
VPREB1P12018 MTND2P29-201ENST00000438595 412 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
VPREB1P12018 AL357134.1-201ENST00000445848 426 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
VPREB1P12018 LINC01766-201ENST00000453968 362 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
VPREB1P12018 LINC01755-201ENST00000455010 453 ntTSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
VPREB1P12018 LINC02540-201ENST00000455554 570 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
VPREB1P12018 IGKV2D-30-201ENST00000474213 395 ntAPPRIS P1 BASIC1.96□□□□□ -2.1
VPREB1P12018 AL049873.1-201ENST00000480540 376 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
VPREB1P12018 FGF7P4-201ENST00000509595 295 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
VPREB1P12018 RNU6-856P-201ENST00000516959 98 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
VPREB1P12018 AC023632.4-201ENST00000517783 191 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
VPREB1P12018 AC093023.1-201ENST00000547375 507 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
VPREB1P12018 AC090510.1-201ENST00000567456 425 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
VPREB1P12018 LINC01919-202ENST00000579506 384 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
VPREB1P12018 AC245748.3-201ENST00000588710 241 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
VPREB1P12018 AC022335.1-204ENST00000590779 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
VPREB1P12018 AC097467.3-205ENST00000597955 594 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
VPREB1P12018 CYP2C61P-201ENST00000604072 290 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
VPREB1P12018 DLEU2_6.1-201ENST00000610536 112 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
VPREB1P12018 AC013412.1-201ENST00000610687 192 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
VPREB1P12018 AL162373.1-201ENST00000620433 407 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
VPREB1P12018 AC039056.2-201ENST00000622261 511 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
VPREB1P12018 AL078596.1-201ENST00000624856 447 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
VPREB1P12018 MUM1L1-203ENST00000372552 3957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
VPREB1P12018 ZNF280C-201ENST00000370978 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
VPREB1P12018 PRKAA2-201ENST00000371244 9347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
VPREB1P12018 MUC15-202ENST00000436318 3118 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
VPREB1P12018 AC073325.2-201ENST00000339545 159 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
VPREB1P12018 CASP1-201ENST00000353247 423 ntTSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
VPREB1P12018 RNA5SP361-201ENST00000362686 118 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
VPREB1P12018 Y_RNA.58-201ENST00000362807 102 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
VPREB1P12018 Y_RNA.154-201ENST00000363624 102 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
VPREB1P12018 RNU6-280P-201ENST00000364145 104 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
VPREB1P12018 RNY3P1-201ENST00000365085 102 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
VPREB1P12018 RNY3-201ENST00000365484 102 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
VPREB1P12018 Y_RNA.364-201ENST00000365532 101 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
VPREB1P12018 RNU6-793P-201ENST00000384233 104 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
VPREB1P12018 SNORA7.4-201ENST00000384249 137 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
VPREB1P12018 SNORD15B-201ENST00000384714 146 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
VPREB1P12018 MIR490-201ENST00000384865 128 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
VPREB1P12018 MTCYBP4-201ENST00000401524 249 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
VPREB1P12018 AL356379.1-201ENST00000414105 126 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
VPREB1P12018 PSPC1-AS2-201ENST00000423023 376 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
VPREB1P12018 IGKV3D-7-201ENST00000443397 384 ntAPPRIS P1 BASIC1.95□□□□□ -2.1
VPREB1P12018 AC096638.1-201ENST00000444678 216 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
VPREB1P12018 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
VPREB1P12018 AP001486.1-201ENST00000463339 476 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
VPREB1P12018 RPL21P10-201ENST00000463521 490 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
VPREB1P12018 AC105758.1-201ENST00000506038 399 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
VPREB1P12018 AC008948.1-201ENST00000506058 325 ntTSL 2 BASIC1.95□□□□□ -2.1
VPREB1P12018 LINC01337-201ENST00000515871 440 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
VPREB1P12018 RNVU1-2-201ENST00000516326 135 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
VPREB1P12018 Y_RNA.718-201ENST00000517110 102 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
VPREB1P12018 HMSD-204ENST00000526932 162 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
VPREB1P12018 AP002884.4-201ENST00000527589 594 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
VPREB1P12018 AL035078.1-202ENST00000531627 413 ntTSL 2 BASIC1.95□□□□□ -2.1
VPREB1P12018 AK6P2-201ENST00000549020 471 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
VPREB1P12018 AL157911.1-202ENST00000554123 502 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
VPREB1P12018 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
VPREB1P12018 AC020910.1-201ENST00000599404 413 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
VPREB1P12018 MZT1P2-201ENST00000604387 248 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
VPREB1P12018 AC083806.3-201ENST00000614016 455 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
VPREB1P12018 AL359697.1-201ENST00000624879 587 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
VPREB1P12018 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
VPREB1P12018 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
VPREB1P12018 AL159152.1-201ENST00000635019 2587 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
VPREB1P12018 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
VPREB1P12018 RNU1-62P-201ENST00000362599 164 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
VPREB1P12018 Y_RNA.358-201ENST00000365491 99 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
VPREB1P12018 RNU6-975P-201ENST00000384296 105 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
VPREB1P12018 MIR554-201ENST00000384874 96 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
VPREB1P12018 SNORD67-201ENST00000390833 111 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
VPREB1P12018 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
VPREB1P12018 MIR1193-201ENST00000408109 78 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
VPREB1P12018 SNORD88.1-201ENST00000408684 91 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
VPREB1P12018 AL451074.5-201ENST00000415894 435 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
VPREB1P12018 AC007098.1-201ENST00000420122 367 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
VPREB1P12018 EIF1P2-201ENST00000428233 350 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
VPREB1P12018 AC092473.1-201ENST00000441098 221 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
VPREB1P12018 RN7SL863P-201ENST00000462370 296 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
VPREB1P12018 AC008155.2-201ENST00000464337 397 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
VPREB1P12018 AC114982.1-201ENST00000469402 321 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
VPREB1P12018 AC109925.1-201ENST00000478069 331 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
VPREB1P12018 AC008852.1-201ENST00000510198 451 ntTSL 2 BASIC1.94□□□□□ -2.1
VPREB1P12018 RNA5SP82-201ENST00000516707 92 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.8 ms