Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

Predictions only

Length 1,304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 RNU6-212P-201ENST00000362642 104 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
PTPRCP08575 RNU6-529P-201ENST00000363383 104 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
PTPRCP08575 RNU6-1141P-201ENST00000364520 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
PTPRCP08575 RNU6-596P-201ENST00000365395 98 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
PTPRCP08575 CFHR4-202ENST00000367416 2178 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
PTPRCP08575 RNU6-310P-201ENST00000384655 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
PTPRCP08575 MTCYBP4-201ENST00000401524 249 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
PTPRCP08575 Y_RNA.646-201ENST00000410980 101 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
PTPRCP08575 MTCO2P27-201ENST00000420740 428 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
PTPRCP08575 RPL23AP95-201ENST00000426806 265 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
PTPRCP08575 KCNJ6-AS1-201ENST00000435001 357 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
PTPRCP08575 AC093083.1-201ENST00000438633 347 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
PTPRCP08575 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
PTPRCP08575 Y_RNA.653-201ENST00000459091 95 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
PTPRCP08575 RPL23AP70-201ENST00000483361 460 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
PTPRCP08575 SEMA6A-AS1-204ENST00000510682 521 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
PTPRCP08575 RNU4ATAC7P-201ENST00000516280 125 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
PTPRCP08575 RN7SKP40-201ENST00000517211 242 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
PTPRCP08575 AC023442.3-201ENST00000532199 495 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
PTPRCP08575 HSPE1P4-201ENST00000550617 308 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
PTPRCP08575 ZNF616-202ENST00000596290 568 ntTSL 4 BASIC2.45□□□□□ -2.02
PTPRCP08575 AL356157.2-201ENST00000605122 111 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
PTPRCP08575 MIR6840-201ENST00000611937 71 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
PTPRCP08575 AC126177.8-201ENST00000618339 1015 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
PTPRCP08575 AL159153.1-201ENST00000619688 317 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
PTPRCP08575 MAPK10-266ENST00000641066 6555 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
PTPRCP08575 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
PTPRCP08575 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
PTPRCP08575 Z75746.1-201ENST00000440243 2080 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
PTPRCP08575 DEUP1-202ENST00000525646 1920 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
PTPRCP08575 MTND5P30-201ENST00000452896 1731 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
PTPRCP08575 MTND4P1-201ENST00000457501 1466 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
PTPRCP08575 Y_RNA.40-201ENST00000362645 93 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
PTPRCP08575 SNORD50.1-201ENST00000362987 71 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
PTPRCP08575 RNU6-1285P-201ENST00000363480 105 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
PTPRCP08575 U3.13-201ENST00000364804 214 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
PTPRCP08575 Y_RNA.419-201ENST00000384041 102 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
PTPRCP08575 RNU6-784P-201ENST00000384330 106 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
PTPRCP08575 RNU6-331P-201ENST00000384724 107 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
PTPRCP08575 AL591034.2-201ENST00000402839 359 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
PTPRCP08575 SNRPG-202ENST00000413456 398 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
PTPRCP08575 AC010731.2-201ENST00000415275 440 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
PTPRCP08575 AC097463.2-201ENST00000421074 142 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
PTPRCP08575 AF228730.4-201ENST00000421457 183 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
PTPRCP08575 SNRPG-205ENST00000449935 428 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
PTPRCP08575 MTCO3P10-201ENST00000455912 772 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
PTPRCP08575 RPL30P15-201ENST00000457129 321 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
PTPRCP08575 snoU13.15-201ENST00000459407 104 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
PTPRCP08575 RPL22P13-201ENST00000493291 347 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
PTPRCP08575 RNA5SP384-201ENST00000516615 116 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
PTPRCP08575 AC022039.1-201ENST00000527110 488 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
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PTPRCP08575 SNRPGP19-201ENST00000603826 189 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
PTPRCP08575 AL050343.2-201ENST00000607338 280 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
PTPRCP08575 AC009318.2-201ENST00000610917 651 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
PTPRCP08575 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
PTPRCP08575 ZNF644-212ENST00000621077 2056 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
PTPRCP08575 LINC01592-202ENST00000518540 2367 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
PTPRCP08575 AC073544.1-201ENST00000600110 1595 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
PTPRCP08575 OR56A5-201ENST00000340110 738 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
PTPRCP08575 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
PTPRCP08575 Y_RNA.504-201ENST00000384481 104 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
PTPRCP08575 MIR186-201ENST00000384988 86 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
PTPRCP08575 AC026355.1-201ENST00000423466 587 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
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PTPRCP08575 USMG5P1-201ENST00000425964 177 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
PTPRCP08575 AC244670.1-201ENST00000436879 112 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
PTPRCP08575 AC022445.1-201ENST00000457499 408 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
PTPRCP08575 AC005741.1-201ENST00000511094 432 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
PTPRCP08575 RNA5SP112-201ENST00000515937 99 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
PTPRCP08575 SCARNA16.2-201ENST00000516520 172 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
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PTPRCP08575 AC068992.1-202ENST00000519280 270 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
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PTPRCP08575 AL161782.1-201ENST00000622930 586 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
PTPRCP08575 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
PTPRCP08575 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
PTPRCP08575 ABCA9-AS1-203ENST00000627596 426 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
PTPRCP08575 SNORA43.4-201ENST00000629559 138 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
PTPRCP08575 MIR203B-201ENST00000636080 86 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
PTPRCP08575 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
PTPRCP08575 ST7-AS2-206ENST00000456577 1351 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
PTPRCP08575 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
PTPRCP08575 MAP4K3-205ENST00000437545 3924 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
PTPRCP08575 Y_RNA.48-201ENST00000362710 103 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PTPRCP08575 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PTPRCP08575 RNU1-57P-201ENST00000384491 166 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PTPRCP08575 Y_RNA.533-201ENST00000384596 114 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PTPRCP08575 BCL2L11-207ENST00000405953 425 ntTSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
PTPRCP08575 MIR1261-201ENST00000408659 82 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PTPRCP08575 RN7SKP61-201ENST00000410642 295 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PTPRCP08575 CYCSP48-201ENST00000417124 323 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PTPRCP08575 EIF4EP2-201ENST00000422816 654 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PTPRCP08575 AL592309.2-201ENST00000444647 607 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
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